RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362957.1

RNU6-1290P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1290, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1290P, Length 109 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LHX4Q969G2 390 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FAM46BQ96A09 425 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1290P-201ENST00000362957 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TMEM80Q96HE8 168 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FCRL1Q96LA6 429 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR4F4Q96R69 305 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RAB17Q9H0T7 212 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TMEM161AQ9NX61 479 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1290P-201ENST00000362957 C21orf62Q9NYP8 219 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PLEK2Q9NYT0 353 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TBC1D7Q9P0N9 293 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FETUBQ9UGM5 382 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 A6NIZ1 184 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TMEM150CB9EJG8 249 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TRIM77I1YAP6 450 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PEX7O00628 323 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC7A4O43246 635 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LHBP01229 141 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC35G6P0C7Q6 338 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ZNF708P17019 499 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SPRR2DP22532 72 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ME2P23368 584 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OMGP23515 440 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MPV17P39210 176 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MAGEA5P43359 124 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NPY4RP50391 375 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RAP1BP61224 184 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RPS6P62753 249 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RPS15P62841 145 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 BNIP1Q12981 228 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 KIAA0087Q14695 138 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PSMD6Q15008 389 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TPRXLQ17RH7 258 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LRIT3Q3SXY7 679 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SP6Q3SY56 376 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DUSP28Q4G0W2 176 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC39A12Q504Y0 691 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MPPE1Q53F39 396 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SPINK9Q5DT21 86 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 C1orf100Q5SVJ3 147 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 C6orf163Q5TEZ5 329 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 KLHL10Q6JEL2 608 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC30A6Q6NXT4 461 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 C10orf99Q6UWK7 81 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MIER3Q7Z3K6 550 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ITIH5Q86UX2 942 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PAQR7Q86WK9 346 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 WDFY1Q8IWB7 410 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 THNSL1Q8IYQ7 743 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LINC00518Q8N0U6 118 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ZIC4Q8N9L1 334 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR4D9Q8NGE8 314 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR10D4PQ8NGN7 298 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR5C1Q8NGR4 320 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR9A4Q8NGU2 314 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RORBQ92753 470 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ZUFSPQ96AP4 578 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TM4SF19Q96DZ7 209 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PGLYRP4Q96LB8 373 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DNAJC30Q96LL9 226 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 C12orf42Q96LP6 360 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ZNF488Q96MN9 340 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 INPP5KQ9BT40 448 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ISCA1Q9BUE6 129 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CACNG6Q9BXT2 260 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NFKBIZQ9BYH8 718 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 VCPKMTQ9H867 229 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TREX1Q9NSU2 369 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LUZP4Q9P127 313 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC23A2Q9UGH3 650 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 KIF25Q9UIL4 384 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 KCNK6Q9Y257 313 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CCL26Q9Y258 94 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms