RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 EFCAB13Q8IY85 973 aa5.83□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 KRT222Q8N1A0 295 aa5.83□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 CTNNA3Q9UI47 895 aa5.83□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 DIP2AQ14689 1571 aa5.83□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 TMCO5BA8MYB1 307 aa5.83□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 SH3BP5O60239 455 aa5.83□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 STK10O94804 968 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 AMPHP49418 695 aa5.83□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 NLRP6P59044 892 aa5.83□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 PSMD2Q13200 908 aa5.83□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 NFXL1Q6ZNB6 911 aa5.83□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 C10orf67Q8IYJ2 551 aa5.83□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 MORC4Q8TE76 937 aa5.83□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 PDLIM2Q96JY6 352 aa5.83□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 PHACTR3Q96KR7 559 aa5.83□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF446Q9NWS9 450 aa5.83□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 TTC21AQ8NDW8 1320 aa5.83□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 ADGRB2O60241 1585 aa5.82□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 CDKL5O76039 1030 aa5.82□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 IGHDP01880 384 aa5.82□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 NASPP49321 788 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 EIF5P55010 431 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 SYCP1Q15431 976 aa5.82□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 SULT6B1Q6IMI4 303 aa5.82□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 LRRC7Q96NW7 1537 aa5.82□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 PIK3R4Q99570 1358 aa5.82□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 DDX11L8A8MPP1 907 aa5.82□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 CAPN15O75808 1086 aa5.82□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 KLHL10Q6JEL2 608 aa5.82□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 FMNL3Q8IVF7 1028 aa5.82□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 AGBL1Q96MI9 1066 aa5.82□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 MON2Q7Z3U7 1717 aa5.82□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 CREB3O43889 395 aa5.82□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 RPS6KA3P51812 740 aa5.82□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 KCNV1Q6PIU1 500 aa5.82□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 SAMD3Q8N6K7 520 aa5.82□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa5.82□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 GAS2L2Q8NHY3 880 aa5.82□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 RETREG1Q9H6L5 497 aa5.82□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa5.82□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 TIMM44O43615 452 aa5.81□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 APLP1P51693 650 aa5.81□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 RABEP1Q15276 862 aa5.81□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 CCDC178Q5BJE1 867 aa5.81□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 SKAP1Q86WV1 359 aa5.81□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 ABTB2Q8N961 1025 aa5.81□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 TRIM66O15016 1216 aa5.81□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 KIF5CO60282 957 aa5.81□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 NAT2P11245 290 aa5.81□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 GNAI1P63096 354 aa5.81□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 ICA1Q05084 483 aa5.81□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 PDIA5Q14554 519 aa5.81□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 SYT10Q6XYQ8 523 aa5.81□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 TAX1BP1Q86VP1 789 aa5.81□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 GAS2L3Q86XJ1 694 aa5.81□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 MIEF2Q96C03 454 aa5.81□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 AKAP12Q02952 1782 aa5.81□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 ANKRD62A6NC57 917 aa5.8□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 CTIFO43310 598 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 VDRP11473 427 aa5.8□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 E2F4Q16254 413 aa5.8□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 ESCO1Q5FWF5 840 aa5.8□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 CCDC30Q5VVM6 783 aa5.8□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 ITPRIPQ8IWB1 547 aa5.8□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 SSH1Q8WYL5 1049 aa5.8□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 TSC1Q92574 1164 aa5.8□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 TEKT1Q969V4 418 aa5.8□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 JADE2Q9NQC1 790 aa5.8□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 FAM53CQ9NYF3 392 aa5.8□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 TMOD4Q9NZQ9 345 aa5.8□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 AKAP2Q9Y2D5 859 aa5.8□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa5.8□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa5.8□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 OVOS2Q6IE36 1432 aa5.8□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 UNCXA6NJT0 531 aa5.8□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 RLBP1P12271 317 aa5.8□□□□□ -1.48
CLVS1-201ENST00000325897 BDNFP23560 247 aa5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms