RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488684.5

POLR2F-211, Transcript of RNA polymerase II subunit F, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR2F, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2F-211ENST00000488684 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
POLR2F-211ENST00000488684 HYPKQ9NX55 129 aa29.13■■■□□ 2.25
POLR2F-211ENST00000488684 SUPT20HQ8NEM7 779 aa29.12■■■□□ 2.25
POLR2F-211ENST00000488684 FAM89AQ96GI7 184 aa29.12■■■□□ 2.25
POLR2F-211ENST00000488684 CXCL9Q07325 125 aa29.11■■■□□ 2.25
POLR2F-211ENST00000488684 ZNRF3Q9ULT6 936 aa29.11■■■□□ 2.25
POLR2F-211ENST00000488684 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
POLR2F-211ENST00000488684 VEGFBP49765 207 aa29.09■■■□□ 2.25
POLR2F-211ENST00000488684 IFT57Q9NWB7 429 aa29.09■■■□□ 2.25
POLR2F-211ENST00000488684 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
POLR2F-211ENST00000488684 KIAA2012Q0VF49 1180 aa29.08■■■□□ 2.25
POLR2F-211ENST00000488684 GNAI1P63096 354 aa29.07■■■□□ 2.24
POLR2F-211ENST00000488684 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP29.07■■■□□ 2.24
POLR2F-211ENST00000488684 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
POLR2F-211ENST00000488684 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
POLR2F-211ENST00000488684 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
POLR2F-211ENST00000488684 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
POLR2F-211ENST00000488684 TNS4Q8IZW8 715 aa29.07■■■□□ 2.24
POLR2F-211ENST00000488684 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
POLR2F-211ENST00000488684 GPRC5DQ9NZD1 345 aa29.07■■■□□ 2.24
POLR2F-211ENST00000488684 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
POLR2F-211ENST00000488684 C8orf58Q8NAV2 365 aa29.05■■■□□ 2.24
POLR2F-211ENST00000488684 DUOX1Q9NRD9 1551 aa29.05■■■□□ 2.24
POLR2F-211ENST00000488684 TMC4Q7Z404 712 aa29.04■■■□□ 2.24
POLR2F-211ENST00000488684 RIC3Q7Z5B4 369 aa29.04■■■□□ 2.24
POLR2F-211ENST00000488684 COL4A1P02462 1669 aa29.04■■■□□ 2.24
POLR2F-211ENST00000488684 RASSF10A6NK89 507 aa29.03■■■□□ 2.24
POLR2F-211ENST00000488684 RAD17O75943 681 aa29.03■■■□□ 2.24
POLR2F-211ENST00000488684 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
POLR2F-211ENST00000488684 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
POLR2F-211ENST00000488684 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
POLR2F-211ENST00000488684 LRRC37AA6NMS7 1700 aa29.03■■■□□ 2.24
POLR2F-211ENST00000488684 YDJCA8MPS7 323 aa29.02■■■□□ 2.24
POLR2F-211ENST00000488684 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
POLR2F-211ENST00000488684 DEFB115Q30KQ5 88 aa29.02■■■□□ 2.24
POLR2F-211ENST00000488684 CCDC184Q52MB2 194 aa29.02■■■□□ 2.24
POLR2F-211ENST00000488684 CIAPIN1Q6FI81 312 aa29.02■■■□□ 2.24
POLR2F-211ENST00000488684 FOXN1O15353 648 aa29.01■■■□□ 2.23
POLR2F-211ENST00000488684 TRAF5O00463 557 aa29■■■□□ 2.23
POLR2F-211ENST00000488684 GOLGA2Q08379 1002 aa29■■■□□ 2.23
POLR2F-211ENST00000488684 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
POLR2F-211ENST00000488684 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
POLR2F-211ENST00000488684 TNIP1Q15025 636 aa28.98■■■□□ 2.23
POLR2F-211ENST00000488684 CST9Q5W186 159 aa28.98■■■□□ 2.23
POLR2F-211ENST00000488684 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
POLR2F-211ENST00000488684 MYD88Q99836 296 aa28.98■■■□□ 2.23
POLR2F-211ENST00000488684 GPSM2P81274 684 aa28.97■■■□□ 2.23
POLR2F-211ENST00000488684 TSPYL6Q8N831 410 aa28.97■■■□□ 2.23
POLR2F-211ENST00000488684 POLLQ9UGP5 575 aa28.97■■■□□ 2.23
POLR2F-211ENST00000488684 CAPN15O75808 1086 aa28.96■■■□□ 2.23
POLR2F-211ENST00000488684 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
POLR2F-211ENST00000488684 RPS8P62241 208 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
POLR2F-211ENST00000488684 WASHC4Q2M389 1173 aa28.96■■■□□ 2.23
POLR2F-211ENST00000488684 BCL2L13Q9BXK5 485 aa28.96■■■□□ 2.23
POLR2F-211ENST00000488684 WBP1LQ9NX94 342 aa28.96■■■□□ 2.23
POLR2F-211ENST00000488684 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
POLR2F-211ENST00000488684 TRPM7Q96QT4 1865 aa28.95■■■□□ 2.23
POLR2F-211ENST00000488684 SHTN1A0MZ66 631 aa28.95■■■□□ 2.22
POLR2F-211ENST00000488684 SEC31BQ9NQW1 1179 aa28.95■■■□□ 2.22
POLR2F-211ENST00000488684 PGAP2Q9UHJ9 254 aa28.95■■■□□ 2.22
POLR2F-211ENST00000488684 CDHR2Q9BYE9 1310 aa28.94■■■□□ 2.22
POLR2F-211ENST00000488684 RIMBP2O15034 1052 aa28.94■■■□□ 2.22
POLR2F-211ENST00000488684 CCDC191Q8NCU4 936 aa28.94■■■□□ 2.22
POLR2F-211ENST00000488684 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
POLR2F-211ENST00000488684 DBNDD1Q9H9R9 158 aa28.94■■■□□ 2.22
POLR2F-211ENST00000488684 C6orf229H3BNL8 230 aa28.93■■■□□ 2.22
POLR2F-211ENST00000488684 CCDC30Q5VVM6 783 aa28.93■■■□□ 2.22
POLR2F-211ENST00000488684 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
POLR2F-211ENST00000488684 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
POLR2F-211ENST00000488684 TRPM4Q8TD43 1214 aa28.92■■■□□ 2.22
POLR2F-211ENST00000488684 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
POLR2F-211ENST00000488684 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
POLR2F-211ENST00000488684 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
POLR2F-211ENST00000488684 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
POLR2F-211ENST00000488684 TBC1D16Q8TBP0 767 aa28.91■■■□□ 2.22
POLR2F-211ENST00000488684 AIDAQ96BJ3 306 aa28.91■■■□□ 2.22
POLR2F-211ENST00000488684 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
POLR2F-211ENST00000488684 KCNQ5Q9NR82 932 aa28.91■■■□□ 2.22
POLR2F-211ENST00000488684 PSMD14O00487 310 aa28.9■■■□□ 2.22
POLR2F-211ENST00000488684 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
POLR2F-211ENST00000488684 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
POLR2F-211ENST00000488684 DOK7Q18PE1 504 aa28.89■■■□□ 2.22
POLR2F-211ENST00000488684 MICALL2Q8IY33 904 aa28.89■■■□□ 2.22
POLR2F-211ENST00000488684 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
POLR2F-211ENST00000488684 PRDM10Q9NQV6 1147 aa28.89■■■□□ 2.22
POLR2F-211ENST00000488684 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa28.89■■■□□ 2.22
POLR2F-211ENST00000488684 TLL2Q9Y6L7 1015 aa28.89■■■□□ 2.22
POLR2F-211ENST00000488684 H7C1D1 291 aa28.88■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 PDE8AO60658 829 aa28.88■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 DDX58O95786 925 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 DPF2Q92785 391 aa28.88■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 CAPNS2Q96L46 248 aa28.88■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 CHMP4AQ9BY43 222 aa28.88■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 ECE2O60344 883 aa28.87■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 CCDC27Q2M243 656 aa28.87■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 CYP4F22Q6NT55 531 aa28.87■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 WWC1Q8IX03 1113 aa28.87■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 EYA3Q99504 573 aa28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 346.2 ms