RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	PRG2	P13727	222 aa		15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	CXCR1	P25024	350 aa		15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	P2RY4	P51582	365 aa		15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	FAP	Q12884	760 aa		15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	GABRA6	Q16445	453 aa		15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	TTMP	Q5BVD1	217 aa		15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC35B4	Q969S0	331 aa		15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM45B	Q96B21	275 aa		15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	CR1	P17927	2039 aa		15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	CUBN	O60494	3623 aa		15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	15.58	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		15.58	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM247	A6NEH6	219 aa		15.58	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	AQP7P3	A6NL99	342 aa		15.58	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738		A8MVM7	634 aa		15.58	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		15.58	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	STX1B	P61266	288 aa		15.58	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	COPZ1	P61923	177 aa		15.58	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CEACAM7	Q14002	265 aa		15.58	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	15.58	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		15.58	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CASP12	Q6UXS9	341 aa		15.58	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	SERPINA11	Q86U17	422 aa		15.58	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	DTX2	Q86UW9	622 aa		15.58	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CADM2	Q8N3J6	435 aa		15.58	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM99	Q8N816	258 aa		15.58	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		15.58	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	MAL2	Q969L2	176 aa		15.58	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	C3orf49	Q96BT1	292 aa		15.58	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	PIF1	Q9H611	641 aa		15.58	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		15.58	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		15.58	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		15.58	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		15.57	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1W2PP18	115 aa		15.57	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CIB4	A0PJX0	185 aa		15.57	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ABCD4	O14678	606 aa		15.57	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	FRS3	O43559	492 aa		15.57	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CD5L	O43866	347 aa		15.57	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	AKR7A3	O95154	331 aa		15.57	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	BNIP2	Q12982	314 aa		15.57	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	OR7A5	Q15622	319 aa		15.57	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		15.57	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		15.57	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		15.57	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	C10orf111	Q8N326	155 aa		15.57	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		15.57	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	15.57	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		15.57	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	OR52N5	Q8NH56	324 aa		15.57	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	BBS10	Q8TAM1	723 aa		15.57	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	SPDL1	Q96EA4	605 aa		15.57	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	RADIL	Q96JH8	1075 aa		15.57	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		15.57	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		15.57	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		15.57	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		15.57	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	15.57	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		15.57	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		15.56	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CD8A	P01732	235 aa		15.56	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ARAF	P10398	606 aa		15.56	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ETS2	P15036	469 aa		15.56	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	15.56	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	WDR31	Q8NA23	367 aa		15.56	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	STK35	Q8TDR2	534 aa		15.56	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	BOD1	Q96IK1	185 aa		15.56	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	15.56	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	15.56	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	VAPA	Q9P0L0	249 aa		15.56	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	UPB1	Q9UBR1	384 aa		15.56	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	FZD7	O75084	574 aa		15.55	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	15.55	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	PTAFR	P25105	342 aa		15.55	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CD40	P25942	277 aa		15.55	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	PRKAR1B	P31321	381 aa		15.55	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CDKN1A	P38936	164 aa		15.55	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP4B	P51164	291 aa		15.55	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	AQP5	P55064	265 aa		15.55	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CDH11	P55287	796 aa		15.55	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	EGR4	Q05215	589 aa		15.55	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		15.55	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		15.55	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		15.55	■□□□□ 0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		15.55	■□□□□ 0.08

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms