RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SCNN1DP51172 638 aa36.58■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LTBP1Q14766 1721 aa36.58■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CNTROBQ8N137 903 aa36.57■■■■□ 3.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMEM88BA6NKF7 163 aa36.56■■■■□ 3.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 EPS15P42566 896 aa36.55■■■■□ 3.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GOLGA2Q08379 1002 aa36.55■■■■□ 3.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RIC3Q7Z5B4 369 aa36.54■■■■□ 3.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNRF3Q9ULT6 936 aa36.54■■■■□ 3.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CNTNAP1P78357 1384 aa36.53■■■■□ 3.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMC4Q7Z404 712 aa36.52■■■■□ 3.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KIAA2012Q0VF49 1180 aa36.51■■■■□ 3.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CXCL9Q07325 125 aa36.5■■■■□ 3.43
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LRRC37AA6NMS7 1700 aa36.48■■■■□ 3.43
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CCDC184Q52MB2 194 aa36.47■■■■□ 3.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GPRC5DQ9NZD1 345 aa36.47■■■■□ 3.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MYD88Q99836 296 aa36.46■■■■□ 3.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DUOX1Q9NRD9 1551 aa36.45■■■■□ 3.43
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RAD17O75943 681 aa36.43■■■■□ 3.42
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CCDC30Q5VVM6 783 aa36.43■■■■□ 3.42
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CHMP4AQ9BY43 222 aa36.43■■■■□ 3.42
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TNIP1Q15025 636 aa36.42■■■■□ 3.42
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BCL2L13Q9BXK5 485 aa36.41■■■■□ 3.42
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 COL4A1P02462 1669 aa36.41■■■■□ 3.42
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TNS4Q8IZW8 715 aa36.4■■■■□ 3.42
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TSPYL6Q8N831 410 aa36.4■■■■□ 3.42
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 WASHC4Q2M389 1173 aa36.39■■■■□ 3.42
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CCDC191Q8NCU4 936 aa36.39■■■■□ 3.42
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 YDJCA8MPS7 323 aa36.38■■■■□ 3.41
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C6orf229H3BNL8 230 aa36.38■■■■□ 3.41
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP36.38■■■■□ 3.41
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DEFB115Q30KQ5 88 aa36.38■■■■□ 3.41
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RASSF10A6NK89 507 aa36.37■■■■□ 3.41
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RPS8P62241 208 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GPSM2P81274 684 aa36.37■■■■□ 3.41
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRAF5O00463 557 aa36.35■■■■□ 3.41
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RIMBP2O15034 1052 aa36.35■■■■□ 3.41
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 POLLQ9UGP5 575 aa36.35■■■■□ 3.41
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CCDC27Q2M243 656 aa36.34■■■■□ 3.41
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DBNDD1Q9H9R9 158 aa36.34■■■■□ 3.41
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SEC31BQ9NQW1 1179 aa36.34■■■■□ 3.41
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 WWC1Q8IX03 1113 aa36.33■■■■□ 3.41
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa36.33■■■■□ 3.41
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRPM7Q96QT4 1865 aa36.33■■■■□ 3.41
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CCDC152Q4G0S7 254 aa36.32■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 EYA3Q99504 573 aa36.32■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 STK31Q9BXU1 1019 aa36.32■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FOXN1O15353 648 aa36.31■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PDE8AO60658 829 aa36.31■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AIDAQ96BJ3 306 aa36.31■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TBC1D16Q8TBP0 767 aa36.3■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MRS2Q9HD23 443 aa36.3■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KSR2Q6VAB6 950 aa36.29■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PI4KAP2A4QPH2 592 aa36.28■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 H7C1D1 291 aa36.28■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PSMD14O00487 310 aa36.28■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa36.28■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRPM4Q8TD43 1214 aa36.28■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SHTN1A0MZ66 631 aa36.27■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ECE2O60344 883 aa36.27■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DOK7Q18PE1 504 aa36.27■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CST9Q5W186 159 aa36.27■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MICALL2Q8IY33 904 aa36.27■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CAPN15O75808 1086 aa36.26■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa36.26■■■■□ 3.4
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