RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416295.1

SEMA3B-201, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 1,088 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-201ENST00000416295 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.85■■□□□ 1.25
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SEMA3B-201ENST00000416295 H7C1W4 665 aa22.84■■□□□ 1.25
SEMA3B-201ENST00000416295 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
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SEMA3B-201ENST00000416295 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.84■■□□□ 1.25
SEMA3B-201ENST00000416295 TMC4Q7Z404 712 aa22.84■■□□□ 1.25
SEMA3B-201ENST00000416295 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.83■■□□□ 1.25
SEMA3B-201ENST00000416295 ALDH1L1O75891 902 aa22.83■■□□□ 1.25
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SEMA3B-201ENST00000416295 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.83■■□□□ 1.25
SEMA3B-201ENST00000416295 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.83■■□□□ 1.25
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SEMA3B-201ENST00000416295 KIF16BQ96L93 1317 aa22.82■■□□□ 1.24
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SEMA3B-201ENST00000416295 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.8■■□□□ 1.24
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SEMA3B-201ENST00000416295 GRM8O00222 908 aa22.79■■□□□ 1.24
SEMA3B-201ENST00000416295 TOMM70O94826 608 aa22.79■■□□□ 1.24
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SEMA3B-201ENST00000416295 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.77■■□□□ 1.24
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SEMA3B-201ENST00000416295 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SEMA3B-201ENST00000416295 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SEMA3B-201ENST00000416295 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.76■■□□□ 1.23
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SEMA3B-201ENST00000416295 CEP350Q5VT06 3117 aa22.74■■□□□ 1.23
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SEMA3B-201ENST00000416295 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SEMA3B-201ENST00000416295 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SEMA3B-201ENST00000416295 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SEMA3B-201ENST00000416295 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.74■■□□□ 1.23
SEMA3B-201ENST00000416295 MPNDQ8N594 471 aa22.74■■□□□ 1.23
SEMA3B-201ENST00000416295 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.74■■□□□ 1.23
SEMA3B-201ENST00000416295 GREM2Q9H772 168 aa22.74■■□□□ 1.23
SEMA3B-201ENST00000416295 MYH3P11055 1940 aa22.73■■□□□ 1.23
SEMA3B-201ENST00000416295 SLC51AQ86UW1 340 aa22.73■■□□□ 1.23
SEMA3B-201ENST00000416295 UTYO14607 1347 aa22.73■■□□□ 1.23
SEMA3B-201ENST00000416295 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.73■■□□□ 1.23
SEMA3B-201ENST00000416295 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.73■■□□□ 1.23
SEMA3B-201ENST00000416295 CSF1RP07333 972 aa22.72■■□□□ 1.23
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SEMA3B-201ENST00000416295 COL4A1P02462 1669 aa22.71■■□□□ 1.23
SEMA3B-201ENST00000416295 FOXO4P98177 505 aa22.7■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 FAM161AQ3B820 660 aa22.7■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.7■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 JDP2Q8WYK2 163 aa22.7■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.7■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 GLTPD2A6NH11 291 aa22.69■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 ITGA6P23229 1130 aa22.69■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 APLP1P51693 650 aa22.69■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
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SEMA3B-201ENST00000416295 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.68■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 USP44Q9H0E7 712 aa22.68■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 RRAGCQ9HB90 399 aa22.68■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.68■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.67■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 PPIP5K2O43314 1243 aa22.67■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 TRIM27P14373 513 aa22.67■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 FSTL1Q12841 308 aa22.67■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.67■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 SUCLG2Q96I99 432 aa22.67■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 GPSM2P81274 684 aa22.66■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.66■■□□□ 1.22
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SEMA3B-201ENST00000416295 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.66■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.66■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.65■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 AOC3Q16853 763 aa22.65■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.65■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 NIM1KQ8IY84 436 aa22.65■■□□□ 1.22
SEMA3B-201ENST00000416295 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.65■■□□□ 1.22
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