RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HERC3-202ENST00000402738 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP11.15□□□□□ -0.62
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HERC3-202ENST00000402738 ARHGAP25P42331 645 aa11.15□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 RPAINQ86UA6 219 aa11.15□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 CAPN7Q9Y6W3 813 aa11.15□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
HERC3-202ENST00000402738 GOLGA5Q8TBA6 731 aa11.14□□□□□ -0.63
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