RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528271.1

C2CD2L-204, Transcript of C2CD2 like, human

TSL 4

Gene C2CD2L, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C2CD2L-204	ENST00000528271	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		32.1	■■■□□ 2.73
C2CD2L-204	ENST00000528271	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		32.1	■■■□□ 2.73
C2CD2L-204	ENST00000528271	PDE8A	O60658	829 aa		32.09	■■■□□ 2.73
C2CD2L-204	ENST00000528271	GRAP	Q13588	217 aa		32.08	■■■□□ 2.73
C2CD2L-204	ENST00000528271	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		32.08	■■■□□ 2.73
C2CD2L-204	ENST00000528271	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
C2CD2L-204	ENST00000528271		H7C1W4	665 aa		32.07	■■■□□ 2.72
C2CD2L-204	ENST00000528271	BBOX1	O75936	387 aa		32.07	■■■□□ 2.72
C2CD2L-204	ENST00000528271	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
C2CD2L-204	ENST00000528271	COL4A1	P02462	1669 aa		32.06	■■■□□ 2.72
C2CD2L-204	ENST00000528271	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	32.06	■■■□□ 2.72
C2CD2L-204	ENST00000528271	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		32.06	■■■□□ 2.72
C2CD2L-204	ENST00000528271	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		32.05	■■■□□ 2.72
C2CD2L-204	ENST00000528271	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		32.04	■■■□□ 2.72
C2CD2L-204	ENST00000528271	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		32.04	■■■□□ 2.72
C2CD2L-204	ENST00000528271	ALDH1L1	O75891	902 aa		32.03	■■■□□ 2.72
C2CD2L-204	ENST00000528271	CTSW	P56202	376 aa		32.03	■■■□□ 2.72
C2CD2L-204	ENST00000528271	TMC4	Q7Z404	712 aa		32.03	■■■□□ 2.72
C2CD2L-204	ENST00000528271	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
C2CD2L-204	ENST00000528271	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
C2CD2L-204	ENST00000528271	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
C2CD2L-204	ENST00000528271	CASP7	P55210	303 aa		32.02	■■■□□ 2.72
C2CD2L-204	ENST00000528271	SLC51A	Q86UW1	340 aa		32.02	■■■□□ 2.72
C2CD2L-204	ENST00000528271	PSMD1	Q99460	953 aa		32.02	■■■□□ 2.72
C2CD2L-204	ENST00000528271	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		32.02	■■■□□ 2.72
C2CD2L-204	ENST00000528271	SPEF2	Q9C093	1822 aa		32.01	■■■□□ 2.72
C2CD2L-204	ENST00000528271	SP8	Q8IXZ3	490 aa		32.01	■■■□□ 2.71
C2CD2L-204	ENST00000528271	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.71
C2CD2L-204	ENST00000528271	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		32.01	■■■□□ 2.71
C2CD2L-204	ENST00000528271	RTL9	Q8NET4	1388 aa		31.98	■■■□□ 2.71
C2CD2L-204	ENST00000528271	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		31.98	■■■□□ 2.71
C2CD2L-204	ENST00000528271	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
C2CD2L-204	ENST00000528271	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
C2CD2L-204	ENST00000528271	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		31.98	■■■□□ 2.71
C2CD2L-204	ENST00000528271	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
C2CD2L-204	ENST00000528271	GRM8	O00222	908 aa		31.97	■■■□□ 2.71
C2CD2L-204	ENST00000528271	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
C2CD2L-204	ENST00000528271	KIF16B	Q96L93	1317 aa		31.97	■■■□□ 2.71
C2CD2L-204	ENST00000528271	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	31.96	■■■□□ 2.71
C2CD2L-204	ENST00000528271	LTBP1	Q14766	1721 aa		31.96	■■■□□ 2.71
C2CD2L-204	ENST00000528271	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.71
C2CD2L-204	ENST00000528271	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	31.95	■■■□□ 2.71
C2CD2L-204	ENST00000528271	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		31.94	■■■□□ 2.7
C2CD2L-204	ENST00000528271	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
C2CD2L-204	ENST00000528271	GREM2	Q9H772	168 aa		31.93	■■■□□ 2.7
C2CD2L-204	ENST00000528271	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
C2CD2L-204	ENST00000528271	MPND	Q8N594	471 aa		31.92	■■■□□ 2.7
C2CD2L-204	ENST00000528271	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
C2CD2L-204	ENST00000528271	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
C2CD2L-204	ENST00000528271	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
C2CD2L-204	ENST00000528271	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		31.92	■■■□□ 2.7
C2CD2L-204	ENST00000528271	CSF1R	P07333	972 aa		31.9	■■■□□ 2.7
C2CD2L-204	ENST00000528271	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		31.9	■■■□□ 2.7
C2CD2L-204	ENST00000528271	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		31.9	■■■□□ 2.7
C2CD2L-204	ENST00000528271	UTY	O14607	1347 aa		31.9	■■■□□ 2.7
C2CD2L-204	ENST00000528271	COL4A5	P29400	1685 aa		31.89	■■■□□ 2.7
C2CD2L-204	ENST00000528271	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		31.89	■■■□□ 2.7
C2CD2L-204	ENST00000528271	GLTPD2	A6NH11	291 aa		31.88	■■■□□ 2.69
C2CD2L-204	ENST00000528271	FOXO4	P98177	505 aa		31.88	■■■□□ 2.69
C2CD2L-204	ENST00000528271	FAM161A	Q3B820	660 aa		31.88	■■■□□ 2.69
C2CD2L-204	ENST00000528271	VPS33B	Q9H267	617 aa		31.87	■■■□□ 2.69
C2CD2L-204	ENST00000528271	WDR90	Q96KV7	1748 aa		31.86	■■■□□ 2.69
C2CD2L-204	ENST00000528271	BCAR3	O75815	825 aa		31.86	■■■□□ 2.69
C2CD2L-204	ENST00000528271	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	31.86	■■■□□ 2.69
C2CD2L-204	ENST00000528271	ITGA6	P23229	1130 aa		31.86	■■■□□ 2.69
C2CD2L-204	ENST00000528271	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	31.86	■■■□□ 2.69
C2CD2L-204	ENST00000528271	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		31.85	■■■□□ 2.69
C2CD2L-204	ENST00000528271	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		31.85	■■■□□ 2.69
C2CD2L-204	ENST00000528271	JDP2	Q8WYK2	163 aa		31.85	■■■□□ 2.69
C2CD2L-204	ENST00000528271	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
C2CD2L-204	ENST00000528271	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
C2CD2L-204	ENST00000528271	PPIP5K2	O43314	1243 aa		31.84	■■■□□ 2.69
C2CD2L-204	ENST00000528271	GPSM2	P81274	684 aa		31.84	■■■□□ 2.69
C2CD2L-204	ENST00000528271	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		31.84	■■■□□ 2.69
C2CD2L-204	ENST00000528271	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		31.84	■■■□□ 2.69
C2CD2L-204	ENST00000528271	AOC3	Q16853	763 aa		31.83	■■■□□ 2.69
C2CD2L-204	ENST00000528271	SUCLG2	Q96I99	432 aa		31.83	■■■□□ 2.69
C2CD2L-204	ENST00000528271	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
C2CD2L-204	ENST00000528271	FZD9	O00144	591 aa		31.82	■■■□□ 2.68
C2CD2L-204	ENST00000528271	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		31.82	■■■□□ 2.68
C2CD2L-204	ENST00000528271	USP44	Q9H0E7	712 aa		31.82	■■■□□ 2.68
C2CD2L-204	ENST00000528271	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		31.82	■■■□□ 2.68
C2CD2L-204	ENST00000528271		A0A1B0GUL6	1792 aa		31.81	■■■□□ 2.68
C2CD2L-204	ENST00000528271	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		31.81	■■■□□ 2.68
C2CD2L-204	ENST00000528271	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
C2CD2L-204	ENST00000528271	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		31.81	■■■□□ 2.68
C2CD2L-204	ENST00000528271	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
C2CD2L-204	ENST00000528271	KAZALD1	Q96I82	304 aa		31.81	■■■□□ 2.68
C2CD2L-204	ENST00000528271	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		31.81	■■■□□ 2.68
C2CD2L-204	ENST00000528271	KIF3C	O14782	793 aa		31.8	■■■□□ 2.68
C2CD2L-204	ENST00000528271	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
C2CD2L-204	ENST00000528271	NIM1K	Q8IY84	436 aa		31.8	■■■□□ 2.68
C2CD2L-204	ENST00000528271	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		31.8	■■■□□ 2.68
C2CD2L-204	ENST00000528271	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		31.79	■■■□□ 2.68
C2CD2L-204	ENST00000528271	TRIM27	P14373	513 aa		31.79	■■■□□ 2.68
C2CD2L-204	ENST00000528271	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		31.79	■■■□□ 2.68
C2CD2L-204	ENST00000528271	POLL	Q9UGP5	575 aa		31.79	■■■□□ 2.68
C2CD2L-204	ENST00000528271	SCN4A	P35499	1836 aa		31.79	■■■□□ 2.68
C2CD2L-204	ENST00000528271	XDH	P47989	1333 aa		31.78	■■■□□ 2.68
C2CD2L-204	ENST00000528271	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		31.78	■■■□□ 2.68

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