RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPDYE4A6NLX3 237 aa12.12□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PDE1AP54750 535 aa12.12□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HLFQ16534 295 aa12.12□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa12.12□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PROM2Q8N271 834 aa12.12□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RHPN1Q8TCX5 695 aa12.12□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PHF12Q96QT6 1004 aa12.12□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa12.12□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa12.12□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C4AP0C0L4 1744 aa12.12□□□□□ -0.47
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TSHZ3Q63HK5 1081 aa12.11□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NLRP10Q86W26 655 aa12.11□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF34Q8IZ26 560 aa12.11□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CDHR2Q9BYE9 1310 aa12.11□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GPTP24298 496 aa12.11□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 USPL1Q5W0Q7 1092 aa12.11□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIF1BPQ96EK5 621 aa12.11□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CAMKK2Q96RR4 588 aa12.11□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OSBPL3Q9H4L5 887 aa12.11□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP12.11□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa12.1□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa12.1□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NUTM1Q86Y26 1132 aa12.1□□□□□ -0.47
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 STK32BQ9NY57 414 aa12.1□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 STAP2Q9UGK3 403 aa12.1□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CDC45O75419 566 aa12.09□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SDSP20132 328 aa12.09□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MX1P20591 662 aa12.09□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FOXO4P98177 505 aa12.09□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KLHDC4Q8TBB5 520 aa12.09□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SETDB2Q96T68 719 aa12.09□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SH3TC1Q8TE82 1336 aa12.08□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 QSER1Q2KHR3 1735 aa12.08□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TBC1D32Q96NH3 1257 aa12.08□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PLA2G12BQ9BX93 195 aa12.08□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SASH1O94885 1247 aa12.07□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP12.07□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LMBR1LQ6UX01 489 aa12.07□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SIL1Q9H173 461 aa12.07□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CARMIL3Q8ND23 1372 aa12.07□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 COL24A1Q17RW2 1714 aa12.07□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PDE8AO60658 829 aa12.06□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC15A2Q16348 729 aa12.06□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF827Q17R98 1081 aa12.06□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SUSD4Q5VX71 490 aa12.06□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TPTE2Q6XPS3 522 aa12.06□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ERC1Q8IUD2 1116 aa12.06□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM89AQ96GI7 184 aa12.06□□□□□ -0.48
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CHMP3Q9Y3E7 222 aa12.06□□□□□ -0.48
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NTSR2O95665 410 aa12.06□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TBC1D9BQ66K14 1250 aa12.06□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BICDL1Q6ZP65 573 aa12.06□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NLGN1Q8N2Q7 840 aa12.06□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PI4K2BQ8TCG2 481 aa12.06□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 COPRSQ9NQ92 184 aa12.06□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MYH3P11055 1940 aa12.05□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 POTEB2H3BUK9 544 aa12.05□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GYS1P13807 737 aa12.05□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SYNE4Q8N205 404 aa12.05□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DDRGK1Q96HY6 314 aa12.05□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C22orf23Q9BZE7 217 aa12.05□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BCL2L12Q9HB09 334 aa12.05□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AK9Q5TCS8 1911 aa12.04□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM177BA6PVY3 158 aa12.04□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CTSWP56202 376 aa12.04□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCDC57Q2TAC2 916 aa12.04□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SMIM5Q71RC9 77 aa12.04□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DEFB132Q7Z7B7 95 aa12.04□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AMIGO3Q86WK7 504 aa12.04□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EP400Q96L91 3159 aa12.03□□□□□ -0.48
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