RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380776.4

KCNQ1-204, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 229 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-204ENST00000380776 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 MYH3P11055 1940 aa8.35□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 RFX7Q2KHR2 1363 aa8.35□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 RTL9Q8NET4 1388 aa8.35□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 GNPATO15228 680 aa8.34□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 SEC24BO95487 1268 aa8.34□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 ATP5JP18859 108 aa8.34□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 RXRBP28702 533 aa8.34□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 TRAPPC3LQ5T215 181 aa8.34□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 TTLL11Q8NHH1 800 aa8.34□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP8.34□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 BCORQ6W2J9 1755 aa8.34□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 ABCC12Q96J65 1359 aa8.34□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 UBN2Q6ZU65 1347 aa8.33□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 RAD50Q92878 1312 aa8.33□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 NTSR2O95665 410 aa8.33□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 ITGA6P23229 1130 aa8.33□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 CHMLP26374 656 aa8.33□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 SSFA2P28290 1259 aa8.33□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 RFC4P35249 363 aa8.33□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 TFCP2Q12800 502 aa8.33□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 CCDC158Q5M9N0 1113 aa8.33□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 SUSD4Q5VX71 490 aa8.33□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa8.33□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 FBXO41Q8TF61 875 aa8.33□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 SETDB2Q96T68 719 aa8.33□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa8.33□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 CNNM1Q9NRU3 951 aa8.33□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa8.33□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 MROH5Q6ZUA9 1318 aa8.32□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 PLSCR1O15162 318 aa8.32□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 ANAPC15P60006 121 aa8.32□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 RABEP1Q15276 862 aa8.32□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 METTL24Q5JXM2 366 aa8.32□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 SLC10A5Q5PT55 438 aa8.32□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 GORABQ5T7V8 394 aa8.32□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 TPTE2Q6XPS3 522 aa8.32□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa8.32□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 ATG9AQ7Z3C6 839 aa8.32□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 HSCBQ8IWL3 235 aa8.32□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 FLAD1Q8NFF5 587 aa8.32□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 KLHDC4Q8TBB5 520 aa8.32□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 SNX21Q969T3 373 aa8.32□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 MPHOSPH8Q99549 860 aa8.32□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 USP26Q9BXU7 913 aa8.32□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 SCN7AQ01118 1682 aa8.32□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 AK9Q5TCS8 1911 aa8.32□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 C4BP0C0L5 1744 aa8.32□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 TAF1LQ8IZX4 1826 aa8.31□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa8.31□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 ZNF609O15014 1411 aa8.31□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 LAMB2P55268 1798 aa8.31□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 NEUROD6Q96NK8 337 aa8.31□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 NLRP3Q96P20 1036 aa8.31□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 GREM2Q9H772 168 aa8.31□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa8.31□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 A0A1B0GUL7 405 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 NPHP1O15259 732 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 SGSM2O43147 1006 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 ST18O60284 1047 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 TRIM37O94972 964 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 LRRC24Q50LG9 513 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 FAM182BQ5T319 152 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 USPL1Q5W0Q7 1092 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 TSHZ3Q63HK5 1081 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 HAUS7Q99871 368 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 DBNDD2Q9BQY9 259 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 FSD1Q9BTV5 496 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 BOLA2Q9H3K6 86 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 SPEF2Q9C093 1822 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 CARMIL3Q8ND23 1372 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 BRWD3Q6RI45 1802 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 PDE8BO95263 885 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 SLC5A1P13866 664 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 MCM2P49736 904 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 ATP2B3Q16720 1220 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 TXNRD1Q16881 649 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 TTC39AQ5SRH9 613 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 PTF1AQ7RTS3 328 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 LPIN2Q92539 896 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
KCNQ1-204ENST00000380776 ANO2Q9NQ90 1003 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms