RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429174.6

DYSF-211, Transcript of dysferlin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene DYSF, Length 6,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSF-211ENST00000429174 KIF25Q9UIL4 384 aa14.6□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa14.6□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 TMEM72A0PK05 275 aa14.6□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 OR1D4P47884 311 aa14.6□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 IRF4Q15306 451 aa14.6□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 MUL1Q969V5 352 aa14.6□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 SELENOIQ9C0D9 397 aa14.6□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa14.6□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 METTL15A6NJ78 407 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 AGAP14A8MT82 685 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 CLDN1O95832 211 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 CDONQ4KMG0 1287 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 IL34Q6ZMJ4 242 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 P2RX6O15547 441 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 SUSD5O60279 629 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 MTCP1P56278 107 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 CHTF18Q8WVB6 975 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 ST8SIA2Q92186 375 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 FCRL1Q96LA6 429 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 OR11A1Q9GZK7 315 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 G3V3Y1 287 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 TK1P04183 234 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 CLDN17P56750 224 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 SLC36A2Q495M3 483 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 SLC35F3Q8IY50 421 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 PPP1R35Q8TAP8 253 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 C2CD4CQ8TF44 421 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 FAM3CQ92520 227 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 UBXN10Q96LJ8 280 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 UHRF2Q96PU4 802 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 SLC6A20Q9NP91 592 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 CDHR4A6H8M9 788 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 CEBPBP17676 345 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 CPOXP36551 454 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 ATP1B3P54709 279 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 ZNF33BQ06732 778 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 LACC1Q8IV20 430 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 LINC00346Q8IVM7 164 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 FN3KRPQ9HA64 309 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 OR6C76A6NM76 312 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 PTHP01270 115 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 C7orf72A4D263 438 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 PTGESO14684 152 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 GPR137BO60478 399 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 C1orf105O95561 183 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 IGHG1P01857 330 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 ZNF91Q05481 1191 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 STEAP3Q658P3 488 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 PRSS45Q7RTY3 260 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 SLC2A11Q9BYW1 496 aa14.59□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 NUDT1P36639 197 aa14.58□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 ADIRFQ15847 76 aa14.58□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 CYS1Q717R9 158 aa14.58□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 CBLL1Q75N03 491 aa14.58□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 SMIM15Q7Z3B0 74 aa14.58□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 FRMD1Q8N878 549 aa14.58□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa14.58□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 ULBP2Q9BZM5 246 aa14.58□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 METTL9Q9H1A3 318 aa14.58□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 MAKP20794 623 aa14.58□□□□□ -0.08
DYSF-211ENST00000429174 P2RX1P51575 399 aa14.58□□□□□ -0.08
DYSF-211ENST00000429174 P2RX3P56373 397 aa14.58□□□□□ -0.08
DYSF-211ENST00000429174 TAS2R46P59540 309 aa14.58□□□□□ -0.08
DYSF-211ENST00000429174 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
DYSF-211ENST00000429174 LTB4RQ15722 352 aa14.58□□□□□ -0.08
DYSF-211ENST00000429174 SLC5A12Q1EHB4 618 aa14.58□□□□□ -0.08
DYSF-211ENST00000429174 PRAMEF20Q5VT98 475 aa14.58□□□□□ -0.08
DYSF-211ENST00000429174 WBP2NLQ6ICG8 309 aa14.58□□□□□ -0.08
DYSF-211ENST00000429174 PXT1Q8NFP0 134 aa14.58□□□□□ -0.08
DYSF-211ENST00000429174 RHBDD1Q8TEB9 315 aa14.58□□□□□ -0.08
DYSF-211ENST00000429174 POFUT1Q9H488 388 aa14.58□□□□□ -0.08
DYSF-211ENST00000429174 NOX4Q9NPH5 578 aa14.58□□□□□ -0.08
DYSF-211ENST00000429174 C1orf123Q9NWV4 160 aa14.58□□□□□ -0.08
DYSF-211ENST00000429174 ZFP92A6NM28 416 aa14.58□□□□□ -0.08
DYSF-211ENST00000429174 UGDHO60701 494 aa14.58□□□□□ -0.08
DYSF-211ENST00000429174 CSO75390 466 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
DYSF-211ENST00000429174 ARHGEF15O94989 841 aa14.58□□□□□ -0.08
DYSF-211ENST00000429174 HLA-DOBP13765 273 aa14.58□□□□□ -0.08
DYSF-211ENST00000429174 PKLRP30613 574 aa14.58□□□□□ -0.08
DYSF-211ENST00000429174 CDKN3Q16667 212 aa14.58□□□□□ -0.08
DYSF-211ENST00000429174 KATNB1Q9BVA0 655 aa14.58□□□□□ -0.08
DYSF-211ENST00000429174 MTCH1Q9NZJ7 389 aa14.58□□□□□ -0.08
DYSF-211ENST00000429174 ADAMTS4O75173 837 aa14.58□□□□□ -0.08
DYSF-211ENST00000429174 PFKMP08237 780 aa14.58□□□□□ -0.08
DYSF-211ENST00000429174 RD3LP0DJH9 198 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms