RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1B0GUL6 1792 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 POTEB3A0JP26 581 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 SGSM2O43147 1006 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 REC8O95072 547 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 ANAPC15P60006 121 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 MYT1Q01538 1121 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 POTEBQ6S5H4 581 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 C3orf67Q6ZVT6 689 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 DNAJC10Q8IXB1 793 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC191Q8NCU4 936 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 KCNB2Q92953 911 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 PLA2G12BQ9BX93 195 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 SCN7AQ01118 1682 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 RFX7Q2KHR2 1363 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 SBF2Q86WG5 1849 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 AKAP11Q9UKA4 1901 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 LY75O60449 1722 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 COL24A1Q17RW2 1714 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 VASPP50552 380 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 GSE1Q14687 1217 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 CLEC17AQ6ZS10 378 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 ATG9AQ7Z3C6 839 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 KLHL34Q8N239 644 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 GPR108Q9NPR9 543 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 ECHDC1Q9NTX5 307 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 PALD1Q9ULE6 856 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 TAF1LQ8IZX4 1826 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 RAD50Q92878 1312 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 MED23Q9ULK4 1368 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF609O15014 1411 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 BTAF1O14981 1849 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 MYH7P12883 1935 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 A0A087WZG4 1122 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 CSF1RP07333 972 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 HSPA4P34932 840 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 PSEN1P49768 467 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 TCIRG1Q13488 830 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 HSCBQ8IWL3 235 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 IL27Q8NEV9 243 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 CHMP5Q9NZZ3 219 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 CDHR2Q9BYE9 1310 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 RIC1Q4ADV7 1423 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 EXOC5O00471 708 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 CIAO1O76071 339 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 ATP5JP18859 108 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 EMP3P54852 163 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 NBR1Q14596 966 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 CASC1Q6TDU7 716 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 LMBR1LQ6UX01 489 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 TICAM2Q86XR7 235 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 KLHDC4Q8TBB5 520 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 COL4A1P02462 1669 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 DOCK2Q92608 1830 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 LAMA4Q16363 1823 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 ERVV-1B6SEH8 477 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 STARD3NLO95772 234 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 EIF5P55010 431 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 TFCP2Q12800 502 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 CUL4AQ13619 759 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 RAB3GAP1Q15042 981 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 VPS72Q15906 364 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 TNNI3KQ59H18 835 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 DPY19L2Q6NUT2 758 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 AACSQ86V21 672 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 NLRP10Q86W26 655 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF34Q8IZ26 560 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 CNTROBQ8N137 903 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 EVI5LQ96CN4 794 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 TTC14Q96N46 770 aa6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms