RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 MPNDQ8N594 471 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAF4-216ENST00000586813 CFAP44Q96MT7 982 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAF4-216ENST00000586813 ZNRF3Q9ULT6 936 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAF4-216ENST00000586813 THSD7BQ9C0I4 1608 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAF4-216ENST00000586813 FOXN1O15353 648 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF428Q96B54 188 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAF4-216ENST00000586813 CXCL9Q07325 125 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAF4-216ENST00000586813 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAF4-216ENST00000586813 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAF4-216ENST00000586813 GPRC5DQ9NZD1 345 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAF4-216ENST00000586813 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAF4-216ENST00000586813 DEFB115Q30KQ5 88 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAF4-216ENST00000586813 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAF4-216ENST00000586813 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
TRAF4-216ENST00000586813 MBIPQ9NS73 344 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAF4-216ENST00000586813 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TRAF4-216ENST00000586813 COL4A1P02462 1669 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAF4-216ENST00000586813 TMC4Q7Z404 712 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAF4-216ENST00000586813 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
TRAF4-216ENST00000586813 HYPKQ9NX55 129 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAF4-216ENST00000586813 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAF4-216ENST00000586813 AIDAQ96BJ3 306 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAF4-216ENST00000586813 FAM89AQ96GI7 184 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAF4-216ENST00000586813 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAF4-216ENST00000586813 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TRAF4-216ENST00000586813 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF853P0CG23 659 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAF4-216ENST00000586813 CIAPIN1Q6FI81 312 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAF4-216ENST00000586813 WBP1LQ9NX94 342 aa25.14■■□□□ 1.62
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TRAF4-216ENST00000586813 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
TRAF4-216ENST00000586813 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAF4-216ENST00000586813 RAD17O75943 681 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAF4-216ENST00000586813 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
TRAF4-216ENST00000586813 IFT57Q9NWB7 429 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAF4-216ENST00000586813 YDJCA8MPS7 323 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAF4-216ENST00000586813 APAF1O14727 1248 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAF4-216ENST00000586813 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
TRAF4-216ENST00000586813 TNIP1Q15025 636 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAF4-216ENST00000586813 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
TRAF4-216ENST00000586813 CST9Q5W186 159 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAF4-216ENST00000586813 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.1■■□□□ 1.61
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TRAF4-216ENST00000586813 GOLGA2Q08379 1002 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAF4-216ENST00000586813 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
TRAF4-216ENST00000586813 GNAI1P63096 354 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAF4-216ENST00000586813 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAF4-216ENST00000586813 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
TRAF4-216ENST00000586813 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
TRAF4-216ENST00000586813 WASHC4Q2M389 1173 aa25.07■■□□□ 1.6
TRAF4-216ENST00000586813 CAPNS2Q96L46 248 aa25.07■■□□□ 1.6
TRAF4-216ENST00000586813 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
TRAF4-216ENST00000586813 TLL2Q9Y6L7 1015 aa25.07■■□□□ 1.6
TRAF4-216ENST00000586813 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
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TRAF4-216ENST00000586813 LBX1P52954 281 aa25.06■■□□□ 1.6
TRAF4-216ENST00000586813 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
TRAF4-216ENST00000586813 TRPM4Q8TD43 1214 aa25.06■■□□□ 1.6
TRAF4-216ENST00000586813 PGAP2Q9UHJ9 254 aa25.06■■□□□ 1.6
TRAF4-216ENST00000586813 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TRAF4-216ENST00000586813 GPSM2P81274 684 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAF4-216ENST00000586813 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAF4-216ENST00000586813 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TRAF4-216ENST00000586813 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
TRAF4-216ENST00000586813 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TRAF4-216ENST00000586813 POLLQ9UGP5 575 aa25.05■■□□□ 1.6
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TRAF4-216ENST00000586813 SCN9AQ15858 1988 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAF4-216ENST00000586813 SHTN1A0MZ66 631 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAF4-216ENST00000586813 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
TRAF4-216ENST00000586813 MICALL2Q8IY33 904 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAF4-216ENST00000586813 DBNDD1Q9H9R9 158 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAF4-216ENST00000586813 C6orf229H3BNL8 230 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAF4-216ENST00000586813 RIMBP2O15034 1052 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAF4-216ENST00000586813 CELF2O95319 508 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
TRAF4-216ENST00000586813 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
TRAF4-216ENST00000586813 GRM1Q13255 1194 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAF4-216ENST00000586813 C8orf58Q8NAV2 365 aa25.03■■□□□ 1.6
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TRAF4-216ENST00000586813 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
TRAF4-216ENST00000586813 MYH3P11055 1940 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAF4-216ENST00000586813 H7C1D1 291 aa25.02■■□□□ 1.6
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TRAF4-216ENST00000586813 DPF2Q92785 391 aa25.01■■□□□ 1.59
TRAF4-216ENST00000586813 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
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TRAF4-216ENST00000586813 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TRAF4-216ENST00000586813 ECE2O60344 883 aa25■■□□□ 1.59
TRAF4-216ENST00000586813 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25■■□□□ 1.59
TRAF4-216ENST00000586813 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
TRAF4-216ENST00000586813 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAF4-216ENST00000586813 CDC37L1Q7L3B6 337 aa24.99■■□□□ 1.59
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