RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572830.5

NOMO3-208, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 5

Gene NOMO3, Length 548 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-208ENST00000572830 GPC2Q8N158 579 aa11.94□□□□□ -0.5
NOMO3-208ENST00000572830 LARGE2Q8N3Y3 721 aa11.94□□□□□ -0.5
NOMO3-208ENST00000572830 TSPYL6Q8N831 410 aa11.94□□□□□ -0.5
NOMO3-208ENST00000572830 FAM89AQ96GI7 184 aa11.94□□□□□ -0.5
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NOMO3-208ENST00000572830 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
NOMO3-208ENST00000572830 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
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NOMO3-208ENST00000572830 SPEF2Q9C093 1822 aa11.83□□□□□ -0.52
NOMO3-208ENST00000572830 H7C1D1 291 aa11.82□□□□□ -0.52
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