RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
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RABGEF1-206ENST00000461017 C16orf97H3BN30 126 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 AIM2O14862 343 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 SNX3O60493 162 aa6.19□□□□□ -1.42
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RABGEF1-206ENST00000461017 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.19□□□□□ -1.42
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RABGEF1-206ENST00000461017 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 STK35Q8TDR2 534 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC38A4Q969I6 547 aa6.19□□□□□ -1.42
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RABGEF1-206ENST00000461017 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
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RABGEF1-206ENST00000461017 AQP7P3A6NL99 342 aa6.18□□□□□ -1.42
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RABGEF1-206ENST00000461017 A8MVM7 634 aa6.18□□□□□ -1.42
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RABGEF1-206ENST00000461017 IDUAP35475 653 aa6.18□□□□□ -1.42
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.18□□□□□ -1.42
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RABGEF1-206ENST00000461017 CREB3L2Q70SY1 520 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
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RABGEF1-206ENST00000461017 GALNT5Q7Z7M9 940 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 EPHX4Q8IUS5 362 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 OR8J3Q8NGG0 315 aa6.18□□□□□ -1.42
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