RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527871.5

RPS2-208, Transcript of ribosomal protein S2, human

TSL 1 (best)

Gene RPS2, Length 1,243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS2-208	ENST00000527871	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	31.62	■■■□□ 2.65
RPS2-208	ENST00000527871	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	31.61	■■■□□ 2.65
RPS2-208	ENST00000527871	MPND	Q8N594	471 aa		31.61	■■■□□ 2.65
RPS2-208	ENST00000527871	TAF1	P21675	1872 aa		31.61	■■■□□ 2.65
RPS2-208	ENST00000527871	GNAI1	P63096	354 aa		31.6	■■■□□ 2.65
RPS2-208	ENST00000527871	CXCL9	Q07325	125 aa		31.6	■■■□□ 2.65
RPS2-208	ENST00000527871	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	31.6	■■■□□ 2.65
RPS2-208	ENST00000527871	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		31.6	■■■□□ 2.65
RPS2-208	ENST00000527871	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		31.6	■■■□□ 2.65
RPS2-208	ENST00000527871	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		31.59	■■■□□ 2.65
RPS2-208	ENST00000527871	CCDC184	Q52MB2	194 aa		31.59	■■■□□ 2.65
RPS2-208	ENST00000527871	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	31.59	■■■□□ 2.65
RPS2-208	ENST00000527871	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	31.58	■■■□□ 2.65
RPS2-208	ENST00000527871	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		31.58	■■■□□ 2.65
RPS2-208	ENST00000527871	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	31.57	■■■□□ 2.64
RPS2-208	ENST00000527871	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	31.57	■■■□□ 2.64
RPS2-208	ENST00000527871	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	31.57	■■■□□ 2.64
RPS2-208	ENST00000527871	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	31.56	■■■□□ 2.64
RPS2-208	ENST00000527871	TMC4	Q7Z404	712 aa		31.56	■■■□□ 2.64
RPS2-208	ENST00000527871	VEGFB	P49765	207 aa		31.55	■■■□□ 2.64
RPS2-208	ENST00000527871	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	31.55	■■■□□ 2.64
RPS2-208	ENST00000527871	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		31.55	■■■□□ 2.64
RPS2-208	ENST00000527871	COL4A1	P02462	1669 aa		31.54	■■■□□ 2.64
RPS2-208	ENST00000527871	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		31.53	■■■□□ 2.64
RPS2-208	ENST00000527871	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	31.53	■■■□□ 2.64
RPS2-208	ENST00000527871	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	31.53	■■■□□ 2.64
RPS2-208	ENST00000527871	RASSF10	A6NK89	507 aa		31.52	■■■□□ 2.64
RPS2-208	ENST00000527871	YDJC	A8MPS7	323 aa		31.52	■■■□□ 2.64
RPS2-208	ENST00000527871	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	31.52	■■■□□ 2.64
RPS2-208	ENST00000527871	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		31.52	■■■□□ 2.64
RPS2-208	ENST00000527871	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	31.51	■■■□□ 2.63
RPS2-208	ENST00000527871	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	31.5	■■■□□ 2.63
RPS2-208	ENST00000527871	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		31.5	■■■□□ 2.63
RPS2-208	ENST00000527871	TSPYL6	Q8N831	410 aa		31.5	■■■□□ 2.63
RPS2-208	ENST00000527871	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	31.5	■■■□□ 2.63
RPS2-208	ENST00000527871	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		31.49	■■■□□ 2.63
RPS2-208	ENST00000527871	RAD17	O75943	681 aa		31.49	■■■□□ 2.63
RPS2-208	ENST00000527871	GOLGA2	Q08379	1002 aa		31.48	■■■□□ 2.63
RPS2-208	ENST00000527871	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		31.47	■■■□□ 2.63
RPS2-208	ENST00000527871	CST9	Q5W186	159 aa		31.47	■■■□□ 2.63
RPS2-208	ENST00000527871	MYD88	Q99836	296 aa		31.47	■■■□□ 2.63
RPS2-208	ENST00000527871	POLL	Q9UGP5	575 aa		31.47	■■■□□ 2.63
RPS2-208	ENST00000527871	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		31.47	■■■□□ 2.63
RPS2-208	ENST00000527871	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	31.47	■■■□□ 2.63
RPS2-208	ENST00000527871	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	31.46	■■■□□ 2.63
RPS2-208	ENST00000527871	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	31.46	■■■□□ 2.63
RPS2-208	ENST00000527871	GPSM2	P81274	684 aa		31.46	■■■□□ 2.63
RPS2-208	ENST00000527871	TNS4	Q8IZW8	715 aa		31.46	■■■□□ 2.63
RPS2-208	ENST00000527871	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		31.46	■■■□□ 2.63
RPS2-208	ENST00000527871	TRAF5	O00463	557 aa		31.45	■■■□□ 2.63
RPS2-208	ENST00000527871	FOXN1	O15353	648 aa		31.45	■■■□□ 2.63
RPS2-208	ENST00000527871	TNIP1	Q15025	636 aa		31.45	■■■□□ 2.63
RPS2-208	ENST00000527871	CCDC27	Q2M243	656 aa		31.44	■■■□□ 2.62
RPS2-208	ENST00000527871	WASHC4	Q2M389	1173 aa		31.44	■■■□□ 2.62
RPS2-208	ENST00000527871	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		31.44	■■■□□ 2.62
RPS2-208	ENST00000527871	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
RPS2-208	ENST00000527871	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		31.44	■■■□□ 2.62
RPS2-208	ENST00000527871	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		31.44	■■■□□ 2.62
RPS2-208	ENST00000527871	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
RPS2-208	ENST00000527871	WBP1L	Q9NX94	342 aa		31.43	■■■□□ 2.62
RPS2-208	ENST00000527871	SHTN1	A0MZ66	631 aa		31.42	■■■□□ 2.62
RPS2-208	ENST00000527871	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	31.42	■■■□□ 2.62
RPS2-208	ENST00000527871	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	31.42	■■■□□ 2.62
RPS2-208	ENST00000527871	WWC1	Q8IX03	1113 aa		31.41	■■■□□ 2.62
RPS2-208	ENST00000527871	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	31.41	■■■□□ 2.62
RPS2-208	ENST00000527871	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		31.4	■■■□□ 2.62
RPS2-208	ENST00000527871	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		31.4	■■■□□ 2.62
RPS2-208	ENST00000527871	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		31.4	■■■□□ 2.62
RPS2-208	ENST00000527871	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		31.4	■■■□□ 2.62
RPS2-208	ENST00000527871	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		31.4	■■■□□ 2.62
RPS2-208	ENST00000527871	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		31.4	■■■□□ 2.62
RPS2-208	ENST00000527871	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	31.4	■■■□□ 2.62
RPS2-208	ENST00000527871	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		31.4	■■■□□ 2.62
RPS2-208	ENST00000527871	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	31.4	■■■□□ 2.62
RPS2-208	ENST00000527871	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	31.4	■■■□□ 2.62
RPS2-208	ENST00000527871	RIMBP2	O15034	1052 aa		31.39	■■■□□ 2.62
RPS2-208	ENST00000527871	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	31.39	■■■□□ 2.62
RPS2-208	ENST00000527871	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	31.39	■■■□□ 2.62
RPS2-208	ENST00000527871	C6orf229	H3BNL8	230 aa		31.38	■■■□□ 2.61
RPS2-208	ENST00000527871	PSMD14	O00487	310 aa		31.38	■■■□□ 2.61
RPS2-208	ENST00000527871	DPF2	Q92785	391 aa		31.38	■■■□□ 2.61
RPS2-208	ENST00000527871	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		31.38	■■■□□ 2.61
RPS2-208	ENST00000527871	PDE8A	O60658	829 aa		31.37	■■■□□ 2.61
RPS2-208	ENST00000527871	IGKV5-2	P06315	115 aa		31.37	■■■□□ 2.61
RPS2-208	ENST00000527871	KSR2	Q6VAB6	950 aa		31.37	■■■□□ 2.61
RPS2-208	ENST00000527871	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	31.37	■■■□□ 2.61
RPS2-208	ENST00000527871	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		31.36	■■■□□ 2.61
RPS2-208	ENST00000527871	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	31.36	■■■□□ 2.61
RPS2-208	ENST00000527871	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	31.36	■■■□□ 2.61
RPS2-208	ENST00000527871	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	31.36	■■■□□ 2.61
RPS2-208	ENST00000527871	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		31.36	■■■□□ 2.61
RPS2-208	ENST00000527871	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	31.36	■■■□□ 2.61
RPS2-208	ENST00000527871	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		31.36	■■■□□ 2.61
RPS2-208	ENST00000527871	RTL9	Q8NET4	1388 aa		31.35	■■■□□ 2.61
RPS2-208	ENST00000527871	DOK7	Q18PE1	504 aa		31.35	■■■□□ 2.61
RPS2-208	ENST00000527871	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		31.35	■■■□□ 2.61
RPS2-208	ENST00000527871	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		31.35	■■■□□ 2.61
RPS2-208	ENST00000527871	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		31.34	■■■□□ 2.61
RPS2-208	ENST00000527871	G2E3	Q7L622	706 aa		31.34	■■■□□ 2.61
RPS2-208	ENST00000527871	MICALL2	Q8IY33	904 aa		31.34	■■■□□ 2.61

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