RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541935.5

EMP1-208, Transcript of epithelial membrane protein 1, human

TSL 2

Gene EMP1, Length 521 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EMP1-208	ENST00000541935	SUCLG2	Q96I99	432 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	STAP2	Q9UGK3	403 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	POTEB2	H3BUK9	544 aa		11.69	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	APBB1	O00213	710 aa		11.69	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	A1BG	P04217	495 aa		11.69	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	MX1	P20591	662 aa		11.69	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	BECN1	Q14457	450 aa		11.69	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		11.69	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		11.69	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	C8orf37	Q96NL8	207 aa		11.69	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		11.69	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		11.68	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	ITGB4	P16144	1822 aa		11.68	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	11.68	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	GPATCH3	Q96I76	525 aa		11.68	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		11.68	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		11.68	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935		A0A087WZG4	1122 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935		H7C1W4	665 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	EVI5	O60447	810 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	ZMYND10	O75800	440 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	TCIRG1	Q13488	830 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	USP21	Q9UK80	565 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		11.66	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		11.66	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	ERC2	O15083	957 aa		11.66	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	KAZALD1	Q96I82	304 aa		11.66	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		11.66	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	COPRS	Q9NQ92	184 aa		11.66	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		11.65	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	SDS	P20132	328 aa		11.65	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	CASP7	P55210	303 aa		11.65	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		11.65	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		11.65	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		11.65	□□□□□ -0.54
EMP1-208	ENST00000541935	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		11.64	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	REC8	O95072	547 aa		11.64	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		11.64	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	OSBP	P22059	807 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	SIK1	P57059	783 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	ATP6V1A	P38606	617 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	ILDR2	Q71H61	639 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	CNTROB	Q8N137	903 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	IL27	Q8NEV9	243 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	PALLD	Q8WX93	1383 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935		A0A0G2JS52	829 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	GPR37	O15354	613 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	HSPA1L	P34931	641 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EMP1-208	ENST00000541935	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55

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