RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527622.5

CTTN-211, Transcript of cortactin, humanhuman

TSL 4

Gene CTTN, Length 597 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTN-211ENST00000527622 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 VPS33BQ9H267 617 aa24.39■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 CREBZFQ9NS37 354 aa24.39■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 WWC1Q8IX03 1113 aa24.38■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 TRPM7Q96QT4 1865 aa24.37■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 GOLGA2Q08379 1002 aa24.37■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 NIM1KQ8IY84 436 aa24.37■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 GJA3Q9Y6H8 435 aa24.37■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.36■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 IFFO2Q5TF58 517 aa24.36■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.36■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 MPNDQ8N594 471 aa24.36■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 SCN9AQ15858 1988 aa24.36■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 TMC4Q7Z404 712 aa24.35■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.35■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 EPS15P42566 896 aa24.34■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 CXCL9Q07325 125 aa24.34■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.34■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 MYD88Q99836 296 aa24.34■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 MRS2Q9HD23 443 aa24.33■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 ZNRF3Q9ULT6 936 aa24.33■■□□□ 1.49
CTTN-211ENST00000527622 SPEF2Q9C093 1822 aa24.33■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 IL16Q14005 1332 aa24.33■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 CNTNAP1P78357 1384 aa24.32■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 YDJCA8MPS7 323 aa24.32■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 CCDC191Q8NCU4 936 aa24.32■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 PSME4Q14997 1843 aa24.32■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 CNTROBQ8N137 903 aa24.3■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 GPRC5DQ9NZD1 345 aa24.3■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 IGKV5-2P06315 115 aa24.29■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.29■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 CLEC11AQ9Y240 323 aa24.29■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 GPSM2P81274 684 aa24.28■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 G2E3Q7L622 706 aa24.28■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 POLLQ9UGP5 575 aa24.28■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.28■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.28■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.27■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 TMEM88BA6NKF7 163 aa24.27■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 ANP32CO43423 234 aa24.27■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 KSR2Q6VAB6 950 aa24.27■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.27■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.27■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24.27■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 THSD7BQ9C0I4 1608 aa24.27■■□□□ 1.48
CTTN-211ENST00000527622 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
CTTN-211ENST00000527622 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
CTTN-211ENST00000527622 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
CTTN-211ENST00000527622 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
CTTN-211ENST00000527622 CIAPIN1Q6FI81 312 aa24.26■■□□□ 1.47
CTTN-211ENST00000527622 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CTTN-211ENST00000527622 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CTTN-211ENST00000527622 RAD17O75943 681 aa24.25■■□□□ 1.47
CTTN-211ENST00000527622 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CTTN-211ENST00000527622 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CTTN-211ENST00000527622 PDE8AO60658 829 aa24.24■■□□□ 1.47
CTTN-211ENST00000527622 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP24.24■■□□□ 1.473e-10■■■■□ 21.6
CTTN-211ENST00000527622 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
CTTN-211ENST00000527622 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24.23■■□□□ 1.47
CTTN-211ENST00000527622 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
CTTN-211ENST00000527622 STK31Q9BXU1 1019 aa24.23■■□□□ 1.47
CTTN-211ENST00000527622 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.23■■□□□ 1.47
CTTN-211ENST00000527622 RTL9Q8NET4 1388 aa24.22■■□□□ 1.47
CTTN-211ENST00000527622 SHTN1A0MZ66 631 aa24.22■■□□□ 1.47
CTTN-211ENST00000527622 WASHC4Q2M389 1173 aa24.22■■□□□ 1.47
CTTN-211ENST00000527622 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.22■■□□□ 1.47
CTTN-211ENST00000527622 RASSF10A6NK89 507 aa24.21■■□□□ 1.47
CTTN-211ENST00000527622 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.21■■□□□ 1.47
CTTN-211ENST00000527622 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
CTTN-211ENST00000527622 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
CTTN-211ENST00000527622 WDR63Q8IWG1 891 aa24.21■■□□□ 1.47
CTTN-211ENST00000527622 DBNDD1Q9H9R9 158 aa24.21■■□□□ 1.47
CTTN-211ENST00000527622 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
CTTN-211ENST00000527622 SLC4A2P04920 1241 aa24.2■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 VEGFBP49765 207 aa24.2■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 TNIP1Q15025 636 aa24.2■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 TRPM4Q8TD43 1214 aa24.2■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 PGAP2Q9UHJ9 254 aa24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms