RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22■■□□□ 1.11
HERC3-214ENST00000601319 COL4A5P29400 1685 aa21.99■■□□□ 1.11
HERC3-214ENST00000601319 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
HERC3-214ENST00000601319 ZNF428Q96B54 188 aa21.99■■□□□ 1.11
HERC3-214ENST00000601319 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
HERC3-214ENST00000601319 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
HERC3-214ENST00000601319 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
HERC3-214ENST00000601319 NEURL1BA8MQ27 555 aa21.97■■□□□ 1.11
HERC3-214ENST00000601319 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
HERC3-214ENST00000601319 DPY19L2Q6NUT2 758 aa21.97■■□□□ 1.11
HERC3-214ENST00000601319 SP8Q8IXZ3 490 aa21.97■■□□□ 1.11
HERC3-214ENST00000601319 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
HERC3-214ENST00000601319 TOMM70O94826 608 aa21.96■■□□□ 1.11
HERC3-214ENST00000601319 SLFN5Q08AF3 891 aa21.96■■□□□ 1.11
HERC3-214ENST00000601319 DNAAF4Q8WXU2 420 aa21.96■■□□□ 1.11
HERC3-214ENST00000601319 PDE8AO60658 829 aa21.95■■□□□ 1.1
HERC3-214ENST00000601319 SLC51AQ86UW1 340 aa21.95■■□□□ 1.1
HERC3-214ENST00000601319 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
HERC3-214ENST00000601319 VPS33BQ9H267 617 aa21.95■■□□□ 1.1
HERC3-214ENST00000601319 CEP350Q5VT06 3117 aa21.94■■□□□ 1.1
HERC3-214ENST00000601319 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
HERC3-214ENST00000601319 LINS1Q8NG48 757 aa21.94■■□□□ 1.1
HERC3-214ENST00000601319 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
HERC3-214ENST00000601319 SUPT20HQ8NEM7 779 aa21.93■■□□□ 1.1
HERC3-214ENST00000601319 RTL9Q8NET4 1388 aa21.93■■□□□ 1.1
HERC3-214ENST00000601319 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
HERC3-214ENST00000601319 RRAGCQ9HB90 399 aa21.93■■□□□ 1.1
HERC3-214ENST00000601319 FZD9O00144 591 aa21.92■■□□□ 1.1
HERC3-214ENST00000601319 GCKRQ14397 625 aa21.92■■□□□ 1.1
HERC3-214ENST00000601319 CCDC152Q4G0S7 254 aa21.92■■□□□ 1.1
HERC3-214ENST00000601319 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
HERC3-214ENST00000601319 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
HERC3-214ENST00000601319 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
HERC3-214ENST00000601319 ZNF541Q9H0D2 1346 aa21.91■■□□□ 1.1
HERC3-214ENST00000601319 H7C1W4 665 aa21.91■■□□□ 1.1
HERC3-214ENST00000601319 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
HERC3-214ENST00000601319 MIER1Q8N108 512 aa21.91■■□□□ 1.1
HERC3-214ENST00000601319 JDP2Q8WYK2 163 aa21.91■■□□□ 1.1
HERC3-214ENST00000601319 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
HERC3-214ENST00000601319 A0A1B0GUL6 1792 aa21.9■■□□□ 1.1
HERC3-214ENST00000601319 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.9■■□□□ 1.1
HERC3-214ENST00000601319 CTSWP56202 376 aa21.9■■□□□ 1.1
HERC3-214ENST00000601319 MPNDQ8N594 471 aa21.9■■□□□ 1.1
HERC3-214ENST00000601319 POTECB2RU33 542 aa21.89■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 DDNO94850 711 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa21.89■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 PSME4Q14997 1843 aa21.88■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 CASP7P55210 303 aa21.88■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 RPS8P62241 208 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 BEND3Q5T5X7 828 aa21.88■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.88■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.88■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 PLA2G12BQ9BX93 195 aa21.88■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 PPIP5K2O43314 1243 aa21.87■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 FSTL1Q12841 308 aa21.87■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 GPC2Q8N158 579 aa21.87■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.87■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 PTPRCP08575 1304 aa21.86■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 IQCA1LA6NCM1 817 aa21.86■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 F6X3S4 739 aa21.86■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 HSPA6P17066 643 aa21.86■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.86■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 AOC3Q16853 763 aa21.86■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 NIM1KQ8IY84 436 aa21.86■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 TTLL11Q8NHH1 800 aa21.86■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.85■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 EIF6P56537 245 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 SMC1BQ8NDV3 1235 aa21.84■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 PODXL2Q9NZ53 605 aa21.84■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 ALDH1L1O75891 902 aa21.83■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.83■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.83■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
HERC3-214ENST00000601319 GPSM2P81274 684 aa21.82■■□□□ 1.08
HERC3-214ENST00000601319 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
HERC3-214ENST00000601319 GREM2Q9H772 168 aa21.82■■□□□ 1.08
HERC3-214ENST00000601319 ZNRF3Q9ULT6 936 aa21.82■■□□□ 1.08
HERC3-214ENST00000601319 GRM8O00222 908 aa21.81■■□□□ 1.08
HERC3-214ENST00000601319 CSF1RP07333 972 aa21.81■■□□□ 1.08
HERC3-214ENST00000601319 SCN9AQ15858 1988 aa21.81■■□□□ 1.08
HERC3-214ENST00000601319 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa21.8■■□□□ 1.08
HERC3-214ENST00000601319 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
HERC3-214ENST00000601319 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
HERC3-214ENST00000601319 TBC1D16Q8TBP0 767 aa21.79■■□□□ 1.08
HERC3-214ENST00000601319 EYA3Q99504 573 aa21.79■■□□□ 1.08
HERC3-214ENST00000601319 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
HERC3-214ENST00000601319 POLLQ9UGP5 575 aa21.79■■□□□ 1.08
HERC3-214ENST00000601319 HACL1Q9UJ83 578 aa21.79■■□□□ 1.08
HERC3-214ENST00000601319 XDHP47989 1333 aa21.79■■□□□ 1.08
HERC3-214ENST00000601319 WASHC4Q2M389 1173 aa21.78■■□□□ 1.08
HERC3-214ENST00000601319 FAM161AQ3B820 660 aa21.78■■□□□ 1.08
HERC3-214ENST00000601319 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.78■■□□□ 1.08
HERC3-214ENST00000601319 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.78■■□□□ 1.08
HERC3-214ENST00000601319 C6orf229H3BNL8 230 aa21.77■■□□□ 1.08
HERC3-214ENST00000601319 APLP1P51693 650 aa21.77■■□□□ 1.08
HERC3-214ENST00000601319 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms