RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460900.1

CRIP1-204, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CRIP1, Length 1,443 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-204ENST00000460900 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa29.08■■■□□ 2.25
CRIP1-204ENST00000460900 TAF1P21675 1872 aa29.06■■■□□ 2.24
CRIP1-204ENST00000460900 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
CRIP1-204ENST00000460900 ALDH1L2Q3SY69 923 aa29.06■■■□□ 2.24
CRIP1-204ENST00000460900 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa29.05■■■□□ 2.24
CRIP1-204ENST00000460900 PSMD1Q99460 953 aa29.05■■■□□ 2.24
CRIP1-204ENST00000460900 H7C1W4 665 aa29.04■■■□□ 2.24
CRIP1-204ENST00000460900 CCDC152Q4G0S7 254 aa29.04■■■□□ 2.24
CRIP1-204ENST00000460900 BEND3Q5T5X7 828 aa29.04■■■□□ 2.24
CRIP1-204ENST00000460900 SP8Q8IXZ3 490 aa29.04■■■□□ 2.24
CRIP1-204ENST00000460900 BCL2L13Q9BXK5 485 aa29.04■■■□□ 2.24
CRIP1-204ENST00000460900 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
CRIP1-204ENST00000460900 SLC4A10Q6U841 1118 aa29.03■■■□□ 2.24
CRIP1-204ENST00000460900 TMC4Q7Z404 712 aa29.03■■■□□ 2.24
CRIP1-204ENST00000460900 SNED1Q8TER0 1413 aa29.03■■■□□ 2.24
CRIP1-204ENST00000460900 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
CRIP1-204ENST00000460900 SMC4Q9NTJ3 1288 aa29.03■■■□□ 2.24
CRIP1-204ENST00000460900 KDM2BQ8NHM5 1336 aa29.02■■■□□ 2.24
CRIP1-204ENST00000460900 TIAM2Q8IVF5 1701 aa29.02■■■□□ 2.24
CRIP1-204ENST00000460900 SLC51AQ86UW1 340 aa29.02■■■□□ 2.24
CRIP1-204ENST00000460900 PTPRCP08575 1304 aa29.01■■■□□ 2.24
CRIP1-204ENST00000460900 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
CRIP1-204ENST00000460900 IARSP41252 1262 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
CRIP1-204ENST00000460900 CTSWP56202 376 aa29■■■□□ 2.23
CRIP1-204ENST00000460900 MYH3P11055 1940 aa28.99■■■□□ 2.23
CRIP1-204ENST00000460900 RPS8P62241 208 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
CRIP1-204ENST00000460900 DPY19L2Q6NUT2 758 aa28.99■■■□□ 2.23
CRIP1-204ENST00000460900 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa28.99■■■□□ 2.23
CRIP1-204ENST00000460900 SEC31BQ9NQW1 1179 aa28.99■■■□□ 2.23
CRIP1-204ENST00000460900 GLTPD2A6NH11 291 aa28.98■■■□□ 2.23
CRIP1-204ENST00000460900 MPNDQ8N594 471 aa28.98■■■□□ 2.23
CRIP1-204ENST00000460900 ALDH1L1O75891 902 aa28.97■■■□□ 2.23
CRIP1-204ENST00000460900 CASP7P55210 303 aa28.97■■■□□ 2.23
CRIP1-204ENST00000460900 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
CRIP1-204ENST00000460900 TTLL11Q8NHH1 800 aa28.97■■■□□ 2.23
CRIP1-204ENST00000460900 PLA2G12BQ9BX93 195 aa28.96■■■□□ 2.23
CRIP1-204ENST00000460900 NMRK2Q9NPI5 230 aa28.96■■■□□ 2.23
CRIP1-204ENST00000460900 SUPT20HQ8NEM7 779 aa28.95■■■□□ 2.23
CRIP1-204ENST00000460900 JDP2Q8WYK2 163 aa28.95■■■□□ 2.23
CRIP1-204ENST00000460900 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.23
CRIP1-204ENST00000460900 ZBED9Q6R2W3 1325 aa28.95■■■□□ 2.22
CRIP1-204ENST00000460900 GRM8O00222 908 aa28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-204ENST00000460900 RARSP54136 660 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-204ENST00000460900 KIF3CO14782 793 aa28.93■■■□□ 2.22
CRIP1-204ENST00000460900 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa28.93■■■□□ 2.22
CRIP1-204ENST00000460900 LARGE2Q8N3Y3 721 aa28.93■■■□□ 2.22
CRIP1-204ENST00000460900 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CRIP1-204ENST00000460900 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
CRIP1-204ENST00000460900 VPS33BQ9H267 617 aa28.93■■■□□ 2.22
CRIP1-204ENST00000460900 GREM2Q9H772 168 aa28.93■■■□□ 2.22
CRIP1-204ENST00000460900 COL4A1P02462 1669 aa28.93■■■□□ 2.22
CRIP1-204ENST00000460900 LRRC37AA6NMS7 1700 aa28.92■■■□□ 2.22
CRIP1-204ENST00000460900 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
CRIP1-204ENST00000460900 RRAGCQ9HB90 399 aa28.92■■■□□ 2.22
CRIP1-204ENST00000460900 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CRIP1-204ENST00000460900 PPIP5K2O43314 1243 aa28.91■■■□□ 2.22
CRIP1-204ENST00000460900 RTL9Q8NET4 1388 aa28.91■■■□□ 2.22
CRIP1-204ENST00000460900 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
CRIP1-204ENST00000460900 CSF1RP07333 972 aa28.89■■■□□ 2.22
CRIP1-204ENST00000460900 FZD9O00144 591 aa28.88■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 C1QTNF8P60827 252 aa28.88■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 AOC3Q16853 763 aa28.88■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 DDNO94850 711 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 GPSM2P81274 684 aa28.87■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 NIM1KQ8IY84 436 aa28.87■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 ITGA6P23229 1130 aa28.86■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 FOXO4P98177 505 aa28.86■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 FAM161AQ3B820 660 aa28.86■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 KIF16BQ96L93 1317 aa28.86■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 EIF6P56537 245 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa28.86■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 ZNF541Q9H0D2 1346 aa28.85■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 C6orf229H3BNL8 230 aa28.85■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 KIAA2012Q0VF49 1180 aa28.85■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 CHMP3Q9Y3E7 222 aa28.85■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 COL4A5P29400 1685 aa28.84■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 PODXL2Q9NZ53 605 aa28.84■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 POLLQ9UGP5 575 aa28.84■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 UTYO14607 1347 aa28.83■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa28.83■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 TOMM70O94826 608 aa28.83■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 WASHC4Q2M389 1173 aa28.83■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 LMBR1LQ6UX01 489 aa28.83■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 DUOX1Q9NRD9 1551 aa28.83■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 WDR90Q96KV7 1748 aa28.83■■■□□ 2.21
CRIP1-204ENST00000460900 CCT4P50991 539 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
CRIP1-204ENST00000460900 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
CRIP1-204ENST00000460900 EPHA10Q5JZY3 1008 aa28.82■■■□□ 2.2
CRIP1-204ENST00000460900 TBC1D16Q8TBP0 767 aa28.82■■■□□ 2.2
CRIP1-204ENST00000460900 ARHGAP45Q92619 1136 aa28.82■■■□□ 2.2
CRIP1-204ENST00000460900 EYA3Q99504 573 aa28.82■■■□□ 2.2
CRIP1-204ENST00000460900 MPHOSPH8Q99549 860 aa28.81■■■□□ 2.2
CRIP1-204ENST00000460900 GGA1Q9UJY5 639 aa28.81■■■□□ 2.2
CRIP1-204ENST00000460900 SPEF2Q9C093 1822 aa28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.4 ms