RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566353.5

STX4-216, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STX4, Length 696 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-216ENST00000566353 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27.45■■□□□ 1.98
STX4-216ENST00000566353 DEFB115Q30KQ5 88 aa27.44■■□□□ 1.98
STX4-216ENST00000566353 PLBD2Q8NHP8 589 aa27.44■■□□□ 1.98
STX4-216ENST00000566353 AIDAQ96BJ3 306 aa27.44■■□□□ 1.98
STX4-216ENST00000566353 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
STX4-216ENST00000566353 CXCL9Q07325 125 aa27.43■■□□□ 1.98
STX4-216ENST00000566353 ZNF428Q96B54 188 aa27.43■■□□□ 1.98
STX4-216ENST00000566353 GPRC5DQ9NZD1 345 aa27.43■■□□□ 1.98
STX4-216ENST00000566353 THSD7BQ9C0I4 1608 aa27.42■■□□□ 1.98
STX4-216ENST00000566353 KIAA2012Q0VF49 1180 aa27.42■■□□□ 1.98
STX4-216ENST00000566353 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
STX4-216ENST00000566353 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP27.41■■□□□ 1.98
STX4-216ENST00000566353 CFAP44Q96MT7 982 aa27.41■■□□□ 1.98
STX4-216ENST00000566353 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
STX4-216ENST00000566353 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
STX4-216ENST00000566353 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa27.4■■□□□ 1.98
STX4-216ENST00000566353 ISCA1Q9BUE6 129 aa27.4■■□□□ 1.98
STX4-216ENST00000566353 PRDM10Q9NQV6 1147 aa27.4■■□□□ 1.98
STX4-216ENST00000566353 WBP1LQ9NX94 342 aa27.4■■□□□ 1.98
STX4-216ENST00000566353 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
STX4-216ENST00000566353 TMC4Q7Z404 712 aa27.39■■□□□ 1.98
STX4-216ENST00000566353 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.97
STX4-216ENST00000566353 DUSP27Q5VZP5 1158 aa27.38■■□□□ 1.97
STX4-216ENST00000566353 CIAPIN1Q6FI81 312 aa27.38■■□□□ 1.97
STX4-216ENST00000566353 MBIPQ9NS73 344 aa27.38■■□□□ 1.97
STX4-216ENST00000566353 CDHR2Q9BYE9 1310 aa27.38■■□□□ 1.97
STX4-216ENST00000566353 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa27.37■■□□□ 1.97
STX4-216ENST00000566353 TRAF5O00463 557 aa27.37■■□□□ 1.97
STX4-216ENST00000566353 FAM89AQ96GI7 184 aa27.37■■□□□ 1.97
STX4-216ENST00000566353 HYPKQ9NX55 129 aa27.37■■□□□ 1.97
STX4-216ENST00000566353 COL4A1P02462 1669 aa27.36■■□□□ 1.97
STX4-216ENST00000566353 RAD17O75943 681 aa27.35■■□□□ 1.97
STX4-216ENST00000566353 TNIP1Q15025 636 aa27.35■■□□□ 1.97
STX4-216ENST00000566353 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
STX4-216ENST00000566353 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
STX4-216ENST00000566353 CST9Q5W186 159 aa27.34■■□□□ 1.97
STX4-216ENST00000566353 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
STX4-216ENST00000566353 BCL2L13Q9BXK5 485 aa27.34■■□□□ 1.97
STX4-216ENST00000566353 YDJCA8MPS7 323 aa27.33■■□□□ 1.97
STX4-216ENST00000566353 ZNF853P0CG23 659 aa27.33■■□□□ 1.97
STX4-216ENST00000566353 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
STX4-216ENST00000566353 LBX1P52954 281 aa27.32■■□□□ 1.96
STX4-216ENST00000566353 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
STX4-216ENST00000566353 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
STX4-216ENST00000566353 CAPNS2Q96L46 248 aa27.32■■□□□ 1.96
STX4-216ENST00000566353 TLL2Q9Y6L7 1015 aa27.32■■□□□ 1.96
STX4-216ENST00000566353 ECE1P42892 770 aa27.31■■□□□ 1.96
STX4-216ENST00000566353 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
STX4-216ENST00000566353 IFT57Q9NWB7 429 aa27.31■■□□□ 1.96
STX4-216ENST00000566353 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
STX4-216ENST00000566353 GOLGA2Q08379 1002 aa27.3■■□□□ 1.96
STX4-216ENST00000566353 CYP4F22Q6NT55 531 aa27.3■■□□□ 1.96
STX4-216ENST00000566353 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
STX4-216ENST00000566353 PGAP2Q9UHJ9 254 aa27.3■■□□□ 1.96
STX4-216ENST00000566353 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
STX4-216ENST00000566353 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
STX4-216ENST00000566353 APAF1O14727 1248 aa27.29■■□□□ 1.96
STX4-216ENST00000566353 WASHC4Q2M389 1173 aa27.29■■□□□ 1.96
STX4-216ENST00000566353 RIC3Q7Z5B4 369 aa27.29■■□□□ 1.96
STX4-216ENST00000566353 TRPM4Q8TD43 1214 aa27.29■■□□□ 1.96
STX4-216ENST00000566353 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
STX4-216ENST00000566353 GNAI1P63096 354 aa27.28■■□□□ 1.96
STX4-216ENST00000566353 GPSM2P81274 684 aa27.28■■□□□ 1.96
STX4-216ENST00000566353 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
STX4-216ENST00000566353 GRM1Q13255 1194 aa27.28■■□□□ 1.96
STX4-216ENST00000566353 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
STX4-216ENST00000566353 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
STX4-216ENST00000566353 SHTN1A0MZ66 631 aa27.27■■□□□ 1.96
STX4-216ENST00000566353 CELF2O95319 508 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
STX4-216ENST00000566353 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
STX4-216ENST00000566353 DBNDD1Q9H9R9 158 aa27.27■■□□□ 1.96
STX4-216ENST00000566353 MICALL2Q8IY33 904 aa27.26■■□□□ 1.95
STX4-216ENST00000566353 POLLQ9UGP5 575 aa27.26■■□□□ 1.95
STX4-216ENST00000566353 C6orf229H3BNL8 230 aa27.25■■□□□ 1.95
STX4-216ENST00000566353 H7C1D1 291 aa27.25■■□□□ 1.95
STX4-216ENST00000566353 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
STX4-216ENST00000566353 RIMBP2O15034 1052 aa27.25■■□□□ 1.95
STX4-216ENST00000566353 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
STX4-216ENST00000566353 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
STX4-216ENST00000566353 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
STX4-216ENST00000566353 PSMD14O00487 310 aa27.24■■□□□ 1.95
STX4-216ENST00000566353 SAPCD2Q86UD0 394 aa27.24■■□□□ 1.95
STX4-216ENST00000566353 EYA3Q99504 573 aa27.24■■□□□ 1.95
STX4-216ENST00000566353 MYD88Q99836 296 aa27.24■■□□□ 1.95
STX4-216ENST00000566353 RPS8P62241 208 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
STX4-216ENST00000566353 CDC37L1Q7L3B6 337 aa27.23■■□□□ 1.95
STX4-216ENST00000566353 DPF2Q92785 391 aa27.23■■□□□ 1.95
STX4-216ENST00000566353 ECE2O60344 883 aa27.22■■□□□ 1.95
STX4-216ENST00000566353 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
STX4-216ENST00000566353 TBC1D16Q8TBP0 767 aa27.22■■□□□ 1.95
STX4-216ENST00000566353 ZNF408Q9H9D4 720 aa27.22■■□□□ 1.95
STX4-216ENST00000566353 C8orf58Q8NAV2 365 aa27.21■■□□□ 1.95
STX4-216ENST00000566353 BEGAINQ9BUH8 593 aa27.21■■□□□ 1.95
STX4-216ENST00000566353 SEC31BQ9NQW1 1179 aa27.21■■□□□ 1.95
STX4-216ENST00000566353 RTL9Q8NET4 1388 aa27.21■■□□□ 1.95
STX4-216ENST00000566353 AOC2O75106 756 aa27.2■■□□□ 1.94
STX4-216ENST00000566353 DOK7Q18PE1 504 aa27.2■■□□□ 1.94
STX4-216ENST00000566353 CCDC191Q8NCU4 936 aa27.2■■□□□ 1.94
STX4-216ENST00000566353 HHIPL1Q96JK4 782 aa27.2■■□□□ 1.94
STX4-216ENST00000566353 SCN9AQ15858 1988 aa27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 133.3 ms