RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 DMTNQ08495 405 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 CYP51A1Q16850 503 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 NCMAPQ5T1S8 102 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 ZIC4Q8N9L1 334 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 WFDC11Q8NEX6 87 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 PRR14Q9BWN1 585 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 NGBQ9NPG2 151 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 ASB6Q9NWX5 421 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 TLN2Q9Y4G6 2542 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 A0A1B0GWA3 101 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 SERPINB7O75635 380 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 GUCY1A3Q02108 690 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 PPA1Q15181 289 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 TIMM23BQ5SRD1 257 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 ARMC8Q8IUR7 673 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 IGFBPL1Q8WX77 278 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM45BQ96B21 275 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 WFDC6Q9BQY6 131 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 PTDSS2Q9BVG9 487 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 C12orf10Q9HB07 376 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 PARPBPQ9NWS1 579 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 OR5H1A6NKK0 313 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 FTCDNL1E5RQL4 147 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 PDLIM1O00151 329 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 HS3ST1O14792 307 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 RAD51DO75771 328 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 MFN2O95140 757 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 AHSA1O95433 338 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 VIMP08670 466 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 ARFIP2P53365 341 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 RBBP4Q09028 425 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 FAPQ12884 760 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 ELOA3BQ3SY89 546 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 GPAT4Q86UL3 456 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 P2RY8Q86VZ1 359 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 ELOA3Q8NG57 546 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 OR52E4Q8NGH9 312 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 TRIM2Q9C040 744 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 TAS2R16Q9NYV7 291 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 RNF115Q9Y4L5 304 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 SMPD2O60906 423 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 ITGA5P08648 1049 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 BSPH1Q075Z2 132 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 MFSD8Q8NHS3 518 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 MUCL1Q96DR8 90 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 PIF1Q9H611 641 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC134Q9H6E4 229 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 SAR1AQ9NR31 198 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 SLC7A10Q9NS82 523 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 DPRXA6NFQ7 191 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 CCT8L1PA6NM43 557 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 TPST2O60704 377 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 FZD7O75084 574 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 CD3EP07766 207 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 RPS5P46782 204 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 TSPO2Q5TGU0 170 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM225Q6GV28 225 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 SMYD1Q8NB12 490 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP20.84■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 DLL4Q9NR61 685 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 NPAP1Q9NZP6 1156 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 CIB4A0PJX0 185 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 CLOCKO15516 846 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 VAMP5O95183 116 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 KLF10Q13118 480 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 HSP90B2PQ58FF3 399 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 ALG10BQ5I7T1 473 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 ADAM5Q6NVV9 412 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 SSX8Q7RTT4 187 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF611Q8N823 705 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 OR10A6Q8NH74 314 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 SLC25A36Q96CQ1 311 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 MRGBPQ9NV56 204 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 SLC13A4Q9UKG4 626 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXB3-202ENST00000460160 FXYD1O00168 92 aa20.83■□□□□ 0.92
HOXB3-202ENST00000460160 OPN1SWP03999 348 aa20.83■□□□□ 0.92
HOXB3-202ENST00000460160 PNMTP11086 282 aa20.83■□□□□ 0.92
HOXB3-202ENST00000460160 GZMMP51124 257 aa20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms