RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482902.5

SSR4-209, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene SSR4, Length 2,409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-209ENST00000482902 SNRKQ9NRH2 765 aa21.41■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa21.41■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 PSMA5P28066 241 aa21.4■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.4■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 OGFRQ9NZT2 677 aa21.4■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.4■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.4■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 GCKRQ14397 625 aa21.39■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 COPS6Q7L5N1 327 aa21.39■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 MYD88Q99836 296 aa21.39■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 EPHA10Q5JZY3 1008 aa21.39■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.39■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa21.38■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 NPHP3Q7Z494 1330 aa21.38■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 SYCP1Q15431 976 aa21.38■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 RNF20Q5VTR2 975 aa21.38■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.38■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.38■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.37■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.37■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.37■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 MED23Q9ULK4 1368 aa21.37■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 PTGS1P23219 599 aa21.37■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 TCEANC2Q96MN5 208 aa21.36■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 PHKG2P15735 406 aa21.36■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 TAF3Q5VWG9 929 aa21.36■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 TATP17735 454 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 ANKRD1Q15327 319 aa21.35■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 TAF6LQ9Y6J9 622 aa21.35■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 RPS6KB1P23443 525 aa21.35■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.34■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 SMTNL1A8MU46 457 aa21.34■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 COPRSQ9NQ92 184 aa21.34■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 CCDC192P0DO97 292 aa21.33■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 CDC37L1Q7L3B6 337 aa21.33■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 USP16Q9Y5T5 823 aa21.33■■□□□ 1.01
SSR4-209ENST00000482902 MRC1P22897 1456 aa21.33■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 FERMT3Q86UX7 667 aa21.33■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 HMG20BQ9P0W2 317 aa21.33■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 C5P01031 1676 aa21.32■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 PDCP20941 246 aa21.32■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.32■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 RGPD5Q99666 1765 aa21.32■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 TAF5LO75529 589 aa21.31■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 KRT85P78386 507 aa21.31■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 TNNI3KQ59H18 835 aa21.31■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 FAM200AQ8TCP9 573 aa21.31■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa21.31■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 JCADQ9P266 1359 aa21.31■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 ATP5JP18859 108 aa21.31■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 TFCP2Q12800 502 aa21.31■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.31■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 IFNL2Q8IZJ0 200 aa21.31■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.31■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 LRMPQ12912 555 aa21.3■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 TSGA10IPQ3SY00 556 aa21.3■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 TTC6Q86TZ1 520 aa21.3■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 SLFN14P0C7P3 912 aa21.3■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 FAM173BQ6P4H8 233 aa21.3■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa21.3■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 STK3Q13188 491 aa21.29■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 TMEM51Q9NW97 253 aa21.29■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.29■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 MEGF6O75095 1541 aa21.29■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.29■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 CCDC186Q7Z3E2 898 aa21.29■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.29■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa21.29■■□□□ 1
SSR4-209ENST00000482902 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.28■■□□□ 1
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