RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP4-209ENST00000484097 TAF1P21675 1872 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP4-209ENST00000484097 TMC4Q7Z404 712 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP4-209ENST00000484097 SP8Q8IXZ3 490 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP4-209ENST00000484097 PSMD1Q99460 953 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP4-209ENST00000484097 GCKRQ14397 625 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP4-209ENST00000484097 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
SH3BP4-209ENST00000484097 H7C1W4 665 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP4-209ENST00000484097 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
SH3BP4-209ENST00000484097 IARSP41252 1262 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SH3BP4-209ENST00000484097 GLTPD2A6NH11 291 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP4-209ENST00000484097 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP4-209ENST00000484097 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP4-209ENST00000484097 SSH1Q8WYL5 1049 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP4-209ENST00000484097 TIAM2Q8IVF5 1701 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP4-209ENST00000484097 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
SH3BP4-209ENST00000484097 MPNDQ8N594 471 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP4-209ENST00000484097 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP4-209ENST00000484097 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
SH3BP4-209ENST00000484097 BEND3Q5T5X7 828 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP4-209ENST00000484097 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
SH3BP4-209ENST00000484097 JDP2Q8WYK2 163 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP4-209ENST00000484097 BCL2L13Q9BXK5 485 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP4-209ENST00000484097 NMRK2Q9NPI5 230 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP4-209ENST00000484097 CTSWP56202 376 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP4-209ENST00000484097 RRAGCQ9HB90 399 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP4-209ENST00000484097 SMC4Q9NTJ3 1288 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP4-209ENST00000484097 MYH3P11055 1940 aa24.45■■□□□ 1.51
SH3BP4-209ENST00000484097 PTPRCP08575 1304 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP4-209ENST00000484097 KIF3CO14782 793 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP4-209ENST00000484097 C1QTNF8P60827 252 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP4-209ENST00000484097 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
SH3BP4-209ENST00000484097 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP4-209ENST00000484097 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC51AQ86UW1 340 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP4-209ENST00000484097 LARGE2Q8N3Y3 721 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP4-209ENST00000484097 SNED1Q8TER0 1413 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP4-209ENST00000484097 ALDH1L1O75891 902 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP4-209ENST00000484097 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP4-209ENST00000484097 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP4-209ENST00000484097 VPS33BQ9H267 617 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP4-209ENST00000484097 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
SH3BP4-209ENST00000484097 PPIP5K2O43314 1243 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP4-209ENST00000484097 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
SH3BP4-209ENST00000484097 PLA2G12BQ9BX93 195 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP4-209ENST00000484097 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
SH3BP4-209ENST00000484097 CASP7P55210 303 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP4-209ENST00000484097 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
SH3BP4-209ENST00000484097 DDNO94850 711 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SH3BP4-209ENST00000484097 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SH3BP4-209ENST00000484097 EIF6P56537 245 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
SH3BP4-209ENST00000484097 NIM1KQ8IY84 436 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP4-209ENST00000484097 GRM8O00222 908 aa24.39■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 AOC3Q16853 763 aa24.39■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 GREM2Q9H772 168 aa24.39■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 C6orf229H3BNL8 230 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 FZD9O00144 591 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 TOMM70O94826 608 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 GPSM2P81274 684 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 CSF1RP07333 972 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 EYA3Q99504 573 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 CHMP3Q9Y3E7 222 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 RTL9Q8NET4 1388 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 ITGA6P23229 1130 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 WASHC4Q2M389 1173 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF541Q9H0D2 1346 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.34■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.34■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 WDR90Q96KV7 1748 aa24.34■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 COL4A1P02462 1669 aa24.34■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 FOXO4P98177 505 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM161AQ3B820 660 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 POLLQ9UGP5 575 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 GGA1Q9UJY5 639 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNRF3Q9ULT6 936 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 GJA3Q9Y6H8 435 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP4-209ENST00000484097 IQCA1LA6NCM1 817 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4-209ENST00000484097 RIMBP2O15034 1052 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4-209ENST00000484097 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4-209ENST00000484097 LMBR1LQ6UX01 489 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4-209ENST00000484097 GPC2Q8N158 579 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4-209ENST00000484097 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4-209ENST00000484097 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4-209ENST00000484097 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4-209ENST00000484097 POTECB2RU33 542 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP4-209ENST00000484097 UFL1O94874 794 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP4-209ENST00000484097 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms