RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 SURF6O75683 361 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 CDHR2Q9BYE9 1310 aa7.45□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa7.45□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 SMIM5Q71RC9 77 aa7.45□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 CERS3Q8IU89 383 aa7.45□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 FAM89AQ96GI7 184 aa7.45□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 AK7Q96M32 723 aa7.45□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 ZNF652Q9Y2D9 606 aa7.45□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 RGL2O15211 777 aa7.44□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 CLEC4GQ6UXB4 293 aa7.44□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 PLA2G12BQ9BX93 195 aa7.44□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 VGLL3A8MV65 326 aa7.44□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 MSH5O43196 834 aa7.44□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 APBA3O96018 575 aa7.44□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 LMBR1LQ6UX01 489 aa7.44□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 AMIGO3Q86WK7 504 aa7.44□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 NARFQ9UHQ1 456 aa7.44□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 PLSCR1O15162 318 aa7.44□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 TXNRD1Q16881 649 aa7.44□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 PARP10Q53GL7 1025 aa7.44□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 SUSD4Q5VX71 490 aa7.44□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 FAM161AQ3B820 660 aa7.43□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa7.43□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 PROM2Q8N271 834 aa7.43□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 KIF1BPQ96EK5 621 aa7.43□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP7.43□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 ZPR1O75312 459 aa7.43□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 PHF14O94880 888 aa7.43□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 C8orf34Q49A92 452 aa7.43□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.43□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 SYNE4Q8N205 404 aa7.43□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.43□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 BACH2Q9BYV9 841 aa7.43□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 CHMP3Q9Y3E7 222 aa7.43□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP7.43□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 TRAPPC3LQ5T215 181 aa7.43□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 ERC1Q8IUD2 1116 aa7.43□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 BCL2L12Q9HB09 334 aa7.43□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 RRP9O43818 475 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 KLHDC4Q8TBB5 520 aa7.43□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 COPRSQ9NQ92 184 aa7.43□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 NTSR2O95665 410 aa7.42□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 CSF1RP07333 972 aa7.42□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 ADRA2BP18089 450 aa7.42□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 SIL1Q9H173 461 aa7.42□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 SALL3Q9BXA9 1300 aa7.42□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 FAM177BA6PVY3 158 aa7.42□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 RFC4P35249 363 aa7.42□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 TBC1D9BQ66K14 1250 aa7.42□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa7.42□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 PDE8AO60658 829 aa7.42□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 CTSWP56202 376 aa7.42□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 SH3TC1Q8TE82 1336 aa7.41□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 SASH1O94885 1247 aa7.41□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 SSFA2P28290 1259 aa7.41□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 BMP2KLQ5H9B9 411 aa7.41□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 TTC22Q5TAA0 569 aa7.41□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 OSBPL3Q9H4L5 887 aa7.41□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 MX1P20591 662 aa7.41□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 PDE1AP54750 535 aa7.41□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 BICDL1Q6ZP65 573 aa7.41□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 TTLL11Q8NHH1 800 aa7.41□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 CCDC57Q2TAC2 916 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 NUTM1Q86Y26 1132 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 AKT1S1Q96B36 256 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 SETDB2Q96T68 719 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 STAP2Q9UGK3 403 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 SPEF2Q9C093 1822 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 ZNF827Q17R98 1081 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 LRP5O75197 1615 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-201ENST00000341935 AOX1Q06278 1338 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-201ENST00000341935 ERFEQ4G0M1 354 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-201ENST00000341935 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
CCR6-201ENST00000341935 NYXQ9GZU5 481 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-201ENST00000341935 GREM2Q9H772 168 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-201ENST00000341935 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
CCR6-201ENST00000341935 CIAO1O76071 339 aa7.39□□□□□ -1.23
CCR6-201ENST00000341935 ITGA6P23229 1130 aa7.39□□□□□ -1.23
CCR6-201ENST00000341935 TFCP2Q12800 502 aa7.39□□□□□ -1.23
CCR6-201ENST00000341935 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CCR6-201ENST00000341935 ATG9AQ7Z3C6 839 aa7.39□□□□□ -1.23
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