RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489601.1

SH3BP4-210, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 638 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-210ENST00000489601 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNRF3Q9ULT6 936 aa21.58■■□□□ 1.05
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SH3BP4-210ENST00000489601 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP4-210ENST00000489601 HYPKQ9NX55 129 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP4-210ENST00000489601 TRPM7Q96QT4 1865 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF853P0CG23 659 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP4-210ENST00000489601 CXCL9Q07325 125 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP4-210ENST00000489601 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP4-210ENST00000489601 MBIPQ9NS73 344 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP4-210ENST00000489601 GPRC5DQ9NZD1 345 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP4-210ENST00000489601 LRRC37AA6NMS7 1700 aa21.55■■□□□ 1.04
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SH3BP4-210ENST00000489601 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SH3BP4-210ENST00000489601 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4-210ENST00000489601 FOXN1O15353 648 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4-210ENST00000489601 CIAPIN1Q6FI81 312 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM89AQ96GI7 184 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4-210ENST00000489601 IFT57Q9NWB7 429 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4-210ENST00000489601 DUOX1Q9NRD9 1551 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4-210ENST00000489601 APAF1O14727 1248 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP4-210ENST00000489601 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.52■■□□□ 1.03
SH3BP4-210ENST00000489601 GNAI1P63096 354 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4-210ENST00000489601 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4-210ENST00000489601 TNIP1Q15025 636 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF428Q96B54 188 aa21.51■■□□□ 1.03
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SH3BP4-210ENST00000489601 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.51■■□□□ 1.03
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SH3BP4-210ENST00000489601 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4-210ENST00000489601 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4-210ENST00000489601 PGAP2Q9UHJ9 254 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4-210ENST00000489601 YDJCA8MPS7 323 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4-210ENST00000489601 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4-210ENST00000489601 CAPN15O75808 1086 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4-210ENST00000489601 RAD17O75943 681 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4-210ENST00000489601 GOLGA2Q08379 1002 aa21.48■■□□□ 1.03
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SH3BP4-210ENST00000489601 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4-210ENST00000489601 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.48■■□□□ 1.03
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SH3BP4-210ENST00000489601 WASHC4Q2M389 1173 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP4-210ENST00000489601 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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SH3BP4-210ENST00000489601 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
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SH3BP4-210ENST00000489601 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4-210ENST00000489601 COL4A1P02462 1669 aa21.46■■□□□ 1.03
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SH3BP4-210ENST00000489601 THSD7BQ9C0I4 1608 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP4-210ENST00000489601 ECE1P42892 770 aa21.44■■□□□ 1.02
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SH3BP4-210ENST00000489601 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP4-210ENST00000489601 DPF2Q92785 391 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP4-210ENST00000489601 CAPNS2Q96L46 248 aa21.44■■□□□ 1.02
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SH3BP4-210ENST00000489601 TRPM4Q8TD43 1214 aa21.43■■□□□ 1.02
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SH3BP4-210ENST00000489601 MYD88Q99836 296 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP4-210ENST00000489601 C6orf229H3BNL8 230 aa21.42■■□□□ 1.02
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SH3BP4-210ENST00000489601 DBNDD1Q9H9R9 158 aa21.42■■□□□ 1.02
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SH3BP4-210ENST00000489601 SHTN1A0MZ66 631 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP4-210ENST00000489601 PDE8AO60658 829 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP4-210ENST00000489601 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
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SH3BP4-210ENST00000489601 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SH3BP4-210ENST00000489601 SAPCD2Q86UD0 394 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP4-210ENST00000489601 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
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