RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243918.9

SYS1-201, Transcript of SYS1, golgi trafficking protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYS1, Length 2,862 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-201ENST00000243918 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 CXCL10P02778 98 aa11.31□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 VSIG10L2P0DP72 767 aa11.31□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 NID1P14543 1247 aa11.31□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 ZNF77Q15935 545 aa11.31□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 RPE65Q16518 533 aa11.31□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 SLC35F2Q8IXU6 374 aa11.31□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 OR5M9Q8NGP3 310 aa11.31□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 OR8D1Q8WZ84 308 aa11.31□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 NXPE3Q969Y0 559 aa11.31□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 PRSS16Q9NQE7 514 aa11.31□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa11.31□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 C2orf42Q9NWW7 574 aa11.31□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 OR5V1Q9UGF6 321 aa11.31□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 V9GY05 133 aa11.31□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 D6RAR5 112 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 SULT1B1O43704 296 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 CSRP2Q16527 193 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 TCEAL5Q5H9L2 206 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 ZNF619Q8N2I2 560 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 KCT2Q8NC54 265 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 C10orf90Q96M02 699 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 ZNF350Q9GZX5 532 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 ADAP2Q9NPF8 381 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 SPTBP11277 2137 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 OR52A4PA6NMU1 304 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 MOSPD3O75425 235 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 RLN1P04808 185 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 DBIP07108 87 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 SLC6A6P31641 620 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 ADH7P40394 386 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 MECP2P51608 486 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 KRT33BQ14525 404 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 GRM7Q14831 915 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 OR7E24Q6IFN5 339 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 LILRA6Q6PI73 481 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 MTSS1LQ765P7 747 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 LINC00518Q8N0U6 118 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 OR2L13Q8N349 312 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 ST8SIA2Q92186 375 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 HAVCR1Q96D42 359 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 SLC38A3Q99624 504 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 FKRPQ9H9S5 495 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 NCDNQ9UBB6 729 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 ANKRD61A6NGH8 418 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 PRRT4C9JH25 899 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 F5H5P2 479 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 IGF2P01344 180 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 RLN2P04090 185 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 RAB40ALP0C0E4 278 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 CISD3P0C7P0 127 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 LAG3P18627 525 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 ERVFC1P60507 584 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 IL10RAQ13651 578 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 DHCR24Q15392 516 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 DCST2Q5T1A1 773 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 DCAF12L2Q5VW00 463 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 CDH26Q8IXH8 852 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 POMGNT2Q8NAT1 580 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 TMIEQ8NEW7 156 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 OR2L3Q8NG85 312 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 RAB40AQ8WXH6 277 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 OTUB2Q96DC9 234 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 EVA1AQ9H8M9 152 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 KCNK6Q9Y257 313 aa11.3□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 GOSR2O14653 212 aa11.29□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 GPRIN2O60269 458 aa11.29□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 CBX7O95931 251 aa11.29□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 RAB3AP20336 220 aa11.29□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 TAS2R20P59543 309 aa11.29□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 UBXN2BQ14CS0 331 aa11.29□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 FIGNL1Q6PIW4 674 aa11.29□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 CACUL1Q86Y37 369 aa11.29□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 OR2L8Q8NGY9 312 aa11.29□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 ZNRF4Q8WWF5 429 aa11.29□□□□□ -0.6
SYS1-201ENST00000243918 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms