RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548847.1

SLC25A3-211, Transcript of solute carrier family 25 member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC25A3, Length 1,369 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A3-211ENST00000548847 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
SLC25A3-211ENST00000548847 H7C1W4 665 aa24.43■■□□□ 1.5
SLC25A3-211ENST00000548847 GCKRQ14397 625 aa24.43■■□□□ 1.5
SLC25A3-211ENST00000548847 PSMD1Q99460 953 aa24.43■■□□□ 1.5
SLC25A3-211ENST00000548847 PDE8AO60658 829 aa24.42■■□□□ 1.5
SLC25A3-211ENST00000548847 BEND3Q5T5X7 828 aa24.42■■□□□ 1.5
SLC25A3-211ENST00000548847 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
SLC25A3-211ENST00000548847 KIF3CO14782 793 aa24.42■■□□□ 1.5
SLC25A3-211ENST00000548847 CASP7P55210 303 aa24.42■■□□□ 1.5
SLC25A3-211ENST00000548847 NMRK2Q9NPI5 230 aa24.42■■□□□ 1.5
SLC25A3-211ENST00000548847 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.41■■□□□ 1.5
SLC25A3-211ENST00000548847 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
SLC25A3-211ENST00000548847 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.41■■□□□ 1.5
SLC25A3-211ENST00000548847 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.41■■□□□ 1.5
SLC25A3-211ENST00000548847 SP8Q8IXZ3 490 aa24.41■■□□□ 1.5
SLC25A3-211ENST00000548847 COL4A5P29400 1685 aa24.4■■□□□ 1.5
SLC25A3-211ENST00000548847 GRIPAP1Q4V328 841 aa24.4■■□□□ 1.5
SLC25A3-211ENST00000548847 BCL2L13Q9BXK5 485 aa24.4■■□□□ 1.5
SLC25A3-211ENST00000548847 IARSP41252 1262 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
SLC25A3-211ENST00000548847 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.39■■□□□ 1.49
SLC25A3-211ENST00000548847 MYH3P11055 1940 aa24.38■■□□□ 1.49
SLC25A3-211ENST00000548847 GLTPD2A6NH11 291 aa24.38■■□□□ 1.49
SLC25A3-211ENST00000548847 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SLC25A3-211ENST00000548847 CTSWP56202 376 aa24.38■■□□□ 1.49
SLC25A3-211ENST00000548847 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.38■■□□□ 1.49
SLC25A3-211ENST00000548847 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.38■■□□□ 1.49
SLC25A3-211ENST00000548847 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.37■■□□□ 1.49
SLC25A3-211ENST00000548847 TMC4Q7Z404 712 aa24.37■■□□□ 1.49
SLC25A3-211ENST00000548847 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.37■■□□□ 1.49
SLC25A3-211ENST00000548847 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SLC25A3-211ENST00000548847 DUOX1Q9NRD9 1551 aa24.37■■□□□ 1.49
SLC25A3-211ENST00000548847 PLA2G12BQ9BX93 195 aa24.36■■□□□ 1.49
SLC25A3-211ENST00000548847 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SLC25A3-211ENST00000548847 PTPRCP08575 1304 aa24.35■■□□□ 1.49
SLC25A3-211ENST00000548847 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
SLC25A3-211ENST00000548847 LTBP1Q14766 1721 aa24.34■■□□□ 1.49
SLC25A3-211ENST00000548847 C1QTNF8P60827 252 aa24.34■■□□□ 1.49
SLC25A3-211ENST00000548847 SMC4Q9NTJ3 1288 aa24.34■■□□□ 1.49
SLC25A3-211ENST00000548847 RTL9Q8NET4 1388 aa24.33■■□□□ 1.49
SLC25A3-211ENST00000548847 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.33■■□□□ 1.49
SLC25A3-211ENST00000548847 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
SLC25A3-211ENST00000548847 MPNDQ8N594 471 aa24.33■■□□□ 1.49
SLC25A3-211ENST00000548847 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
SLC25A3-211ENST00000548847 GREM2Q9H772 168 aa24.33■■□□□ 1.49
SLC25A3-211ENST00000548847 WDR90Q96KV7 1748 aa24.32■■□□□ 1.48
SLC25A3-211ENST00000548847 ZNF541Q9H0D2 1346 aa24.32■■□□□ 1.48
SLC25A3-211ENST00000548847 ALDH1L1O75891 902 aa24.32■■□□□ 1.48
SLC25A3-211ENST00000548847 RRAGCQ9HB90 399 aa24.32■■□□□ 1.48
SLC25A3-211ENST00000548847 FZD9O00144 591 aa24.31■■□□□ 1.48
SLC25A3-211ENST00000548847 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.31■■□□□ 1.48
SLC25A3-211ENST00000548847 POTECB2RU33 542 aa24.3■■□□□ 1.48
SLC25A3-211ENST00000548847 GRM8O00222 908 aa24.3■■□□□ 1.48
SLC25A3-211ENST00000548847 DDNO94850 711 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
SLC25A3-211ENST00000548847 CSF1RP07333 972 aa24.3■■□□□ 1.48
SLC25A3-211ENST00000548847 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SLC25A3-211ENST00000548847 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
SLC25A3-211ENST00000548847 DPY19L2Q6NUT2 758 aa24.3■■□□□ 1.48
SLC25A3-211ENST00000548847 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.3■■□□□ 1.48
SLC25A3-211ENST00000548847 GPSM2P81274 684 aa24.29■■□□□ 1.48
SLC25A3-211ENST00000548847 AOC3Q16853 763 aa24.29■■□□□ 1.48
SLC25A3-211ENST00000548847 LARGE2Q8N3Y3 721 aa24.29■■□□□ 1.48
SLC25A3-211ENST00000548847 PPIP5K2O43314 1243 aa24.29■■□□□ 1.48
SLC25A3-211ENST00000548847 FOXO4P98177 505 aa24.29■■□□□ 1.48
SLC25A3-211ENST00000548847 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.29■■□□□ 1.48
SLC25A3-211ENST00000548847 JDP2Q8WYK2 163 aa24.29■■□□□ 1.48
SLC25A3-211ENST00000548847 VPS33BQ9H267 617 aa24.29■■□□□ 1.48
SLC25A3-211ENST00000548847 FAM161AQ3B820 660 aa24.28■■□□□ 1.48
SLC25A3-211ENST00000548847 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24.28■■□□□ 1.48
SLC25A3-211ENST00000548847 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.28■■□□□ 1.48
SLC25A3-211ENST00000548847 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
SLC25A3-211ENST00000548847 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.27■■□□□ 1.48
SLC25A3-211ENST00000548847 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
SLC25A3-211ENST00000548847 POLLQ9UGP5 575 aa24.27■■□□□ 1.48
SLC25A3-211ENST00000548847 UTYO14607 1347 aa24.26■■□□□ 1.47
SLC25A3-211ENST00000548847 SPEF2Q9C093 1822 aa24.26■■□□□ 1.47
SLC25A3-211ENST00000548847 TOMM70O94826 608 aa24.26■■□□□ 1.47
SLC25A3-211ENST00000548847 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.26■■□□□ 1.47
SLC25A3-211ENST00000548847 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
SLC25A3-211ENST00000548847 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
SLC25A3-211ENST00000548847 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SLC25A3-211ENST00000548847 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SLC25A3-211ENST00000548847 ITGA6P23229 1130 aa24.25■■□□□ 1.47
SLC25A3-211ENST00000548847 KAZALD1Q96I82 304 aa24.25■■□□□ 1.47
SLC25A3-211ENST00000548847 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SLC25A3-211ENST00000548847 NIM1KQ8IY84 436 aa24.24■■□□□ 1.47
SLC25A3-211ENST00000548847 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24.24■■□□□ 1.47
SLC25A3-211ENST00000548847 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
SLC25A3-211ENST00000548847 GPC2Q8N158 579 aa24.22■■□□□ 1.47
SLC25A3-211ENST00000548847 SUCLG2Q96I99 432 aa24.22■■□□□ 1.47
SLC25A3-211ENST00000548847 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
SLC25A3-211ENST00000548847 C6orf229H3BNL8 230 aa24.21■■□□□ 1.47
SLC25A3-211ENST00000548847 EIF6P56537 245 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
SLC25A3-211ENST00000548847 LMBR1LQ6UX01 489 aa24.21■■□□□ 1.47
SLC25A3-211ENST00000548847 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
SLC25A3-211ENST00000548847 USP44Q9H0E7 712 aa24.21■■□□□ 1.47
SLC25A3-211ENST00000548847 ZNRF3Q9ULT6 936 aa24.21■■□□□ 1.47
SLC25A3-211ENST00000548847 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.21■■□□□ 1.47
SLC25A3-211ENST00000548847 SCN4AP35499 1836 aa24.2■■□□□ 1.46
SLC25A3-211ENST00000548847 WASHC4Q2M389 1173 aa24.2■■□□□ 1.46
SLC25A3-211ENST00000548847 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.1 ms