RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF333Q96JL9 665 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PBKQ96KB5 322 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 AMDHD1Q96NU7 426 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ACCSQ96QU6 501 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NDUFAF3Q9BU61 184 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ALG8Q9BVK2 526 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CHID1Q9BWS9 393 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GANQ9H2C0 597 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NARFLQ9H6Q4 476 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TPT1P8Q9HAU6 139 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RDH14Q9HBH5 336 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 YAE1D1Q9NRH1 226 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SLC2A8Q9NY64 477 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 UVRAGQ9P2Y5 699 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 LCMT1Q9UIC8 334 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 EMCNQ9ULC0 261 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MOB4Q9Y3A3 225 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DAPL1A0PJW8 107 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM210A6NLX4 147 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 I6L893 689 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 HSPB6O14558 160 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 HUS1O60921 280 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MT-CO3P00414 261 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 LCKP06239 509 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SBK2P0C263 348 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CALCBP10092 127 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FCGR1AP12314 374 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CYP2B6P20813 491 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CBLP22681 906 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DNASE1L1P49184 302 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SERPINB8P50452 374 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NUP107P57740 925 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SORDQ00796 357 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SLC3A1Q07837 685 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TFDP2Q14188 446 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 HERC3Q15034 1050 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GPR33Q49SQ1 333 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 IFI44LQ53G44 452 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SFT2D3Q587I9 215 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DCST2Q5T1A1 773 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DNM1P46Q6ZS02 220 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SERPINA11Q86U17 422 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 AMIGO1Q86WK6 493 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RCOR2Q8IZ40 523 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PYROXD2Q8N2H3 581 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 LINC00301Q8NCQ3 95 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM35BQ8NCS4 154 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 OR2L8Q8NGY9 312 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 OR5R1Q8NH85 324 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ASB10Q8WXI3 467 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM190Q8WZ59 177 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SEMA4DQ92854 862 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RAB37Q96AX2 223 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM19Q96HH6 336 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DIRAS2Q96HU8 199 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TSSK3Q96PN8 268 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MRIQ9BWK5 157 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ROGDIQ9GZN7 287 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SLC52A3Q9NQ40 469 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 UFSP2Q9NUQ7 469 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RHBDL2Q9NX52 303 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SLC17A6Q9P2U8 582 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TINAGQ9UJW2 476 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 IKZF2Q9UKS7 526 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 STAP1Q9ULZ2 295 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RPH3ALQ9UNE2 315 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CLEC18AA5D8T8 446 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 H3BQ06 376 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZBTB5O15062 677 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RAD51CO43502 376 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SCO2O43819 266 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ENTPD5O75356 428 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 BANF1O75531 89 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RPS6KA5O75582 802 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 UGT2B17O75795 530 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FGF2P09038 288 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 THRAP10827 490 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RAB3BP20337 219 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 BMP5P22003 454 aa2.24□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FPR3P25089 353 aa2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.7 ms