RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP26.61■■□□□ 1.85
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TMOD3-203ENST00000558455 BBOX1O75936 387 aa26.6■■□□□ 1.85
TMOD3-203ENST00000558455 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.6■■□□□ 1.85
TMOD3-203ENST00000558455 PTPRCP08575 1304 aa26.6■■□□□ 1.85
TMOD3-203ENST00000558455 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.6■■□□□ 1.85
TMOD3-203ENST00000558455 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.59■■□□□ 1.85
TMOD3-203ENST00000558455 COL4A1P02462 1669 aa26.58■■□□□ 1.85
TMOD3-203ENST00000558455 CCDC152Q4G0S7 254 aa26.58■■□□□ 1.85
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TMOD3-203ENST00000558455 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
TMOD3-203ENST00000558455 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
TMOD3-203ENST00000558455 CASP7P55210 303 aa26.57■■□□□ 1.84
TMOD3-203ENST00000558455 CTSWP56202 376 aa26.57■■□□□ 1.84
TMOD3-203ENST00000558455 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
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TMOD3-203ENST00000558455 TAF1P21675 1872 aa26.57■■□□□ 1.84
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TMOD3-203ENST00000558455 GRIPAP1Q4V328 841 aa26.56■■□□□ 1.84
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TMOD3-203ENST00000558455 SEC31BQ9NQW1 1179 aa26.56■■□□□ 1.84
TMOD3-203ENST00000558455 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa26.55■■□□□ 1.84
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TMOD3-203ENST00000558455 SP8Q8IXZ3 490 aa26.55■■□□□ 1.84
TMOD3-203ENST00000558455 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.55■■□□□ 1.84
TMOD3-203ENST00000558455 ALDH1L1O75891 902 aa26.54■■□□□ 1.84
TMOD3-203ENST00000558455 TMC4Q7Z404 712 aa26.54■■□□□ 1.84
TMOD3-203ENST00000558455 TTLL11Q8NHH1 800 aa26.53■■□□□ 1.84
TMOD3-203ENST00000558455 PLA2G12BQ9BX93 195 aa26.53■■□□□ 1.84
TMOD3-203ENST00000558455 GRM8O00222 908 aa26.52■■□□□ 1.84
TMOD3-203ENST00000558455 IARSP41252 1262 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
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TMOD3-203ENST00000558455 LRRC37AA6NMS7 1700 aa26.51■■□□□ 1.83
TMOD3-203ENST00000558455 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
TMOD3-203ENST00000558455 GREM2Q9H772 168 aa26.51■■□□□ 1.83
TMOD3-203ENST00000558455 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
TMOD3-203ENST00000558455 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
TMOD3-203ENST00000558455 MPNDQ8N594 471 aa26.5■■□□□ 1.83
TMOD3-203ENST00000558455 MYH3P11055 1940 aa26.49■■□□□ 1.83
TMOD3-203ENST00000558455 RTL9Q8NET4 1388 aa26.49■■□□□ 1.83
TMOD3-203ENST00000558455 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.49■■□□□ 1.83
TMOD3-203ENST00000558455 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
TMOD3-203ENST00000558455 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
TMOD3-203ENST00000558455 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.48■■□□□ 1.83
TMOD3-203ENST00000558455 KIF16BQ96L93 1317 aa26.47■■□□□ 1.83
TMOD3-203ENST00000558455 GLTPD2A6NH11 291 aa26.47■■□□□ 1.83
TMOD3-203ENST00000558455 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa26.47■■□□□ 1.83
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TMOD3-203ENST00000558455 COL4A5P29400 1685 aa26.47■■□□□ 1.83
TMOD3-203ENST00000558455 DUOX1Q9NRD9 1551 aa26.46■■□□□ 1.83
TMOD3-203ENST00000558455 CSF1RP07333 972 aa26.46■■□□□ 1.83
TMOD3-203ENST00000558455 FAM161AQ3B820 660 aa26.46■■□□□ 1.83
TMOD3-203ENST00000558455 SUPT20HQ8NEM7 779 aa26.46■■□□□ 1.83
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TMOD3-203ENST00000558455 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.45■■□□□ 1.82
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TMOD3-203ENST00000558455 PPIP5K2O43314 1243 aa26.44■■□□□ 1.82
TMOD3-203ENST00000558455 GPSM2P81274 684 aa26.44■■□□□ 1.82
TMOD3-203ENST00000558455 AOC3Q16853 763 aa26.44■■□□□ 1.82
TMOD3-203ENST00000558455 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.44■■□□□ 1.82
TMOD3-203ENST00000558455 DPY19L2Q6NUT2 758 aa26.44■■□□□ 1.82
TMOD3-203ENST00000558455 JDP2Q8WYK2 163 aa26.44■■□□□ 1.82
TMOD3-203ENST00000558455 BCAR3O75815 825 aa26.43■■□□□ 1.82
TMOD3-203ENST00000558455 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
TMOD3-203ENST00000558455 ITGA6P23229 1130 aa26.43■■□□□ 1.82
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.42■■□□□ 1.82
TMOD3-203ENST00000558455 SUCLG2Q96I99 432 aa26.42■■□□□ 1.82
TMOD3-203ENST00000558455 VPS33BQ9H267 617 aa26.42■■□□□ 1.82
TMOD3-203ENST00000558455 LTBP1Q14766 1721 aa26.42■■□□□ 1.82
TMOD3-203ENST00000558455 FZD9O00144 591 aa26.41■■□□□ 1.82
TMOD3-203ENST00000558455 ARHGAP45Q92619 1136 aa26.41■■□□□ 1.82
TMOD3-203ENST00000558455 RRAGCQ9HB90 399 aa26.41■■□□□ 1.82
TMOD3-203ENST00000558455 DDNO94850 711 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
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TMOD3-203ENST00000558455 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.4■■□□□ 1.82
TMOD3-203ENST00000558455 LMBR1LQ6UX01 489 aa26.4■■□□□ 1.82
TMOD3-203ENST00000558455 NIM1KQ8IY84 436 aa26.4■■□□□ 1.82
TMOD3-203ENST00000558455 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
TMOD3-203ENST00000558455 POLLQ9UGP5 575 aa26.4■■□□□ 1.82
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TMOD3-203ENST00000558455 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
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TMOD3-203ENST00000558455 USP44Q9H0E7 712 aa26.39■■□□□ 1.82
TMOD3-203ENST00000558455 PODXL2Q9NZ53 605 aa26.39■■□□□ 1.82
TMOD3-203ENST00000558455 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa26.39■■□□□ 1.82
TMOD3-203ENST00000558455 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa26.38■■□□□ 1.81
TMOD3-203ENST00000558455 C6orf229H3BNL8 230 aa26.38■■□□□ 1.81
TMOD3-203ENST00000558455 TBC1D16Q8TBP0 767 aa26.38■■□□□ 1.81
TMOD3-203ENST00000558455 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
TMOD3-203ENST00000558455 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
TMOD3-203ENST00000558455 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
TMOD3-203ENST00000558455 SPEF2Q9C093 1822 aa26.37■■□□□ 1.81
TMOD3-203ENST00000558455 XDHP47989 1333 aa26.37■■□□□ 1.81
TMOD3-203ENST00000558455 WDR90Q96KV7 1748 aa26.36■■□□□ 1.81
TMOD3-203ENST00000558455 UFL1O94874 794 aa26.36■■□□□ 1.81
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