RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574042.2

TRIM16L-211, Transcript of tripartite motif containing 16 like, humanhuman

TSL 3

Gene TRIM16L, Length 791 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16L-211ENST00000574042 TNS4Q8IZW8 715 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM16L-211ENST00000574042 ISCA1Q9BUE6 129 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM16L-211ENST00000574042 MBIPQ9NS73 344 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM16L-211ENST00000574042 IFT57Q9NWB7 429 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM16L-211ENST00000574042 ZNRF3Q9ULT6 936 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM16L-211ENST00000574042 RASSF10A6NK89 507 aa14.78□□□□□ -0.04
TRIM16L-211ENST00000574042 ZNF853P0CG23 659 aa14.78□□□□□ -0.04
TRIM16L-211ENST00000574042 KIAA2012Q0VF49 1180 aa14.78□□□□□ -0.04
TRIM16L-211ENST00000574042 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.78□□□□□ -0.04
TRIM16L-211ENST00000574042 MPNDQ8N594 471 aa14.78□□□□□ -0.04
TRIM16L-211ENST00000574042 EPS15P42566 896 aa14.77□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 GPRC5DQ9NZD1 345 aa14.77□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 COL4A1P02462 1669 aa14.77□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 TAF1P21675 1872 aa14.76□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 TRPM7Q96QT4 1865 aa14.76□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 VEGFBP49765 207 aa14.76□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 GNAI1P63096 354 aa14.76□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 GOLGA2Q08379 1002 aa14.76□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 PCNTO95613 3336 aa14.76□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 CXCL9Q07325 125 aa14.75□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 AIDAQ96BJ3 306 aa14.75□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 FAM89AQ96GI7 184 aa14.75□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 APAF1O14727 1248 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 TNIP1Q15025 636 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 CIAPIN1Q6FI81 312 aa14.74□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 FOXN1O15353 648 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 CHMP4AQ9BY43 222 aa14.73□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 DEFB115Q30KQ5 88 aa14.72□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 RIC3Q7Z5B4 369 aa14.72□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.72□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 YDJCA8MPS7 323 aa14.71□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 RAD17O75943 681 aa14.71□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 ZNF428Q96B54 188 aa14.71□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 BCL2L13Q9BXK5 485 aa14.71□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 WBP1LQ9NX94 342 aa14.71□□□□□ -0.05
TRIM16L-211ENST00000574042 ZNF609O15014 1411 aa14.7□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 TRAF5O00463 557 aa14.7□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 DDX58O95786 925 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 ECE1P42892 770 aa14.7□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 WASHC4Q2M389 1173 aa14.7□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 CCDC30Q5VVM6 783 aa14.7□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 CCDC191Q8NCU4 936 aa14.7□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 EYA3Q99504 573 aa14.7□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 GPSM2P81274 684 aa14.69□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 C8orf58Q8NAV2 365 aa14.69□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 MYD88Q99836 296 aa14.69□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 PGAP2Q9UHJ9 254 aa14.69□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 TLL2Q9Y6L7 1015 aa14.69□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 CAPN15O75808 1086 aa14.68□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 RPS12P25398 132 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.68□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 CST9Q5W186 159 aa14.68□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 MICALL2Q8IY33 904 aa14.68□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 TRPM4Q8TD43 1214 aa14.68□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 DPF2Q92785 391 aa14.68□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 CAPNS2Q96L46 248 aa14.68□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 DBNDD1Q9H9R9 158 aa14.68□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 PODXL2Q9NZ53 605 aa14.68□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 PSME4Q14997 1843 aa14.68□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 MYH3P11055 1940 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 C6orf229H3BNL8 230 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 H7C1D1 291 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 ECE2O60344 883 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 RPS8P62241 208 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 CCDC27Q2M243 656 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 POLLQ9UGP5 575 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 RTL9Q8NET4 1388 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 PSMD14O00487 310 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 PDE8AO60658 829 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 HHIPL1Q96JK4 782 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 SPEF2Q9C093 1822 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 UFL1O94874 794 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 CELF2O95319 508 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms