RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508148.1

MIB2-223, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 4

Gene MIB2, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-223	ENST00000508148	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		21.56	■■□□□ 1.04
MIB2-223	ENST00000508148	RASSF10	A6NK89	507 aa		21.55	■■□□□ 1.04
MIB2-223	ENST00000508148	GRAP	Q13588	217 aa		21.55	■■□□□ 1.04
MIB2-223	ENST00000508148	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		21.55	■■□□□ 1.04
MIB2-223	ENST00000508148	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	21.55	■■□□□ 1.04
MIB2-223	ENST00000508148	MBIP	Q9NS73	344 aa		21.55	■■□□□ 1.04
MIB2-223	ENST00000508148	BBOX1	O75936	387 aa		21.54	■■□□□ 1.04
MIB2-223	ENST00000508148	HOXB7	P09629	217 aa		21.54	■■□□□ 1.04
MIB2-223	ENST00000508148	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		21.53	■■□□□ 1.04
MIB2-223	ENST00000508148	TRAF5	O00463	557 aa		21.53	■■□□□ 1.04
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF853	P0CG23	659 aa		21.53	■■□□□ 1.04
MIB2-223	ENST00000508148	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	21.53	■■□□□ 1.04
MIB2-223	ENST00000508148	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		21.53	■■□□□ 1.04
MIB2-223	ENST00000508148	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		21.53	■■□□□ 1.04
MIB2-223	ENST00000508148	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	21.53	■■□□□ 1.04
MIB2-223	ENST00000508148	MPND	Q8N594	471 aa		21.53	■■□□□ 1.04
MIB2-223	ENST00000508148	CFAP44	Q96MT7	982 aa		21.53	■■□□□ 1.04
MIB2-223	ENST00000508148	VPS33B	Q9H267	617 aa		21.53	■■□□□ 1.04
MIB2-223	ENST00000508148	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		21.53	■■□□□ 1.04
MIB2-223	ENST00000508148	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		21.53	■■□□□ 1.04
MIB2-223	ENST00000508148	YDJC	A8MPS7	323 aa		21.52	■■□□□ 1.04
MIB2-223	ENST00000508148	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	21.52	■■□□□ 1.04
MIB2-223	ENST00000508148	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		21.52	■■□□□ 1.04
MIB2-223	ENST00000508148	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	21.52	■■□□□ 1.04
MIB2-223	ENST00000508148	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	21.52	■■□□□ 1.04
MIB2-223	ENST00000508148	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		21.52	■■□□□ 1.04
MIB2-223	ENST00000508148	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		21.52	■■□□□ 1.04
MIB2-223	ENST00000508148	FAM89A	Q96GI7	184 aa		21.52	■■□□□ 1.04
MIB2-223	ENST00000508148	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	21.52	■■□□□ 1.04
MIB2-223	ENST00000508148	SCN9A	Q15858	1988 aa		21.51	■■□□□ 1.03
MIB2-223	ENST00000508148	CCER2	I3L3R5	266 aa		21.51	■■□□□ 1.03
MIB2-223	ENST00000508148	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	21.51	■■□□□ 1.03
MIB2-223	ENST00000508148	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		21.51	■■□□□ 1.03
MIB2-223	ENST00000508148	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	21.51	■■□□□ 1.03
MIB2-223	ENST00000508148	WBP1L	Q9NX94	342 aa		21.51	■■□□□ 1.03
MIB2-223	ENST00000508148	SHTN1	A0MZ66	631 aa		21.5	■■□□□ 1.03
MIB2-223	ENST00000508148	CST9	Q5W186	159 aa		21.5	■■□□□ 1.03
MIB2-223	ENST00000508148	RAD17	O75943	681 aa		21.49	■■□□□ 1.03
MIB2-223	ENST00000508148	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	21.49	■■□□□ 1.03
MIB2-223	ENST00000508148	CCDC27	Q2M243	656 aa		21.49	■■□□□ 1.03
MIB2-223	ENST00000508148	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	21.49	■■□□□ 1.03
MIB2-223	ENST00000508148	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	21.49	■■□□□ 1.03
MIB2-223	ENST00000508148	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	21.49	■■□□□ 1.03
MIB2-223	ENST00000508148	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	21.49	■■□□□ 1.03
MIB2-223	ENST00000508148	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	21.49	■■□□□ 1.03
MIB2-223	ENST00000508148	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	21.49	■■□□□ 1.03
MIB2-223	ENST00000508148	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	21.48	■■□□□ 1.03
MIB2-223	ENST00000508148	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		21.48	■■□□□ 1.03
MIB2-223	ENST00000508148	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	21.48	■■□□□ 1.03
MIB2-223	ENST00000508148	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	21.48	■■□□□ 1.03
MIB2-223	ENST00000508148	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		21.47	■■□□□ 1.03
MIB2-223	ENST00000508148	HYPK	Q9NX55	129 aa		21.47	■■□□□ 1.03
MIB2-223	ENST00000508148	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		21.46	■■□□□ 1.03
MIB2-223	ENST00000508148	IFT57	Q9NWB7	429 aa		21.46	■■□□□ 1.03
MIB2-223	ENST00000508148	PSME4	Q14997	1843 aa		21.45	■■□□□ 1.03
MIB2-223	ENST00000508148	SPEF2	Q9C093	1822 aa		21.45	■■□□□ 1.03
MIB2-223	ENST00000508148	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	21.45	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	GPSM2	P81274	684 aa		21.45	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	21.45	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	21.45	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	POLL	Q9UGP5	575 aa		21.45	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		21.45	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	21.44	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	21.44	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	21.44	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	LBX1	P52954	281 aa		21.44	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	GNAI1	P63096	354 aa		21.44	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		21.44	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	TMC4	Q7Z404	712 aa		21.44	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		21.44	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	21.44	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		21.44	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		21.44	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	MYH3	P11055	1940 aa		21.43	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	WWC1	Q8IX03	1113 aa		21.43	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	AIDA	Q96BJ3	306 aa		21.43	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	CAPNS2	Q96L46	248 aa		21.43	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		21.43	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	21.43	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	RTL9	Q8NET4	1388 aa		21.42	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		21.42	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		21.42	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	21.42	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	21.41	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	PSMD14	O00487	310 aa		21.41	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	RIMBP2	O15034	1052 aa		21.41	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	TNIP1	Q15025	636 aa		21.41	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		21.41	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	MYD88	Q99836	296 aa		21.41	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		21.41	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	IL16	Q14005	1332 aa		21.4	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	EGFR	P00533	1210 aa		21.4	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	GOLGA2	Q08379	1002 aa		21.4	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	WASHC4	Q2M389	1173 aa		21.4	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	DLK2	Q6UY11	383 aa		21.4	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	MICALL2	Q8IY33	904 aa		21.4	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	TSPYL6	Q8N831	410 aa		21.4	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	21.4	■■□□□ 1.02
MIB2-223	ENST00000508148	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	21.4	■■□□□ 1.02

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