RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 TGFBR3Q03167 851 aa18.27■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 DMTNQ08495 405 aa18.27■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 CEACAM7Q14002 265 aa18.27■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa18.27■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa18.27■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 SLC22A25Q6T423 547 aa18.27■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 B3GLCTQ6Y288 498 aa18.27■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM99Q8N816 258 aa18.27■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 OR9K2Q8NGE7 335 aa18.27■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 GTF2H4Q92759 462 aa18.27■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 SLC35B4Q969S0 331 aa18.27■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 SPATA9Q9BWV2 254 aa18.27■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 TMBIM4Q9HC24 238 aa18.27■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 CBLN4Q9NTU7 201 aa18.27■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 UPB1Q9UBR1 384 aa18.27■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 SONP18583 2426 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 A0A096LPI6 279 aa18.26■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 A8MVM7 634 aa18.26■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM229AB2RXF0 380 aa18.26■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 FRS3O43559 492 aa18.26■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 AKR7A3O95154 331 aa18.26■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 BMP2P12643 396 aa18.26■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 PRG2P13727 222 aa18.26■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 COPZ1P61923 177 aa18.26■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 SLC25A3Q00325 362 aa18.26■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 OR7A5Q15622 319 aa18.26■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF544Q6NX49 715 aa18.26■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 MIER2Q8N344 545 aa18.26■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 CLIP4Q8N3C7 705 aa18.26■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 POMGNT2Q8NAT1 580 aa18.26■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa18.26■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 C3orf49Q96BT1 292 aa18.26■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 CACNG6Q9BXT2 260 aa18.26■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 BCL2L10Q9HD36 194 aa18.26■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 FAM234BA2RU67 622 aa18.25■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 M0R1B8 84 aa18.25■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 CRLF1O75462 422 aa18.25■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 VAMP5O95183 116 aa18.25■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 FADDQ13158 208 aa18.25■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 C6orf10Q5SRN2 563 aa18.25■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 MUC15Q8N387 334 aa18.25■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 CADM2Q8N3J6 435 aa18.25■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 ARMC7Q9H6L4 198 aa18.25■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 A4GALTQ9NPC4 353 aa18.25■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 POU2F3Q9UKI9 436 aa18.25■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 ADAM21Q9UKJ8 722 aa18.25■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF232Q9UNY5 417 aa18.25■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 IFT52Q9Y366 437 aa18.25■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa18.25■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 ABCA1O95477 2261 aa18.24■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM247A6NEH6 219 aa18.24■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 FZD7O75084 574 aa18.24■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 BNIP2Q12982 314 aa18.24■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 RGNQ15493 299 aa18.24■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 C9orf135Q5VTT2 229 aa18.24■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 C1orf140Q5VVS0 124 aa18.24■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 EPGNQ6UW88 154 aa18.24■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 AAED1Q7RTV5 226 aa18.24■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 SERPINA11Q86U17 422 aa18.24■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 FBXL14Q8N1E6 418 aa18.24■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 DEPDC4Q8N2C3 294 aa18.24■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 STK35Q8TDR2 534 aa18.24■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 TAPBPLQ9BX59 468 aa18.24■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 RAD21L1Q9H4I0 556 aa18.24■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 USH1CQ9Y6N9 552 aa18.24■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 A0A096LNT2 108 aa18.23■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 H7C417 338 aa18.23■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 NUDT7P0C024 238 aa18.23■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 PTNP21246 168 aa18.23■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 GPAT4Q86UL3 456 aa18.23■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 OR10H5Q8NGA6 315 aa18.23■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 BBS10Q8TAM1 723 aa18.23■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 C7orf26Q96N11 449 aa18.23■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 OBP2BQ9NPH6 170 aa18.23■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 ADPRHL2Q9NX46 363 aa18.23■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 FTCDNL1E5RQL4 147 aa18.22■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 CLIC1O00299 241 aa18.22■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 CD5LO43866 347 aa18.22■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 SSX4O60224 188 aa18.22■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 ERLIN1O75477 346 aa18.22■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 WNT11O96014 354 aa18.22■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 FABP6P51161 128 aa18.22■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 NUDT6P53370 316 aa18.22■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 PRPS1P60891 318 aa18.22■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF311Q5JNZ3 666 aa18.22■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 LRIF1Q5T3J3 769 aa18.22■□□□□ 0.51
UBXN4-204ENST00000426921 SLC2A7Q6PXP3 512 aa18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms