RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355765.10

PRPF39-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRPF39, Length 2,868 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-201ENST00000355765 IFFO2Q5TF58 517 aa22.15■■□□□ 1.14
PRPF39-201ENST00000355765 RNF20Q5VTR2 975 aa22.15■■□□□ 1.14
PRPF39-201ENST00000355765 CAVIN2O95810 425 aa22.14■■□□□ 1.14
PRPF39-201ENST00000355765 PSMA5P28066 241 aa22.14■■□□□ 1.14
PRPF39-201ENST00000355765 SLC20A2Q08357 652 aa22.14■■□□□ 1.14
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PRPF39-201ENST00000355765 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.14■■□□□ 1.14
PRPF39-201ENST00000355765 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
PRPF39-201ENST00000355765 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
PRPF39-201ENST00000355765 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.14■■□□□ 1.13
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PRPF39-201ENST00000355765 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.14■■□□□ 1.13
PRPF39-201ENST00000355765 L2HGDHQ9H9P8 463 aa22.14■■□□□ 1.13
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PRPF39-201ENST00000355765 RPS6KB1P23443 525 aa22.13■■□□□ 1.13
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PRPF39-201ENST00000355765 MAP4K1Q92918 833 aa22.13■■□□□ 1.13
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PRPF39-201ENST00000355765 ST5P78524 1137 aa22.12■■□□□ 1.13
PRPF39-201ENST00000355765 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
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PRPF39-201ENST00000355765 HOMER1Q86YM7 354 aa22.11■■□□□ 1.13
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PRPF39-201ENST00000355765 EVI5LQ96CN4 794 aa22.1■■□□□ 1.13
PRPF39-201ENST00000355765 EPC1Q9H2F5 836 aa22.1■■□□□ 1.13
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PRPF39-201ENST00000355765 ANXA1P04083 346 aa22.1■■□□□ 1.13
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PRPF39-201ENST00000355765 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.09■■□□□ 1.13
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PRPF39-201ENST00000355765 UBXN4Q92575 508 aa22.09■■□□□ 1.13
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PRPF39-201ENST00000355765 TEX35Q5T0J7 233 aa22.08■■□□□ 1.13
PRPF39-201ENST00000355765 EYA1Q99502 592 aa22.08■■□□□ 1.13
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PRPF39-201ENST00000355765 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PRPF39-201ENST00000355765 ZBTB9Q96C00 473 aa22.05■■□□□ 1.12
PRPF39-201ENST00000355765 USP28Q96RU2 1077 aa22.05■■□□□ 1.12
PRPF39-201ENST00000355765 METP08581 1390 aa22.05■■□□□ 1.12
PRPF39-201ENST00000355765 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PRPF39-201ENST00000355765 TPM4P67936 248 aa22.05■■□□□ 1.12
PRPF39-201ENST00000355765 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.05■■□□□ 1.12
PRPF39-201ENST00000355765 ACEP12821 1306 aa22.05■■□□□ 1.12
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