RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	ELP1	O95163	1332 aa		21.91	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		21.9	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	TICAM2	Q86XR7	235 aa		21.9	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	TFCP2	Q12800	502 aa		21.89	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	21.89	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		21.89	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	21.89	■■□□□ 1.1
RRN3-205	ENST00000563559	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	21.89	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559	CYP27B1	O15528	508 aa		21.89	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559	CABP4	P57796	275 aa		21.89	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	21.89	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559		A0A087WZG4	1122 aa		21.88	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		21.88	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	21.88	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	21.88	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	21.88	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559	HAUS7	Q99871	368 aa		21.87	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	21.86	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		21.86	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		21.86	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		21.86	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		21.85	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		21.85	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559	NEK1	Q96PY6	1258 aa		21.85	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559	USP25	Q9UHP3	1055 aa		21.85	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		21.85	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559	KDM4A	O75164	1064 aa		21.85	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC192	P0DO97	292 aa		21.85	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559	CASP7	P55210	303 aa		21.85	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		21.85	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559	CPD	O75976	1380 aa		21.84	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559	ADCY5	O95622	1261 aa		21.84	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		21.84	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	21.84	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		21.83	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	21.83	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	21.83	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	21.83	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	21.83	■■□□□ 1.09
RRN3-205	ENST00000563559	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	21.83	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		21.83	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	GTF3C6	Q969F1	213 aa		21.83	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		21.83	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	21.83	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		21.83	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	GPR108	Q9NPR9	543 aa		21.83	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		21.83	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM94	Q12767	1356 aa		21.83	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	TTC6	Q86TZ1	520 aa		21.82	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		21.82	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		21.82	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	21.82	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		21.82	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		21.82	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559		H7C1W4	665 aa		21.82	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	21.82	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		21.82	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF609	O15014	1411 aa		21.81	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	FERMT3	Q86UX7	667 aa		21.81	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	21.8	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	CHRNA2	Q15822	529 aa		21.8	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	MAP3K11	Q16584	847 aa		21.8	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	PALLD	Q8WX93	1383 aa		21.8	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		21.8	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA32	Q96LK8	384 aa		21.8	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		21.8	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	21.8	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	FOXO4	P98177	505 aa		21.79	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	21.79	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		21.79	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		21.79	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	TPM3	P06753	285 aa		21.79	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	21.79	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	STK3	Q13188	491 aa		21.79	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	21.79	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	21.79	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	CYP21A2	P08686	494 aa		21.78	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559		Q6ZUG5	572 aa		21.78	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	21.78	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	GLI3	P10071	1580 aa		21.78	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		21.78	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		21.78	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		21.77	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	DTNB	O60941	627 aa		21.77	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	21.77	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		21.77	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		21.77	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	21.77	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		21.77	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		21.77	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	ATG3	Q9NT62	314 aa		21.77	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		21.77	■■□□□ 1.08
RRN3-205	ENST00000563559	FGD1	P98174	961 aa		21.76	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		21.76	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		21.76	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		21.76	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	21.76	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		21.76	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	KIF3A	Q9Y496	699 aa		21.76	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	NBPF26	B4DH59	902 aa		21.76	■■□□□ 1.07

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