RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 ASB12Q8WXK4 309 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RFKQ969G6 155 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PCBD2Q9H0N5 130 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 DIABLOQ9NR28 239 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MTFP1Q9UDX5 166 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 WDFY4Q6ZS81 3184 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 IGLON5A6NGN9 336 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC22A31A6NKX4 558 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ALOX5APP20292 161 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 KIR3DL2P43630 455 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SRP54P61011 504 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TEX30Q5JUR7 227 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ARL14Q8N4G2 192 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TTC16Q8NEE8 873 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 DNAAF1Q8NEP3 725 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5W2Q8NH69 310 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR1S1Q8NH92 325 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM174AQ8TBP5 190 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SMARCD2Q92925 531 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SEMA4CQ9C0C4 833 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SEMA6CQ9H3T2 930 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 AHSPQ9NZD4 102 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC5A6Q9Y289 635 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 FANCMQ8IYD8 2048 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PPL8 197 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 POM121BA6NF01 834 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 DBX1A6NMT0 343 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 C17orf51A8MQB3 221 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 H0YC42 278 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR1F1O43749 312 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 REM1O75628 298 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CD74P04233 296 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 IL5P05113 134 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SPI1P17947 270 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 HCCSP53701 268 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 NOGQ13253 232 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC9A5Q14940 896 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 IRF4Q15306 451 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PYDC2Q56P42 97 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 C10orf91Q5T1B1 145 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC17Q8N6Y2 441 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 NUP43Q8NFH3 380 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4D10Q8NGI6 311 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB7BQ96AH8 199 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ELSPBP1Q96BH3 223 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 UCKL1Q9NWZ5 548 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ACSL5Q9ULC5 683 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GXYLT2A0PJZ3 443 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 HMSDA8MTL9 139 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GNRH1P01148 92 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ADH1AP07327 375 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RPS2P15880 293 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 FUT7Q11130 342 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR1Q1Q15612 314 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 COL28A1Q2UY09 1125 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 HFEQ30201 348 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF613Q6PF04 617 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 LRFN4Q6PJG9 635 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ASB18Q6ZVZ8 466 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GID4Q8IVV7 300 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 EID2Q8N6I1 236 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CCL4L1Q8NHW4 92 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PIGXQ8TBF5 258 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 HERVK_113Q902F9 699 aa3.3□□□□□ -1.88
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PGGT1B-203ENST00000419445 STACQ99469 402 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GABRG3Q99928 467 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 FOXJ3Q9UPW0 622 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RCE1Q9Y256 329 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR1A2Q9Y585 309 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GLSO94925 669 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 IL2RAP01589 272 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GYPBP06028 91 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF17P17021 662 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 QRFPP83859 136 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CBFBQ13951 182 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD16Q6P6B7 361 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
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