RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 SLFN5Q08AF3 891 aa26.72■■□□□ 1.87
CS-222ENST00000550996 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
CS-222ENST00000550996 TAF1P21675 1872 aa26.71■■□□□ 1.87
CS-222ENST00000550996 POTECB2RU33 542 aa26.71■■□□□ 1.87
CS-222ENST00000550996 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.71■■□□□ 1.87
CS-222ENST00000550996 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.7■■□□□ 1.87
CS-222ENST00000550996 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.7■■□□□ 1.86
CS-222ENST00000550996 SP8Q8IXZ3 490 aa26.7■■□□□ 1.86
CS-222ENST00000550996 F6X3S4 739 aa26.69■■□□□ 1.86
CS-222ENST00000550996 DDNO94850 711 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
CS-222ENST00000550996 GRIPAP1Q4V328 841 aa26.69■■□□□ 1.86
CS-222ENST00000550996 CDHR2Q9BYE9 1310 aa26.68■■□□□ 1.86
CS-222ENST00000550996 TOMM70O94826 608 aa26.68■■□□□ 1.86
CS-222ENST00000550996 SEC31BQ9NQW1 1179 aa26.68■■□□□ 1.86
CS-222ENST00000550996 PDE8AO60658 829 aa26.67■■□□□ 1.86
CS-222ENST00000550996 DPY19L2Q6NUT2 758 aa26.67■■□□□ 1.86
CS-222ENST00000550996 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
CS-222ENST00000550996 H7C1W4 665 aa26.66■■□□□ 1.86
CS-222ENST00000550996 FZD9O00144 591 aa26.66■■□□□ 1.86
CS-222ENST00000550996 GCKRQ14397 625 aa26.66■■□□□ 1.86
CS-222ENST00000550996 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
CS-222ENST00000550996 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
CS-222ENST00000550996 WDR90Q96KV7 1748 aa26.65■■□□□ 1.86
CS-222ENST00000550996 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
CS-222ENST00000550996 LINS1Q8NG48 757 aa26.65■■□□□ 1.86
CS-222ENST00000550996 DUOX1Q9NRD9 1551 aa26.65■■□□□ 1.86
CS-222ENST00000550996 CACNA1FO60840 1977 aa26.65■■□□□ 1.86
CS-222ENST00000550996 CASP7P55210 303 aa26.64■■□□□ 1.86
CS-222ENST00000550996 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
CS-222ENST00000550996 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa26.64■■□□□ 1.86
CS-222ENST00000550996 MPNDQ8N594 471 aa26.64■■□□□ 1.86
CS-222ENST00000550996 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
CS-222ENST00000550996 LRRC37AA6NMS7 1700 aa26.64■■□□□ 1.85
CS-222ENST00000550996 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
CS-222ENST00000550996 CTSWP56202 376 aa26.63■■□□□ 1.85
CS-222ENST00000550996 AOC3Q16853 763 aa26.63■■□□□ 1.85
CS-222ENST00000550996 CCDC152Q4G0S7 254 aa26.63■■□□□ 1.85
CS-222ENST00000550996 BEND3Q5T5X7 828 aa26.63■■□□□ 1.85
CS-222ENST00000550996 TMC4Q7Z404 712 aa26.63■■□□□ 1.85
CS-222ENST00000550996 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.63■■□□□ 1.85
CS-222ENST00000550996 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
CS-222ENST00000550996 RPS8P62241 208 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
CS-222ENST00000550996 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
CS-222ENST00000550996 PPIP5K2O43314 1243 aa26.61■■□□□ 1.85
CS-222ENST00000550996 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
CS-222ENST00000550996 TTLL11Q8NHH1 800 aa26.61■■□□□ 1.85
CS-222ENST00000550996 JDP2Q8WYK2 163 aa26.61■■□□□ 1.85
CS-222ENST00000550996 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
CS-222ENST00000550996 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.6■■□□□ 1.85
CS-222ENST00000550996 GPSM2P81274 684 aa26.59■■□□□ 1.85
CS-222ENST00000550996 GREM2Q9H772 168 aa26.59■■□□□ 1.85
CS-222ENST00000550996 HSPA6P17066 643 aa26.58■■□□□ 1.85
CS-222ENST00000550996 SUPT20HQ8NEM7 779 aa26.58■■□□□ 1.85
CS-222ENST00000550996 PLA2G12BQ9BX93 195 aa26.58■■□□□ 1.85
CS-222ENST00000550996 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.57■■□□□ 1.84
CS-222ENST00000550996 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.57■■□□□ 1.84
CS-222ENST00000550996 VPS33BQ9H267 617 aa26.57■■□□□ 1.84
CS-222ENST00000550996 POLLQ9UGP5 575 aa26.57■■□□□ 1.84
CS-222ENST00000550996 LTBP1Q14766 1721 aa26.56■■□□□ 1.84
CS-222ENST00000550996 POTEIP0CG38 1075 aa26.56■■□□□ 1.84
CS-222ENST00000550996 POTEJP0CG39 1038 aa26.56■■□□□ 1.84
CS-222ENST00000550996 NIM1KQ8IY84 436 aa26.56■■□□□ 1.84
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CS-222ENST00000550996 RTL9Q8NET4 1388 aa26.56■■□□□ 1.84
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CS-222ENST00000550996 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
CS-222ENST00000550996 EIF6P56537 245 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CS-222ENST00000550996 FSTL1Q12841 308 aa26.54■■□□□ 1.84
CS-222ENST00000550996 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.53■■□□□ 1.84
CS-222ENST00000550996 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa26.53■■□□□ 1.84
CS-222ENST00000550996 SMC1BQ8NDV3 1235 aa26.53■■□□□ 1.84
CS-222ENST00000550996 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
CS-222ENST00000550996 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.53■■□□□ 1.84
CS-222ENST00000550996 CSF1RP07333 972 aa26.52■■□□□ 1.84
CS-222ENST00000550996 FAM161AQ3B820 660 aa26.52■■□□□ 1.84
CS-222ENST00000550996 TBC1D16Q8TBP0 767 aa26.52■■□□□ 1.84
CS-222ENST00000550996 PODXL2Q9NZ53 605 aa26.52■■□□□ 1.84
CS-222ENST00000550996 ZNRF3Q9ULT6 936 aa26.52■■□□□ 1.84
CS-222ENST00000550996 YDJCA8MPS7 323 aa26.51■■□□□ 1.83
CS-222ENST00000550996 FOXO4P98177 505 aa26.51■■□□□ 1.83
CS-222ENST00000550996 CXCL9Q07325 125 aa26.51■■□□□ 1.83
CS-222ENST00000550996 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CS-222ENST00000550996 IQCA1LA6NCM1 817 aa26.5■■□□□ 1.83
CS-222ENST00000550996 C6orf229H3BNL8 230 aa26.5■■□□□ 1.83
CS-222ENST00000550996 GRM8O00222 908 aa26.5■■□□□ 1.83
CS-222ENST00000550996 ALDH1L1O75891 902 aa26.5■■□□□ 1.83
CS-222ENST00000550996 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.5■■□□□ 1.83
CS-222ENST00000550996 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.5■■□□□ 1.83
CS-222ENST00000550996 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.5■■□□□ 1.83
CS-222ENST00000550996 MYH3P11055 1940 aa26.49■■□□□ 1.83
CS-222ENST00000550996 PTPRCP08575 1304 aa26.49■■□□□ 1.83
CS-222ENST00000550996 SCNN1DP51172 638 aa26.49■■□□□ 1.83
CS-222ENST00000550996 WASHC4Q2M389 1173 aa26.49■■□□□ 1.83
CS-222ENST00000550996 HACL1Q9UJ83 578 aa26.49■■□□□ 1.83
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CS-222ENST00000550996 RIMBP2O15034 1052 aa26.48■■□□□ 1.83
CS-222ENST00000550996 UFL1O94874 794 aa26.48■■□□□ 1.83
CS-222ENST00000550996 ITGA6P23229 1130 aa26.48■■□□□ 1.83
CS-222ENST00000550996 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.48■■□□□ 1.83
CS-222ENST00000550996 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
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