RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 H7BYZ3 331 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 OR4D1Q15615 310 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM183BQ1AE95 376 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 FAM74A1Q5RGS3 127 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 KDM4DQ6B0I6 523 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 SLC35F2Q8IXU6 374 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 COMMD1Q8N668 190 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 CREB3L4Q8TEY5 395 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 C16orf78Q8WTQ4 265 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 MAL2Q969L2 176 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 PRAP1Q96NZ9 151 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 MBOAT4Q96T53 435 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 LMAN1LQ9HAT1 526 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 RHOFQ9HBH0 211 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 GPX5O75715 221 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 SFTA3P0C7M3 94 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 IQCF3P0C7M6 154 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 SERPINA2P20848 420 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 PCK2Q16822 640 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF695Q8IW36 515 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 LGALS14Q8TCE9 139 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 SFXN5Q8TD22 340 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 BMFQ96LC9 184 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 PDLIM7Q9NR12 457 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 TP53I11O14683 189 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 UGDHO60701 494 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 F3P13726 295 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 HSD11B2P80365 405 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF266Q14584 549 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 OR2T4Q8NH00 348 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 DYRK2Q92630 601 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 CABLES2Q9BTV7 478 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 SERTAD4Q9NUC0 356 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 C1orf226A1L170 272 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 OR6C76A6NM76 312 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 B4DGG1 531 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 PIPP12273 146 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 JAG1P78504 1218 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 RABEPKQ7Z6M1 372 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 CRYGNQ8WXF5 182 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRO-201ENST00000281171 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 SGK494L7N484 410 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 BDKRB1P46663 353 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 EVX1P49640 407 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 CDKN2DP55273 166 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 FOXO1Q12778 655 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 AARDQ4LEZ3 155 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 LYPD8Q6UX82 237 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 OR52B6Q8NGF0 335 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 WWTR1Q9GZV5 400 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 BET1LQ9NYM9 111 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 HOXC13P31276 330 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 RIDAP52758 137 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 KIAA0319Q5VV43 1072 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM65Q6PI78 240 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 CD300LGQ6UXG3 332 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 OR9K2Q8NGE7 335 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 OR13C9Q8NGT0 318 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 FIBINQ8TAL6 211 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 RASD2Q96D21 266 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 MRGPRX2Q96LB1 330 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 NPIPA5E9PKD4 350 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 GPRIN2O60269 458 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 GPR137BO60478 399 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 SPP1P10451 314 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 TGFBR1P36897 503 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF74Q16587 644 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 CLECL1Q8IZS7 167 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 NAGSQ8N159 534 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF75AQ96N20 296 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 NPIPA1Q9UND3 350 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 ANHXE9PGG2 379 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 PTP4A3O75365 173 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 JTBO76095 146 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 SLC6A9P48067 706 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 TPPP2P59282 170 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 HIST1H3AP68431 136 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 STEAP1BQ6NZ63 245 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 Q6ZRG5 221 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 SULF2Q8IWU5 870 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 OR4F15Q8NGB8 312 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 SLCO4A1Q96BD0 722 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 MED9Q9NWA0 146 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 KCTD3Q9Y597 815 aa13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms