RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa11.19□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 SLC12A7Q9Y666 1083 aa11.19□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 FLIIQ13045 1269 aa11.19□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 C6orf163Q5TEZ5 329 aa11.19□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 CCDC155Q8N6L0 562 aa11.19□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 MACROD2A1Z1Q3 448 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 GOLGA6CA6NDK9 693 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 TACC1O75410 805 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 KIF4AO95239 1232 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 GOLGA6DP0CG33 693 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 IARSP41252 1262 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 RRAGBQ5VZM2 374 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 SERPINA10Q9UK55 444 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 ZNF213O14771 459 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 HAND2P61296 217 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 CFAP58Q5T655 872 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 ABTB2Q8N961 1025 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 TRIM47Q96LD4 638 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 DNAJC5BQ9UF47 199 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 BTBD11A6QL63 1104 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 LRMPQ12912 555 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 MICU3Q86XE3 530 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 RHPN1Q8TCX5 695 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 IL16Q14005 1332 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 EFCAB5A4FU69 1503 aa11.17□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 KRT86O43790 486 aa11.17□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 VAV2P52735 878 aa11.17□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 SPTLC2O15270 562 aa11.17□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 FAM173BQ6P4H8 233 aa11.17□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 CPA1P15085 419 aa11.17□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 HPDP32754 393 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 ATP2B2Q01814 1243 aa11.17□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 ATAD2Q6PL18 1390 aa11.17□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 FAM83GA6ND36 823 aa11.17□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 STX17P56962 302 aa11.17□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 Q6ZUG5 572 aa11.17□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 SPATA24Q86W54 205 aa11.17□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 DCTPP1Q9H773 170 aa11.17□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 GNAT3A8MTJ3 354 aa11.16□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 KIF5AQ12840 1032 aa11.16□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 SMIM23A6NLE4 172 aa11.16□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 PYCARDQ9ULZ3 195 aa11.16□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 KRT83P78385 493 aa11.16□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 PPARDQ03181 441 aa11.16□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 KIAA0753Q2KHM9 967 aa11.16□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 CCDC40Q4G0X9 1142 aa11.16□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 TXNDC2Q86VQ3 553 aa11.16□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 CLSTN2Q9H4D0 955 aa11.16□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa11.16□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 PTPN23Q9H3S7 1636 aa11.16□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 ARHGAP5Q13017 1502 aa11.16□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 CETN2P41208 172 aa11.16□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 KIF6Q6ZMV9 814 aa11.16□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa11.15□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 A0A1W2PRG0 241 aa11.15□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 TLDC2A0PJX2 215 aa11.15□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 DTNBO60941 627 aa11.15□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP11.15□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 SPAG1Q07617 926 aa11.15□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 FAM114A1Q8IWE2 563 aa11.15□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 SLC26A6Q9BXS9 759 aa11.15□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 UBA5Q9GZZ9 404 aa11.15□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 NAPBQ9H115 298 aa11.15□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 SAMD15Q9P1V8 674 aa11.15□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 A0A1B0GVL5 298 aa11.15□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 MINDY4BA8MYZ0 360 aa11.15□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 GOLIM4O00461 696 aa11.15□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 LIG3P49916 1009 aa11.15□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 LRCH2Q5VUJ6 765 aa11.15□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 GPT2Q8TD30 523 aa11.15□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 MYL5Q02045 173 aa11.15□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 ERBB4Q15303 1308 aa11.15□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 IDEP14735 1019 aa11.15□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 CHMLP26374 656 aa11.15□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 GCKP35557 465 aa11.15□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 PCK1P35558 622 aa11.15□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 ARHGAP25P42331 645 aa11.15□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 RPAINQ86UA6 219 aa11.15□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 CAPN7Q9Y6W3 813 aa11.15□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 GOLGA5Q8TBA6 731 aa11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms