RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452545.1

ABCB6-206, Transcript of ATP binding cassette subfamily B member 6 (Langereis blood group), human

TSL 4

Gene ABCB6, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCB6-206	ENST00000452545	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	21.53	■■□□□ 1.04
ABCB6-206	ENST00000452545	TRAF5	O00463	557 aa		21.52	■■□□□ 1.04
ABCB6-206	ENST00000452545	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	21.52	■■□□□ 1.04
ABCB6-206	ENST00000452545	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		21.52	■■□□□ 1.04
ABCB6-206	ENST00000452545	RUNDC1	Q96C34	613 aa		21.52	■■□□□ 1.04
ABCB6-206	ENST00000452545	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		21.52	■■□□□ 1.04
ABCB6-206	ENST00000452545	ECE1	P42892	770 aa		21.51	■■□□□ 1.03
ABCB6-206	ENST00000452545	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		21.51	■■□□□ 1.03
ABCB6-206	ENST00000452545	GRM1	Q13255	1194 aa		21.51	■■□□□ 1.03
ABCB6-206	ENST00000452545	TNIP1	Q15025	636 aa		21.51	■■□□□ 1.03
ABCB6-206	ENST00000452545	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		21.51	■■□□□ 1.03
ABCB6-206	ENST00000452545	CAPNS2	Q96L46	248 aa		21.51	■■□□□ 1.03
ABCB6-206	ENST00000452545	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		21.51	■■□□□ 1.03
ABCB6-206	ENST00000452545	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		21.51	■■□□□ 1.03
ABCB6-206	ENST00000452545	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	21.5	■■□□□ 1.03
ABCB6-206	ENST00000452545	TMC4	Q7Z404	712 aa		21.5	■■□□□ 1.03
ABCB6-206	ENST00000452545	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		21.5	■■□□□ 1.03
ABCB6-206	ENST00000452545	ZNF428	Q96B54	188 aa		21.5	■■□□□ 1.03
ABCB6-206	ENST00000452545	RAD17	O75943	681 aa		21.49	■■□□□ 1.03
ABCB6-206	ENST00000452545	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	21.49	■■□□□ 1.03
ABCB6-206	ENST00000452545	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		21.49	■■□□□ 1.03
ABCB6-206	ENST00000452545	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		21.49	■■□□□ 1.03
ABCB6-206	ENST00000452545	HOXB7	P09629	217 aa		21.48	■■□□□ 1.03
ABCB6-206	ENST00000452545	CST9	Q5W186	159 aa		21.48	■■□□□ 1.03
ABCB6-206	ENST00000452545	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		21.48	■■□□□ 1.03
ABCB6-206	ENST00000452545	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		21.48	■■□□□ 1.03
ABCB6-206	ENST00000452545	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		21.48	■■□□□ 1.03
ABCB6-206	ENST00000452545	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	21.48	■■□□□ 1.03
ABCB6-206	ENST00000452545	LAMB2	P55268	1798 aa		21.47	■■□□□ 1.03
ABCB6-206	ENST00000452545	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	21.47	■■□□□ 1.03
ABCB6-206	ENST00000452545	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		21.47	■■□□□ 1.03
ABCB6-206	ENST00000452545	FAM89A	Q96GI7	184 aa		21.46	■■□□□ 1.03
ABCB6-206	ENST00000452545	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		21.45	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	21.45	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		21.45	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	21.45	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	HYPK	Q9NX55	129 aa		21.45	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		21.45	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		21.44	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	21.44	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	21.44	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	21.44	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	YDJC	A8MPS7	323 aa		21.43	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545		H7C1D1	291 aa		21.43	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	21.43	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	WASHC4	Q2M389	1173 aa		21.43	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	CFAP44	Q96MT7	982 aa		21.43	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		21.43	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		21.43	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		21.43	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	C6orf229	H3BNL8	230 aa		21.42	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	21.42	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		21.42	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	21.42	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	MAP2K2	P36507	400 aa		21.41	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	21.41	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		21.41	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		21.41	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	MICALL2	Q8IY33	904 aa		21.41	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		21.4	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		21.4	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	21.4	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	RIMBP2	O15034	1052 aa		21.4	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	AOC2	O75106	756 aa		21.4	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	GOLGA2	Q08379	1002 aa		21.4	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		21.4	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	EYA3	Q99504	573 aa		21.4	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		21.4	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	MBIP	Q9NS73	344 aa		21.4	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	21.4	■■□□□ 1.02
ABCB6-206	ENST00000452545	SHTN1	A0MZ66	631 aa		21.39	■■□□□ 1.01
ABCB6-206	ENST00000452545	GPSM2	P81274	684 aa		21.39	■■□□□ 1.01
ABCB6-206	ENST00000452545	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	21.39	■■□□□ 1.01
ABCB6-206	ENST00000452545	DPF2	Q92785	391 aa		21.39	■■□□□ 1.01
ABCB6-206	ENST00000452545	TAF1	P21675	1872 aa		21.39	■■□□□ 1.01
ABCB6-206	ENST00000452545	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		21.38	■■□□□ 1.01
ABCB6-206	ENST00000452545	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	21.38	■■□□□ 1.01
ABCB6-206	ENST00000452545	PSMD14	O00487	310 aa		21.38	■■□□□ 1.01
ABCB6-206	ENST00000452545	ABHD8	Q96I13	439 aa		21.38	■■□□□ 1.01
ABCB6-206	ENST00000452545	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		21.38	■■□□□ 1.01
ABCB6-206	ENST00000452545	POLL	Q9UGP5	575 aa		21.38	■■□□□ 1.01
ABCB6-206	ENST00000452545	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	21.37	■■□□□ 1.01
ABCB6-206	ENST00000452545	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	21.37	■■□□□ 1.01
ABCB6-206	ENST00000452545	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	21.37	■■□□□ 1.01
ABCB6-206	ENST00000452545	USP48	Q86UV5	1035 aa		21.37	■■□□□ 1.01
ABCB6-206	ENST00000452545	ECE2	O60344	883 aa		21.36	■■□□□ 1.01
ABCB6-206	ENST00000452545	DOK7	Q18PE1	504 aa		21.36	■■□□□ 1.01
ABCB6-206	ENST00000452545	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		21.36	■■□□□ 1.01
ABCB6-206	ENST00000452545	TSKS	Q9UJT2	592 aa		21.36	■■□□□ 1.01
ABCB6-206	ENST00000452545	CA12	O43570	354 aa		21.35	■■□□□ 1.01
ABCB6-206	ENST00000452545	ZNF853	P0CG23	659 aa		21.35	■■□□□ 1.01
ABCB6-206	ENST00000452545	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	21.35	■■□□□ 1.01
ABCB6-206	ENST00000452545	GNAI1	P63096	354 aa		21.35	■■□□□ 1.01
ABCB6-206	ENST00000452545	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	21.35	■■□□□ 1.01
ABCB6-206	ENST00000452545	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	21.35	■■□□□ 1.01
ABCB6-206	ENST00000452545	IFT57	Q9NWB7	429 aa		21.35	■■□□□ 1.01
ABCB6-206	ENST00000452545		G3V3G9	751 aa		21.34	■■□□□ 1.01
ABCB6-206	ENST00000452545	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	21.34	■■□□□ 1.01
ABCB6-206	ENST00000452545	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		21.34	■■□□□ 1.01
ABCB6-206	ENST00000452545	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		21.34	■■□□□ 1.01

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms