RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433909.2

CCDC189-201, Transcript of coiled-coil domain containing 189, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC189, Length 1,157 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189-201ENST00000433909 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa25.29■■□□□ 1.64
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CCDC189-201ENST00000433909 CNTNAP1P78357 1384 aa25.29■■□□□ 1.64
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CCDC189-201ENST00000433909 ZNRF3Q9ULT6 936 aa25.28■■□□□ 1.64
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CCDC189-201ENST00000433909 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
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CCDC189-201ENST00000433909 C8orf58Q8NAV2 365 aa25.22■■□□□ 1.63
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CCDC189-201ENST00000433909 CCDC30Q5VVM6 783 aa25.18■■□□□ 1.62
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CCDC189-201ENST00000433909 DUOX1Q9NRD9 1551 aa25.18■■□□□ 1.62
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CCDC189-201ENST00000433909 C6orf229H3BNL8 230 aa25.16■■□□□ 1.62
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CCDC189-201ENST00000433909 STK31Q9BXU1 1019 aa25.1■■□□□ 1.61
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CCDC189-201ENST00000433909 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
CCDC189-201ENST00000433909 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.08■■□□□ 1.61
CCDC189-201ENST00000433909 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
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