RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592582.5

SEH1L-210, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 4,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-210ENST00000592582 USP25Q9UHP3 1055 aa7.06□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa7.06□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 TBC1D12O60347 775 aa7.06□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 NECTIN2Q92692 538 aa7.06□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 MRC1P22897 1456 aa7.06□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 DDX58O95786 925 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 ESCO1Q5FWF5 840 aa7.06□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 TRPC6Q9Y210 931 aa7.06□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 KCNA6P17658 529 aa7.06□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 NUTM2GQ5VZR2 741 aa7.06□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 MPNDQ8N594 471 aa7.06□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 IP6K1Q92551 441 aa7.06□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 KIF12Q96FN5 646 aa7.06□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 STRCP1A6NGW2 1772 aa7.05□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 CCDC183Q5T5S1 534 aa7.05□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 MEIS3Q99687 375 aa7.05□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 ATP8B2P98198 1209 aa7.05□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 RUFY2Q8WXA3 655 aa7.05□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 MIS18AQ9NYP9 233 aa7.05□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 IRF6O14896 467 aa7.05□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 TNNT1P13805 278 aa7.04□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 MAP2K5Q13163 448 aa7.04□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 ERC1Q8IUD2 1116 aa7.04□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 BEGAINQ9BUH8 593 aa7.04□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 KDRP35968 1356 aa7.04□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 MSH6P52701 1360 aa7.04□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 FAM177BA6PVY3 158 aa7.04□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 RILPL2Q969X0 211 aa7.04□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 MX1P20591 662 aa7.04□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 TERF2Q15554 542 aa7.04□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 SIRT2Q8IXJ6 389 aa7.04□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 TRERF1Q96PN7 1200 aa7.04□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 AOX1Q06278 1338 aa7.04□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 NHSL1Q5SYE7 1610 aa7.04□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa7.04□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 CCDC192P0DO97 292 aa7.03□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 SDSP20132 328 aa7.03□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 SETQ01105 290 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 SPC24Q8NBT2 197 aa7.03□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP7.03□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 TJP1Q07157 1748 aa7.03□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 CASZ1Q86V15 1759 aa7.03□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 CRB1P82279 1406 aa7.03□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 F6X3S4 739 aa7.03□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 FOXO3O43524 673 aa7.03□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 PDE1AP54750 535 aa7.03□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 KRT24Q2M2I5 525 aa7.03□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 AKAP4Q5JQC9 854 aa7.03□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 LEKR1Q6ZMV7 388 aa7.03□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 PLCH1Q4KWH8 1693 aa7.03□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 RREB1Q92766 1687 aa7.03□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 SURF6O75683 361 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF710Q8N1W2 664 aa7.03□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 KIF1BPQ96EK5 621 aa7.03□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 OSBPL3Q9H4L5 887 aa7.03□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 BTBD11A6QL63 1104 aa7.02□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 ANAPC15P60006 121 aa7.02□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 NEXNQ0ZGT2 675 aa7.02□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 CNTROBQ8N137 903 aa7.02□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa7.02□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 ANKRD7Q92527 254 aa7.02□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 MS4A3Q96HJ5 214 aa7.02□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 YY1AP1Q9H869 796 aa7.02□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 SPTLC3Q9NUV7 552 aa7.02□□□□□ -1.28
SEH1L-210ENST00000592582 ATP10DQ9P241 1426 aa7.02□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 USP26Q9BXU7 913 aa7.02□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 ANO2Q9NQ90 1003 aa7.02□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 TMEM63CQ9P1W3 806 aa7.02□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa7.02□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 KDM4AO75164 1064 aa7.02□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 HIC1Q14526 733 aa7.02□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 RETREG2Q8NC44 543 aa7.02□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 DNAAF4Q8WXU2 420 aa7.02□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 GDPD2Q9HCC8 539 aa7.02□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 C2orf72A6NCS6 295 aa7.01□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa7.01□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 NEMFO60524 1076 aa7.01□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 ALDH1L1O75891 902 aa7.01□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 TRIM5Q9C035 493 aa7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms