RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.68■■□□□ 1.86
ACTB-211ENST00000480301 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
ACTB-211ENST00000480301 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.66■■□□□ 1.86
ACTB-211ENST00000480301 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
ACTB-211ENST00000480301 CASP7P55210 303 aa26.65■■□□□ 1.86
ACTB-211ENST00000480301 GRIPAP1Q4V328 841 aa26.65■■□□□ 1.86
ACTB-211ENST00000480301 SP8Q8IXZ3 490 aa26.65■■□□□ 1.86
ACTB-211ENST00000480301 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
ACTB-211ENST00000480301 PSMD1Q99460 953 aa26.65■■□□□ 1.86
ACTB-211ENST00000480301 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
ACTB-211ENST00000480301 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa26.64■■□□□ 1.86
ACTB-211ENST00000480301 SEC31BQ9NQW1 1179 aa26.63■■□□□ 1.85
ACTB-211ENST00000480301 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa26.63■■□□□ 1.85
ACTB-211ENST00000480301 PTPRCP08575 1304 aa26.63■■□□□ 1.85
ACTB-211ENST00000480301 CCDC152Q4G0S7 254 aa26.62■■□□□ 1.85
ACTB-211ENST00000480301 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.62■■□□□ 1.85
ACTB-211ENST00000480301 COL4A1P02462 1669 aa26.61■■□□□ 1.85
ACTB-211ENST00000480301 CTSWP56202 376 aa26.61■■□□□ 1.85
ACTB-211ENST00000480301 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.61■■□□□ 1.85
ACTB-211ENST00000480301 TMC4Q7Z404 712 aa26.61■■□□□ 1.85
ACTB-211ENST00000480301 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
ACTB-211ENST00000480301 PLA2G12BQ9BX93 195 aa26.61■■□□□ 1.85
ACTB-211ENST00000480301 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
ACTB-211ENST00000480301 TAF1P21675 1872 aa26.61■■□□□ 1.85
ACTB-211ENST00000480301 IARSP41252 1262 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
ACTB-211ENST00000480301 RPS8P62241 208 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
ACTB-211ENST00000480301 TTLL11Q8NHH1 800 aa26.6■■□□□ 1.85
ACTB-211ENST00000480301 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.6■■□□□ 1.85
ACTB-211ENST00000480301 ALDH1L1O75891 902 aa26.59■■□□□ 1.85
ACTB-211ENST00000480301 RARSP54136 660 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
ACTB-211ENST00000480301 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
ACTB-211ENST00000480301 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.59■■□□□ 1.85
ACTB-211ENST00000480301 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
ACTB-211ENST00000480301 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
ACTB-211ENST00000480301 GLTPD2A6NH11 291 aa26.57■■□□□ 1.84
ACTB-211ENST00000480301 MPNDQ8N594 471 aa26.57■■□□□ 1.84
ACTB-211ENST00000480301 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.57■■□□□ 1.84
ACTB-211ENST00000480301 KIF3CO14782 793 aa26.56■■□□□ 1.84
ACTB-211ENST00000480301 GREM2Q9H772 168 aa26.56■■□□□ 1.84
ACTB-211ENST00000480301 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.56■■□□□ 1.84
ACTB-211ENST00000480301 GRM8O00222 908 aa26.55■■□□□ 1.84
ACTB-211ENST00000480301 CSF1RP07333 972 aa26.55■■□□□ 1.84
ACTB-211ENST00000480301 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
ACTB-211ENST00000480301 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
ACTB-211ENST00000480301 TIAM2Q8IVF5 1701 aa26.55■■□□□ 1.84
ACTB-211ENST00000480301 RTL9Q8NET4 1388 aa26.54■■□□□ 1.84
ACTB-211ENST00000480301 FOXO4P98177 505 aa26.53■■□□□ 1.84
ACTB-211ENST00000480301 DPY19L2Q6NUT2 758 aa26.53■■□□□ 1.84
ACTB-211ENST00000480301 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
ACTB-211ENST00000480301 GPSM2P81274 684 aa26.52■■□□□ 1.84
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa26.52■■□□□ 1.84
ACTB-211ENST00000480301 SUPT20HQ8NEM7 779 aa26.52■■□□□ 1.84
ACTB-211ENST00000480301 VPS33BQ9H267 617 aa26.52■■□□□ 1.84
ACTB-211ENST00000480301 RRAGCQ9HB90 399 aa26.52■■□□□ 1.84
ACTB-211ENST00000480301 LRRC37AA6NMS7 1700 aa26.51■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 COL4A5P29400 1685 aa26.51■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 FZD9O00144 591 aa26.51■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.51■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 JDP2Q8WYK2 163 aa26.51■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 UTYO14607 1347 aa26.5■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 PPIP5K2O43314 1243 aa26.5■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 AOC3Q16853 763 aa26.5■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.5■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.49■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 DDNO94850 711 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 ITGA6P23229 1130 aa26.49■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 FAM161AQ3B820 660 aa26.49■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 MYH3P11055 1940 aa26.49■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.48■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 PODXL2Q9NZ53 605 aa26.48■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 POLLQ9UGP5 575 aa26.48■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 DUOX1Q9NRD9 1551 aa26.48■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 POTECB2RU33 542 aa26.47■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 BCAR3O75815 825 aa26.47■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 C1QTNF8P60827 252 aa26.47■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP45Q92619 1136 aa26.47■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 KAZALD1Q96I82 304 aa26.47■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 SUCLG2Q96I99 432 aa26.47■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 LMBR1LQ6UX01 489 aa26.46■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 KIF16BQ96L93 1317 aa26.45■■□□□ 1.83
ACTB-211ENST00000480301 NIM1KQ8IY84 436 aa26.45■■□□□ 1.82
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D16Q8TBP0 767 aa26.45■■□□□ 1.82
ACTB-211ENST00000480301 USP44Q9H0E7 712 aa26.45■■□□□ 1.82
ACTB-211ENST00000480301 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
ACTB-211ENST00000480301 MINPP1Q9UNW1 487 aa26.44■■□□□ 1.82
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa26.43■■□□□ 1.82
ACTB-211ENST00000480301 C6orf229H3BNL8 230 aa26.43■■□□□ 1.82
ACTB-211ENST00000480301 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
ACTB-211ENST00000480301 CCT4P50991 539 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
ACTB-211ENST00000480301 EIF6P56537 245 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
ACTB-211ENST00000480301 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa26.43■■□□□ 1.82
ACTB-211ENST00000480301 LTBP1Q14766 1721 aa26.42■■□□□ 1.82
ACTB-211ENST00000480301 WDR90Q96KV7 1748 aa26.42■■□□□ 1.82
ACTB-211ENST00000480301 TOMM70O94826 608 aa26.42■■□□□ 1.82
ACTB-211ENST00000480301 WASHC4Q2M389 1173 aa26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms