RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC30Q5VVM6 783 aa35.94■■■■□ 3.34
HOXB3-211ENST00000490677 VPS33BQ9H267 617 aa35.94■■■■□ 3.34
HOXB3-211ENST00000490677 MYH3P11055 1940 aa35.93■■■■□ 3.34
HOXB3-211ENST00000490677 IL16Q14005 1332 aa35.93■■■■□ 3.34
HOXB3-211ENST00000490677 EPHX2P34913 555 aa35.93■■■■□ 3.34
HOXB3-211ENST00000490677 AOC3Q16853 763 aa35.93■■■■□ 3.34
HOXB3-211ENST00000490677 PPIP5K2O43314 1243 aa35.92■■■■□ 3.34
HOXB3-211ENST00000490677 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
HOXB3-211ENST00000490677 PASKQ96RG2 1323 aa35.91■■■■□ 3.34
HOXB3-211ENST00000490677 EIF6P56537 245 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
HOXB3-211ENST00000490677 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
HOXB3-211ENST00000490677 MYD88Q99836 296 aa35.91■■■■□ 3.34
HOXB3-211ENST00000490677 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
HOXB3-211ENST00000490677 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
HOXB3-211ENST00000490677 SCNN1DP51172 638 aa35.89■■■■□ 3.34
HOXB3-211ENST00000490677 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
HOXB3-211ENST00000490677 NIM1KQ8IY84 436 aa35.89■■■■□ 3.34
HOXB3-211ENST00000490677 MPNDQ8N594 471 aa35.89■■■■□ 3.34
HOXB3-211ENST00000490677 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
HOXB3-211ENST00000490677 TMC4Q7Z404 712 aa35.88■■■■□ 3.33
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC191Q8NCU4 936 aa35.88■■■■□ 3.33
HOXB3-211ENST00000490677 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
HOXB3-211ENST00000490677 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
HOXB3-211ENST00000490677 GJA3Q9Y6H8 435 aa35.88■■■■□ 3.33
HOXB3-211ENST00000490677 SUPT20HQ8NEM7 779 aa35.87■■■■□ 3.33
HOXB3-211ENST00000490677 KIAA2012Q0VF49 1180 aa35.86■■■■□ 3.33
HOXB3-211ENST00000490677 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
HOXB3-211ENST00000490677 CHMP4AQ9BY43 222 aa35.86■■■■□ 3.33
HOXB3-211ENST00000490677 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
HOXB3-211ENST00000490677 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
HOXB3-211ENST00000490677 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
HOXB3-211ENST00000490677 ZNRF3Q9ULT6 936 aa35.84■■■■□ 3.33
HOXB3-211ENST00000490677 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa35.84■■■■□ 3.33
HOXB3-211ENST00000490677 FANCIQ9NVI1 1328 aa35.83■■■■□ 3.33
HOXB3-211ENST00000490677 CXCL9Q07325 125 aa35.83■■■■□ 3.33
HOXB3-211ENST00000490677 G2E3Q7L622 706 aa35.83■■■■□ 3.33
HOXB3-211ENST00000490677 CREBZFQ9NS37 354 aa35.83■■■■□ 3.33
HOXB3-211ENST00000490677 DDX58O95786 925 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.32
HOXB3-211ENST00000490677 IGKV5-2P06315 115 aa35.82■■■■□ 3.32
HOXB3-211ENST00000490677 EPS15P42566 896 aa35.82■■■■□ 3.32
HOXB3-211ENST00000490677 KSR2Q6VAB6 950 aa35.82■■■■□ 3.32
HOXB3-211ENST00000490677 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
HOXB3-211ENST00000490677 SPEF2Q9C093 1822 aa35.82■■■■□ 3.32
HOXB3-211ENST00000490677 PI4KAP2A4QPH2 592 aa35.81■■■■□ 3.32
HOXB3-211ENST00000490677 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa35.81■■■■□ 3.32
HOXB3-211ENST00000490677 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
HOXB3-211ENST00000490677 SCN9AQ15858 1988 aa35.8■■■■□ 3.32
HOXB3-211ENST00000490677 TRPM7Q96QT4 1865 aa35.8■■■■□ 3.32
HOXB3-211ENST00000490677 YDJCA8MPS7 323 aa35.79■■■■□ 3.32
HOXB3-211ENST00000490677 WDR63Q8IWG1 891 aa35.79■■■■□ 3.32
HOXB3-211ENST00000490677 SEC31BQ9NQW1 1179 aa35.79■■■■□ 3.32
HOXB3-211ENST00000490677 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
HOXB3-211ENST00000490677 STK31Q9BXU1 1019 aa35.78■■■■□ 3.32
HOXB3-211ENST00000490677 RPS8P62241 208 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
HOXB3-211ENST00000490677 GPSM2P81274 684 aa35.77■■■■□ 3.32
HOXB3-211ENST00000490677 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
HOXB3-211ENST00000490677 POLLQ9UGP5 575 aa35.77■■■■□ 3.32
HOXB3-211ENST00000490677 CLEC11AQ9Y240 323 aa35.77■■■■□ 3.32
HOXB3-211ENST00000490677 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
HOXB3-211ENST00000490677 CDHR2Q9BYE9 1310 aa35.77■■■■□ 3.32
HOXB3-211ENST00000490677 PDE8AO60658 829 aa35.76■■■■□ 3.32
HOXB3-211ENST00000490677 GPRC5DQ9NZD1 345 aa35.76■■■■□ 3.32
HOXB3-211ENST00000490677 SLC4A2P04920 1241 aa35.75■■■■□ 3.31
HOXB3-211ENST00000490677 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
HOXB3-211ENST00000490677 CNTROBQ8N137 903 aa35.75■■■■□ 3.31
HOXB3-211ENST00000490677 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
HOXB3-211ENST00000490677 PSME4Q14997 1843 aa35.75■■■■□ 3.31
HOXB3-211ENST00000490677 VAMP4O75379 141 aa35.73■■■■□ 3.31
HOXB3-211ENST00000490677 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
HOXB3-211ENST00000490677 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
HOXB3-211ENST00000490677 CIAPIN1Q6FI81 312 aa35.72■■■■□ 3.31
HOXB3-211ENST00000490677 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
HOXB3-211ENST00000490677 NEURL1BA8MQ27 555 aa35.71■■■■□ 3.31
HOXB3-211ENST00000490677 RAD17O75943 681 aa35.71■■■■□ 3.31
HOXB3-211ENST00000490677 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP35.71■■■■□ 3.31
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC152Q4G0S7 254 aa35.71■■■■□ 3.31
HOXB3-211ENST00000490677 CNTNAP1P78357 1384 aa35.7■■■■□ 3.31
HOXB3-211ENST00000490677 WASHC4Q2M389 1173 aa35.7■■■■□ 3.31
HOXB3-211ENST00000490677 PODXL2Q9NZ53 605 aa35.7■■■■□ 3.31
HOXB3-211ENST00000490677 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
HOXB3-211ENST00000490677 FLIIQ13045 1269 aa35.69■■■■□ 3.3
HOXB3-211ENST00000490677 TBC1D16Q8TBP0 767 aa35.69■■■■□ 3.3
HOXB3-211ENST00000490677 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM88BA6NKF7 163 aa35.68■■■■□ 3.3
HOXB3-211ENST00000490677 FAM9BQ8IZU0 186 aa35.68■■■■□ 3.3
HOXB3-211ENST00000490677 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
HOXB3-211ENST00000490677 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
HOXB3-211ENST00000490677 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
HOXB3-211ENST00000490677 C6orf229H3BNL8 230 aa35.66■■■■□ 3.3
HOXB3-211ENST00000490677 CTSWP56202 376 aa35.66■■■■□ 3.3
HOXB3-211ENST00000490677 TNIP1Q15025 636 aa35.66■■■■□ 3.3
HOXB3-211ENST00000490677 IFFO2Q5TF58 517 aa35.66■■■■□ 3.3
HOXB3-211ENST00000490677 TTLL11Q8NHH1 800 aa35.66■■■■□ 3.3
HOXB3-211ENST00000490677 DBNDD1Q9H9R9 158 aa35.66■■■■□ 3.3
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
HOXB3-211ENST00000490677 H7C1W4 665 aa35.65■■■■□ 3.3
HOXB3-211ENST00000490677 RIMBP2O15034 1052 aa35.65■■■■□ 3.3
HOXB3-211ENST00000490677 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP35.65■■■■□ 3.3
HOXB3-211ENST00000490677 NEXNQ0ZGT2 675 aa35.65■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms