RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 TAF1P21675 1872 aa27.18■■□□□ 1.94
LIMS1-208ENST00000428064 CNTNAP1P78357 1384 aa27.18■■□□□ 1.94
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA2Q08379 1002 aa27.17■■□□□ 1.94
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA2012Q0VF49 1180 aa27.17■■□□□ 1.94
LIMS1-208ENST00000428064 ZNRF3Q9ULT6 936 aa27.17■■□□□ 1.94
LIMS1-208ENST00000428064 CLEC11AQ9Y240 323 aa27.17■■□□□ 1.94
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM88BA6NKF7 163 aa27.16■■□□□ 1.94
LIMS1-208ENST00000428064 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa27.16■■□□□ 1.94
LIMS1-208ENST00000428064 FAM89AQ96GI7 184 aa27.16■■□□□ 1.94
LIMS1-208ENST00000428064 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
LIMS1-208ENST00000428064 CNTROBQ8N137 903 aa27.15■■□□□ 1.94
LIMS1-208ENST00000428064 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
LIMS1-208ENST00000428064 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC27Q2M243 656 aa27.14■■□□□ 1.94
LIMS1-208ENST00000428064 RIC3Q7Z5B4 369 aa27.14■■□□□ 1.94
LIMS1-208ENST00000428064 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
LIMS1-208ENST00000428064 CDHR2Q9BYE9 1310 aa27.14■■□□□ 1.93
LIMS1-208ENST00000428064 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
LIMS1-208ENST00000428064 C8orf58Q8NAV2 365 aa27.13■■□□□ 1.93
LIMS1-208ENST00000428064 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
LIMS1-208ENST00000428064 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
LIMS1-208ENST00000428064 EPS15P42566 896 aa27.12■■□□□ 1.93
LIMS1-208ENST00000428064 CXCL9Q07325 125 aa27.12■■□□□ 1.93
LIMS1-208ENST00000428064 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
LIMS1-208ENST00000428064 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
LIMS1-208ENST00000428064 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
LIMS1-208ENST00000428064 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC30Q5VVM6 783 aa27.11■■□□□ 1.93
LIMS1-208ENST00000428064 GPRC5DQ9NZD1 345 aa27.11■■□□□ 1.93
LIMS1-208ENST00000428064 COL4A1P02462 1669 aa27.11■■□□□ 1.93
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC184Q52MB2 194 aa27.1■■□□□ 1.93
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC191Q8NCU4 936 aa27.1■■□□□ 1.93
LIMS1-208ENST00000428064 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
LIMS1-208ENST00000428064 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF428Q96B54 188 aa27.09■■□□□ 1.93
LIMS1-208ENST00000428064 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
LIMS1-208ENST00000428064 DDX58O95786 925 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
LIMS1-208ENST00000428064 CIAPIN1Q6FI81 312 aa27.08■■□□□ 1.93
LIMS1-208ENST00000428064 RASSF10A6NK89 507 aa27.07■■□□□ 1.92
LIMS1-208ENST00000428064 TNIP1Q15025 636 aa27.07■■□□□ 1.92
LIMS1-208ENST00000428064 MYD88Q99836 296 aa27.07■■□□□ 1.92
LIMS1-208ENST00000428064 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
LIMS1-208ENST00000428064 WWC1Q8IX03 1113 aa27.06■■□□□ 1.92
LIMS1-208ENST00000428064 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
LIMS1-208ENST00000428064 IL16Q14005 1332 aa27.06■■□□□ 1.92
LIMS1-208ENST00000428064 TRPM7Q96QT4 1865 aa27.05■■□□□ 1.92
LIMS1-208ENST00000428064 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
LIMS1-208ENST00000428064 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
LIMS1-208ENST00000428064 TSPYL6Q8N831 410 aa27.05■■□□□ 1.92
LIMS1-208ENST00000428064 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
LIMS1-208ENST00000428064 YDJCA8MPS7 323 aa27.04■■□□□ 1.92
LIMS1-208ENST00000428064 RPS8P62241 208 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
LIMS1-208ENST00000428064 WASHC4Q2M389 1173 aa27.04■■□□□ 1.92
LIMS1-208ENST00000428064 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
LIMS1-208ENST00000428064 VEGFBP49765 207 aa27.03■■□□□ 1.92
LIMS1-208ENST00000428064 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
LIMS1-208ENST00000428064 THSD7BQ9C0I4 1608 aa27.02■■□□□ 1.92
LIMS1-208ENST00000428064 PDE8AO60658 829 aa27.02■■□□□ 1.92
LIMS1-208ENST00000428064 RAD17O75943 681 aa27.02■■□□□ 1.92
LIMS1-208ENST00000428064 GPSM2P81274 684 aa27.02■■□□□ 1.92
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC152Q4G0S7 254 aa27.02■■□□□ 1.92
LIMS1-208ENST00000428064 PODXL2Q9NZ53 605 aa27.02■■□□□ 1.92
LIMS1-208ENST00000428064 PGAP2Q9UHJ9 254 aa27.02■■□□□ 1.92
LIMS1-208ENST00000428064 EYA3Q99504 573 aa27.01■■□□□ 1.91
LIMS1-208ENST00000428064 POLLQ9UGP5 575 aa27.01■■□□□ 1.91
LIMS1-208ENST00000428064 DEFB115Q30KQ5 88 aa27■■□□□ 1.91
LIMS1-208ENST00000428064 KSR2Q6VAB6 950 aa27■■□□□ 1.91
LIMS1-208ENST00000428064 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
LIMS1-208ENST00000428064 BCL2L13Q9BXK5 485 aa27■■□□□ 1.91
LIMS1-208ENST00000428064 STK31Q9BXU1 1019 aa27■■□□□ 1.91
LIMS1-208ENST00000428064 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa27■■□□□ 1.91
LIMS1-208ENST00000428064 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
LIMS1-208ENST00000428064 TBC1D16Q8TBP0 767 aa26.99■■□□□ 1.91
LIMS1-208ENST00000428064 DPF2Q92785 391 aa26.99■■□□□ 1.91
LIMS1-208ENST00000428064 C6orf229H3BNL8 230 aa26.98■■□□□ 1.91
LIMS1-208ENST00000428064 MRS2Q9HD23 443 aa26.98■■□□□ 1.91
LIMS1-208ENST00000428064 SEC31BQ9NQW1 1179 aa26.98■■□□□ 1.91
LIMS1-208ENST00000428064 MYH3P11055 1940 aa26.97■■□□□ 1.91
LIMS1-208ENST00000428064 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.97■■□□□ 1.91
LIMS1-208ENST00000428064 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.97■■□□□ 1.91
LIMS1-208ENST00000428064 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
LIMS1-208ENST00000428064 ANP32CO43423 234 aa26.96■■□□□ 1.91
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV5-2P06315 115 aa26.96■■□□□ 1.91
LIMS1-208ENST00000428064 TNS4Q8IZW8 715 aa26.96■■□□□ 1.91
LIMS1-208ENST00000428064 DBNDD1Q9H9R9 158 aa26.96■■□□□ 1.91
LIMS1-208ENST00000428064 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
LIMS1-208ENST00000428064 CACNA1FO60840 1977 aa26.95■■□□□ 1.91
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 ECE2O60344 883 aa26.95■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 RPS12P25398 132 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.95■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 CST9Q5W186 159 aa26.95■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF609O15014 1411 aa26.94■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 H7C1D1 291 aa26.94■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 TRAF5O00463 557 aa26.94■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 PSMD14O00487 310 aa26.94■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 RIMBP2O15034 1052 aa26.94■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
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