RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 EMDP50402 254 aa20.32■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 OLFML2AQ68BL7 652 aa20.32■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM65Q6PI78 240 aa20.32■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 ADGRG3Q86Y34 549 aa20.32■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 SHISA5Q8N114 240 aa20.32■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 OR51L1Q8NGJ5 315 aa20.32■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 OR2T4Q8NH00 348 aa20.32■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 DDOQ99489 341 aa20.32■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa20.32■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 GUSBP08236 651 aa20.32■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 HES5Q5TA89 166 aa20.32■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEFF1Q8IYR6 380 aa20.32■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 C7orf57Q8NEG2 295 aa20.32■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNRF4Q8WWF5 429 aa20.32■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 OR10A4Q9H209 315 aa20.32■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 TOXO94900 526 aa20.31■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 CPN1P15169 458 aa20.31■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP2CBP62714 309 aa20.31■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP2CAP67775 309 aa20.31■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 TCTE1Q5JU00 501 aa20.31■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC35D3Q5M8T2 416 aa20.31■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 FIGLAQ6QHK4 219 aa20.31■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 RBCK1Q9BYM8 510 aa20.31■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 POT1Q9NUX5 634 aa20.31■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 C2orf42Q9NWW7 574 aa20.31■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 SPACA6W5XKT8 324 aa20.31■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 MCIDASD6RGH6 385 aa20.31■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 FCARP24071 287 aa20.31■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 PSMB10P40306 273 aa20.31■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 PTH2RP49190 550 aa20.31■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 SPRED2Q7Z698 418 aa20.31■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 OR14C36Q8NHC7 312 aa20.31■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM131CQ96AQ9 280 aa20.31■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 MRI1Q9BV20 369 aa20.31■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 PIPOXQ9P0Z9 390 aa20.31■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa20.3■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 TSPAN5P62079 268 aa20.3■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 OPCMLQ14982 345 aa20.3■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 FCAMRQ8WWV6 532 aa20.3■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 CDCP1Q9H5V8 836 aa20.3■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 KIF25Q9UIL4 384 aa20.3■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa20.3■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF281Q9Y2X9 895 aa20.3■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A1W2PPL8 197 aa20.3■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 SNAPC5O75971 98 aa20.3■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 C4BPBP20851 252 aa20.3■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 AK4P27144 223 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 ULK3Q6PHR2 472 aa20.3■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 FCRLAQ7L513 359 aa20.3■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 PRSS41Q7RTY9 318 aa20.3■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 NPEPL1Q8NDH3 523 aa20.3■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 MSANTD3Q96H12 275 aa20.3■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa20.3■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 TRPV4Q9HBA0 871 aa20.3■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 FOXJ3Q9UPW0 622 aa20.3■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 SELENOFO60613 162 aa20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 CBX7O95931 251 aa20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 IFNGR1P15260 489 aa20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 MECP2P51608 486 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 APOOLQ6UXV4 268 aa20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 ORAI1Q96D31 301 aa20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 V9GY05 133 aa20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 PLSCR5A0PG75 271 aa20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 GIPP09681 153 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 RAB40ALP0C0E4 278 aa20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 MNDAP41218 407 aa20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 RAD52P43351 418 aa20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 TANGO2Q6ICL3 276 aa20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 GPAT4Q86UL3 456 aa20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF614Q8N883 585 aa20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 RAB40AQ8WXH6 277 aa20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 RSC1A1Q92681 617 aa20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 SGTBQ96EQ0 304 aa20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC25A18Q9H1K4 315 aa20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 NOX3Q9HBY0 568 aa20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 TAS2R5Q9NYW4 299 aa20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 KLK11Q9UBX7 282 aa20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 ACOD1A6NK06 481 aa20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 ARPC3O15145 178 aa20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 PRKACBP22694 351 aa20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 ISXQ2M1V0 245 aa20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF684Q5T5D7 378 aa20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 C7orf61Q8IZ16 206 aa20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 WBP1Q96G27 269 aa20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms