RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 MANSC1Q9H8J5 431 aa18.4■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 CUBNO60494 3623 aa18.4■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0G2JPF8 293 aa18.39■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PR80 420 aa18.39■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 A8MVM7 634 aa18.39■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa18.39■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa18.39■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 KLF11O14901 512 aa18.39■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 VAMP5O95183 116 aa18.39■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 ANP32DO95626 131 aa18.39■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 GKN3PP0CG01 181 aa18.39■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa18.39■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 SLC25A3Q00325 362 aa18.39■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 OR7A5Q15622 319 aa18.39■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa18.39■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa18.39■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa18.39■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 MAVSQ7Z434 540 aa18.39■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM99Q8N816 258 aa18.39■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 OR10H5Q8NGA6 315 aa18.39■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 ARMC7Q9H6L4 198 aa18.39■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 FKRPQ9H9S5 495 aa18.39■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 IFT52Q9Y366 437 aa18.39■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 PLCE1Q9P212 2302 aa18.38■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 A0A096LNT2 108 aa18.38■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 FAM234BA2RU67 622 aa18.38■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 FRS3O43559 492 aa18.38■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 SSX4O60224 188 aa18.38■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 NPIPB7O75200 414 aa18.38■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 AKR7A3O95154 331 aa18.38■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 PAX7P23759 505 aa18.38■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 P2RY4P51582 365 aa18.38■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 NUDT6P53370 316 aa18.38■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 MGARPQ8TDB4 240 aa18.38■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM19Q96HH6 336 aa18.38■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 MDFIQ99750 246 aa18.38■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 RHNO1Q9BSD3 238 aa18.38■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 SPATA9Q9BWV2 254 aa18.38■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 TAPBPLQ9BX59 468 aa18.38■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 OBP2BQ9NPH6 170 aa18.38■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa18.38■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 CHST2Q9Y4C5 530 aa18.38■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM247A6NEH6 219 aa18.37■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM229AB2RXF0 380 aa18.37■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 UBDO15205 165 aa18.37■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 WNT11O96014 354 aa18.37■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 BMP2P12643 396 aa18.37■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 FABP6P51161 128 aa18.37■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 PRPS1P60891 318 aa18.37■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 CLEC2AQ6UVW9 174 aa18.37■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 AAED1Q7RTV5 226 aa18.37■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 CADM2Q8N3J6 435 aa18.37■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 STK35Q8TDR2 534 aa18.37■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 VPS33AQ96AX1 596 aa18.37■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 C3orf49Q96BT1 292 aa18.37■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 TLCD1Q96CP7 247 aa18.37■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 BCL2L10Q9HD36 194 aa18.37■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF232Q9UNY5 417 aa18.37■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa18.36■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 OR6C65A6NJZ3 312 aa18.36■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 FZD7O75084 574 aa18.36■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 BMP4P12644 408 aa18.36■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 PTNP21246 168 aa18.36■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 FADDQ13158 208 aa18.36■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 RAB35Q15286 201 aa18.36■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 ELOA3BQ3SY89 546 aa18.36■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 GTDC1Q4AE62 458 aa18.36■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 C9orf135Q5VTT2 229 aa18.36■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 C1orf140Q5VVS0 124 aa18.36■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM225Q6GV28 225 aa18.36■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 KLHL24Q6TFL4 600 aa18.36■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 GPAT4Q86UL3 456 aa18.36■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 MIER2Q8N344 545 aa18.36■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 CLIP4Q8N3C7 705 aa18.36■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 ELOA3Q8NG57 546 aa18.36■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 OR9I1Q8NGQ6 314 aa18.36■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 GTF2H4Q92759 462 aa18.36■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB9Q96C00 473 aa18.36■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 OR52B2Q96RD2 323 aa18.36■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 RAD21L1Q9H4I0 556 aa18.36■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 A4GALTQ9NPC4 353 aa18.36■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 RASD1Q9Y272 281 aa18.36■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 PRG2P13727 222 aa18.35■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 BNIP2Q12982 314 aa18.35■□□□□ 0.53
LIMS1-208ENST00000428064 RGNQ15493 299 aa18.35■□□□□ 0.53
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