RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366391.6

SH3BP5-201, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-201ENST00000366391 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.63■■□□□ 1.37
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SH3BP5-201ENST00000366391 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SH3BP5-201ENST00000366391 NEURL1BA8MQ27 555 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-201ENST00000366391 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-201ENST00000366391 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-201ENST00000366391 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-201ENST00000366391 LTBP1Q14766 1721 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-201ENST00000366391 COL4A5P29400 1685 aa23.6■■□□□ 1.37
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SH3BP5-201ENST00000366391 DPY19L2Q6NUT2 758 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5-201ENST00000366391 SP8Q8IXZ3 490 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5-201ENST00000366391 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5-201ENST00000366391 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
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SH3BP5-201ENST00000366391 DUOX1Q9NRD9 1551 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5-201ENST00000366391 TMC4Q7Z404 712 aa23.58■■□□□ 1.37
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SH3BP5-201ENST00000366391 H7C1W4 665 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-201ENST00000366391 GCKRQ14397 625 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-201ENST00000366391 MPNDQ8N594 471 aa23.55■■□□□ 1.36
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SH3BP5-201ENST00000366391 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
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SH3BP5-201ENST00000366391 JDP2Q8WYK2 163 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF541Q9H0D2 1346 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-201ENST00000366391 A0A1B0GUL6 1792 aa23.52■■□□□ 1.36
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SH3BP5-201ENST00000366391 FZD9O00144 591 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-201ENST00000366391 CTSWP56202 376 aa23.52■■□□□ 1.36
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SH3BP5-201ENST00000366391 PPIP5K2O43314 1243 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-201ENST00000366391 CASP7P55210 303 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-201ENST00000366391 BEND3Q5T5X7 828 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-201ENST00000366391 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-201ENST00000366391 VPS33BQ9H267 617 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-201ENST00000366391 PSME4Q14997 1843 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-201ENST00000366391 AOC3Q16853 763 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-201ENST00000366391 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-201ENST00000366391 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-201ENST00000366391 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-201ENST00000366391 SCN9AQ15858 1988 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-201ENST00000366391 NIM1KQ8IY84 436 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5-201ENST00000366391 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
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SH3BP5-201ENST00000366391 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-201ENST00000366391 GREM2Q9H772 168 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-201ENST00000366391 PTPRCP08575 1304 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5-201ENST00000366391 GPSM2P81274 684 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5-201ENST00000366391 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.46■■□□□ 1.35
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SH3BP5-201ENST00000366391 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5-201ENST00000366391 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SH3BP5-201ENST00000366391 GPC2Q8N158 579 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP5-201ENST00000366391 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SH3BP5-201ENST00000366391 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP5-201ENST00000366391 ALDH1L1O75891 902 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP5-201ENST00000366391 HSPA6P17066 643 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP5-201ENST00000366391 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.44■■□□□ 1.34
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SH3BP5-201ENST00000366391 GRM8O00222 908 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-201ENST00000366391 CSF1RP07333 972 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-201ENST00000366391 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
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SH3BP5-201ENST00000366391 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-201ENST00000366391 POLLQ9UGP5 575 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-201ENST00000366391 GJA3Q9Y6H8 435 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-201ENST00000366391 C6orf229H3BNL8 230 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-201ENST00000366391 SMC1BQ8NDV3 1235 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-201ENST00000366391 TBC1D16Q8TBP0 767 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-201ENST00000366391 WASHC4Q2M389 1173 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-201ENST00000366391 FAM161AQ3B820 660 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-201ENST00000366391 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-201ENST00000366391 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-201ENST00000366391 FOXO4P98177 505 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5-201ENST00000366391 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5-201ENST00000366391 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5-201ENST00000366391 HACL1Q9UJ83 578 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5-201ENST00000366391 CEP350Q5VT06 3117 aa23.39■■□□□ 1.34
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
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