RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 SSH1Q8WYL5 1049 aa24.06■■□□□ 1.44
SYF2-203ENST00000474160 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.06■■□□□ 1.44
SYF2-203ENST00000474160 ALDH1L1O75891 902 aa24.05■■□□□ 1.44
SYF2-203ENST00000474160 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SYF2-203ENST00000474160 BEND3Q5T5X7 828 aa24.05■■□□□ 1.44
SYF2-203ENST00000474160 SP8Q8IXZ3 490 aa24.05■■□□□ 1.44
SYF2-203ENST00000474160 PLA2G12BQ9BX93 195 aa24.05■■□□□ 1.44
SYF2-203ENST00000474160 VPS33BQ9H267 617 aa24.05■■□□□ 1.44
SYF2-203ENST00000474160 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SYF2-203ENST00000474160 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SYF2-203ENST00000474160 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.03■■□□□ 1.44
SYF2-203ENST00000474160 RTL9Q8NET4 1388 aa24.03■■□□□ 1.44
SYF2-203ENST00000474160 F6X3S4 739 aa24.02■■□□□ 1.44
SYF2-203ENST00000474160 PRELPP51888 382 aa24.02■■□□□ 1.44
SYF2-203ENST00000474160 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.02■■□□□ 1.44
SYF2-203ENST00000474160 SMC4Q9NTJ3 1288 aa24.02■■□□□ 1.44
SYF2-203ENST00000474160 CTSWP56202 376 aa24.01■■□□□ 1.43
SYF2-203ENST00000474160 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.01■■□□□ 1.43
SYF2-203ENST00000474160 CASP7P55210 303 aa24■■□□□ 1.43
SYF2-203ENST00000474160 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24■■□□□ 1.43
SYF2-203ENST00000474160 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa24■■□□□ 1.43
SYF2-203ENST00000474160 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
SYF2-203ENST00000474160 RPS8P62241 208 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
SYF2-203ENST00000474160 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
SYF2-203ENST00000474160 DPY19L2Q6NUT2 758 aa23.98■■□□□ 1.43
SYF2-203ENST00000474160 OLFM4Q6UX06 510 aa23.98■■□□□ 1.43
SYF2-203ENST00000474160 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.98■■□□□ 1.43
SYF2-203ENST00000474160 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
SYF2-203ENST00000474160 TIAM2Q8IVF5 1701 aa23.98■■□□□ 1.43
SYF2-203ENST00000474160 MYH3P11055 1940 aa23.98■■□□□ 1.43
SYF2-203ENST00000474160 GLTPD2A6NH11 291 aa23.97■■□□□ 1.43
SYF2-203ENST00000474160 LRRC37AA6NMS7 1700 aa23.97■■□□□ 1.43
SYF2-203ENST00000474160 GRM8O00222 908 aa23.97■■□□□ 1.43
SYF2-203ENST00000474160 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
SYF2-203ENST00000474160 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.97■■□□□ 1.43
SYF2-203ENST00000474160 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
SYF2-203ENST00000474160 KIF16BQ96L93 1317 aa23.97■■□□□ 1.43
SYF2-203ENST00000474160 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
SYF2-203ENST00000474160 MPNDQ8N594 471 aa23.96■■□□□ 1.43
SYF2-203ENST00000474160 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.96■■□□□ 1.43
SYF2-203ENST00000474160 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
SYF2-203ENST00000474160 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
SYF2-203ENST00000474160 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
SYF2-203ENST00000474160 CSF1RP07333 972 aa23.95■■□□□ 1.42
SYF2-203ENST00000474160 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa23.95■■□□□ 1.42
SYF2-203ENST00000474160 JDP2Q8WYK2 163 aa23.95■■□□□ 1.42
SYF2-203ENST00000474160 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.95■■□□□ 1.42
SYF2-203ENST00000474160 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
SYF2-203ENST00000474160 UTYO14607 1347 aa23.94■■□□□ 1.42
SYF2-203ENST00000474160 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
SYF2-203ENST00000474160 SEC31BQ9NQW1 1179 aa23.93■■□□□ 1.42
SYF2-203ENST00000474160 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.92■■□□□ 1.42
SYF2-203ENST00000474160 FZD9O00144 591 aa23.91■■□□□ 1.42
SYF2-203ENST00000474160 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
SYF2-203ENST00000474160 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
SYF2-203ENST00000474160 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.91■■□□□ 1.42
SYF2-203ENST00000474160 GREM2Q9H772 168 aa23.91■■□□□ 1.42
SYF2-203ENST00000474160 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
SYF2-203ENST00000474160 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
SYF2-203ENST00000474160 TAF1P21675 1872 aa23.9■■□□□ 1.42
SYF2-203ENST00000474160 KIF3CO14782 793 aa23.89■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 PPIP5K2O43314 1243 aa23.89■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.89■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 EYA3Q99504 573 aa23.89■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 ITGA6P23229 1130 aa23.88■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 FOXO4P98177 505 aa23.88■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 NIM1KQ8IY84 436 aa23.88■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 WDR90Q96KV7 1748 aa23.87■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.87■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 EIF6P56537 245 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 HDAC5Q9UQL6 1122 aa23.87■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 XDHP47989 1333 aa23.86■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 FAM161AQ3B820 660 aa23.86■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.86■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 DUOX1Q9NRD9 1551 aa23.86■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 LTBP1Q14766 1721 aa23.85■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 GPSM2P81274 684 aa23.85■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 GPC2Q8N158 579 aa23.85■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.85■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 GGA1Q9UJY5 639 aa23.85■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 COL4A1P02462 1669 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 IQCA1LA6NCM1 817 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 TOMM70O94826 608 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 ATP2B4P23634 1241 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 C1QTNF8P60827 252 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 AOC3Q16853 763 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 WASHC4Q2M389 1173 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 TBC1D16Q8TBP0 767 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 C6orf229H3BNL8 230 aa23.83■■□□□ 1.41
SYF2-203ENST00000474160 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms