RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426248.7

PKP4-205, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PKP4, Length 4,134 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-205ENST00000426248 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 FAM27D1Q5T7N8 215 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 NHLRC1Q6VVB1 395 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 Q6ZTK2 550 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 OR2A1Q8NGT9 310 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 ABHD1Q96SE0 405 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 ACER3Q9NUN7 267 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 ENPP4Q9Y6X5 453 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 GOSR2O14653 212 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 F12P00748 615 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 IGHV4-34P06331 123 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 GPX2P18283 190 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 S100PP25815 95 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 GZMMP51124 257 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 OR10A3P58181 314 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 MAP4K2Q12851 820 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 SLC27A4Q6P1M0 643 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 QSOX2Q6ZRP7 698 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 IQCHQ86VS3 1027 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 CSNK1A1LQ8N752 337 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 OR51G2Q8NGK0 314 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 OR52N1Q8NH53 320 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 GUCD1Q96NT3 240 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 ZNF251Q9BRH9 671 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 TGIF2Q9GZN2 237 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 LRIT1Q9P2V4 623 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 UGT2B7P16662 529 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 NDUFAF6Q330K2 333 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 C4orf46Q504U0 113 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 TBC1D20Q96BZ9 403 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 TMEM231Q9H6L2 316 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 IGF2P01344 180 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 BCHEP06276 602 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 ANKRD34CP0C6C1 535 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 ACHEP22303 614 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 ACVR1BP36896 505 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 CD79BP40259 229 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 RAD52P43351 418 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 PITPNAQ00169 270 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 SORDQ00796 357 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 ZP2Q05996 745 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 KIR2DS3Q14952 304 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 METTL11BQ5VVY1 283 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 NKAIN2Q5VXU1 208 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 OR10H4Q8NGA5 316 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 ACOT12Q8WYK0 555 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 PRR14Q9BWN1 585 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 PINK1Q9BXM7 581 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 SEC14L3Q9UDX4 400 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 TUBAL3A6NHL2 446 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 ZNF879B4DU55 563 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 CASC3O15234 703 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 YY2O15391 372 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 CD63P08962 238 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 FZD2Q14332 565 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 TRAM2Q15035 370 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 SEC23BQ15437 767 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 ABHD13Q7L211 337 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 CEACAM19Q7Z692 300 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 MMP21Q8N119 569 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 VOPP1Q96AW1 172 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 MYLKQ15746 1914 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 SULT1C2O00338 296 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 NUDT14O95848 222 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 CRYBA1P05813 215 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 SSX2Q16385 188 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 H3F3CQ6NXT2 135 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 SMARCD3Q6STE5 483 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 OR5M3Q8NGP4 307 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 REG4Q9BYZ8 158 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 NTMQ9P121 344 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 C7orf66A4D0T2 115 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 PIPP12273 146 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 FPR3P25089 353 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 BCL6P41182 706 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 ACOT4Q8N9L9 421 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP4-205ENST00000426248 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms