RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 RACGAP1Q9H0H5 632 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SPAG4Q9NPE6 437 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 UFSP2Q9NUQ7 469 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ENOPH1Q9UHY7 261 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 U3KQA8 63 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TRAPPC13A5PLN9 417 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 M0R3H8 397 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SPRY3O43610 288 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 DIRAS1O95057 198 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 RPP14O95059 124 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 KCNK2O95069 426 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CST1P01037 141 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TGFAP01135 160 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 GRPRP30550 384 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SLC6A6P31641 620 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CD79BP40259 229 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 GIPRP48546 466 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 INPP1P49441 399 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SNU13P55769 128 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 MELKQ14680 651 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 GTDC1Q4AE62 458 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ALG10Q5BKT4 473 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TUSC5Q8IXB3 177 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 GPR119Q8TDV5 335 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 MRGPRX4Q96LA9 322 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 BDH2Q9BUT1 245 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 PLK3Q9H4B4 646 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 INIPQ9NRY2 104 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM5Q9Y2B1 443 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 RNF115Q9Y4L5 304 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 PLXNA2O75051 1894 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 MED13Q9UHV7 2174 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD61A6NGH8 418 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 FAM171A2A8MVW0 826 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SEMA7AO75326 666 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TNFRSF21O75509 655 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 RECKO95980 971 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 YES1P07947 543 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 H2BFMP0C1H6 154 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 GSTM3P21266 225 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 FASP25445 335 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 GALNSP34059 522 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CA7P43166 264 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 DAP3P51398 398 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TEKQ02763 1124 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TSTQ16762 297 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF718Q3SXZ3 478 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ZMAT1Q5H9K5 638 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 C1orf140Q5VVS0 124 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC80Q76M96 950 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 OR5AS1Q8N127 324 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM99Q8N816 258 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SCCPDHQ8NBX0 429 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF540Q8NDQ6 660 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 RAB1CQ92928 201 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SLC30A2Q9BRI3 323 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 MESP1Q9BRJ9 268 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TGIF2Q9GZN2 237 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SHARPINQ9H0F6 387 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 Q9H521 79 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CXorf36Q9H7Y0 433 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 DUSP22Q9NRW4 184 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 USP22Q9UPT9 525 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 HRH3Q9Y5N1 445 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SCN8AQ9UQD0 1980 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 BAHCC1Q9P281 2608 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PQ09 198 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 UPK1AO00322 258 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 MSTNO14793 375 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 PLOD3O60568 738 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CYC1P08574 325 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CELA3AP09093 270 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CLUP10909 449 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 MYL12AP19105 171 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 RELAQ04206 551 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SPRED3Q2MJR0 410 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CEACAM16Q2WEN9 425 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 HFEQ30201 348 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM205Q6UW68 189 aa4.01□□□□□ -1.77
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